RG Microbial Ecology: Metabolism, Genomics & Evolution - Diversity, Ecogenomics & Holobionts - Microbiomas Foundation

Datos básicos
Año y mes de formación 2010 - 1
Departamento - Ciudad CUNDINAMARCA - CHÍA
Líder HOWARD JUNCA DIAZ
¿La información de este grupo se ha certificado? Si el día 2015-03-12 00:00:00.0
Página web http://www.microbiomas.org
E-mail info@howardjunca.com
Clasificación A
Área de conocimiento Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas
Programa nacional de ciencia y tecnología Biotecnología
Programa nacional de ciencia y tecnología (secundario) Ciencias del Mar y los Recursos Hidrobiológicos

Instituciones
1.- Investigación Y Biotecnología De Colombia - Corporación Corpogen - (No Avalado)
2.- Asociacion Fundacion de Investigacion Microbiomas - (Avalado)
3.- Compañía Campo Colombia SAS - (Avalado)

Plan Estratégico
Plan de trabajo: Ecología Microbiana - Metabolismo, Genómica & Evolución es un grupo de investigación que ha venido trabajando en la integración de trayectorias de investigadores y en el establecimiento conceptual, experimental y analítico, para el estudio, principalmente por métodos independientes de cultivo, de microorganismos y sus genomas en mezclas interactivas complejas (comunidades) que metabolizan, se adaptan y evolucionan según las presiones ambientales (microhábitats) en que se encuentran. Busca establecer las capacidades experimentales, bioinformáticas y de recursos humanos que permitan integrar y consolidar un grupo multidisciplinario de altísimo nivel científico, evidenciado en reconocimiento y producción en los medios internacionales especializados, y en la consecución de recursos, con la movilidad de investigadores, con los convenios y proyectos nacionales e internacionales, para lograr vínculos y colaboraciones con los mejores centros de investigación en temas afines de microbiología ambiental y biotecnología.
Estado del arte: El mundo se encuentra en la transición hacia la exploración basada en estrategias ómicas. Contamos con la competencia, conocimiento y experiencia en las técnicas más avanzadas de exploración metagenómica que se han implementado localmente y son un valor agregado al potencial y a la capacidad intrínseca del país para investigación.
Objetivos: Hacemos investigación y bioprospección de la diversidad microbiana en múltiples ecosistemas terrestres y acuáticos del planeta, por medio de tecnologías de vanguardia en ecología microbiana, códigos de barras de ADN, metagenómica funcional, bioquímica, filogenia molecular y microbiología ambiental, generando conocimiento básico y aplicado para: ¿ Mejores y más avanzadas descripciones y estimulaciones de procesos de biorremediación ambiental. ¿ Más precisa y adecuada categorización de especies biológicas y de estructuras de comunidades en variados ambientes (micro, macroorganismos y asociaciones hologenómicas) de acuerdo a los consensos y tecnologías disponibles de última generación. ¿ Generación de nuevos productos, metabolitos o sustratos con potencial farmacéutico o industrial. ¿ Descubrimiento de nuevos catalizadores biotecnológicos y para la determinación de los programas genéticos que originan compuestos con bioactividades relevantes para la salud humana, para la recuperación de ambientes y para procesos de manufactura más eficientes.
Retos: Lograr una financiación estable y que ayude a la sostenibilidad del centro para poder llevar a cabo los objetivos de investigación propuestos.
Visión: Tenemos una convicción por trabajar prioritariamente en proyectos científicos que ulteriormente promuevan un uso sostenible, justo, racional, responsable e inteligente de nuestros recursos, y un compromiso por realizar investigación que favorezca el desarrollo de la ciencias ómicas en nuestro país, reforzando y apoyando los programas y políticas nacionales que sean destinadas a incentivarlas de forma sostenida y organizada, lo cual permite la obtención de resultados científicos y tecnológicos significativos y perdurables como un paso para transformar nuestra sociedad hacia el conocimiento. En ese esfuerzo, nos concentramos en formar y entrenar nuevos investigadores de alto nivel y capacidad, bajo estándares que buscan impacto científico y competitividad internacional, y a la vez atendiendo necesidades locales presentes y futuras desde nuestras competencias de investigación, contribuyendo así a expandir una visión científica, coherente, colaborativa, recíproca y abierta con los investigadores, estudiantes y comunidades interesadas en esta iniciativa y témáticas

Líneas de investigación declaradas por el grupo
1.- Bioprospección de microhábitats con tamizajes de librerías metagenómicas
2.- Implementación de tecnologías ómicas para el estudio de comunidades microbianas
3.- Reconstrucción metabólica en comunidades microbianas

Sectores de aplicación

Integrantes del grupo
Nombre Vinculación Horas dedicación Inicio - Fin Vinculación
1.- HOWARD JUNCA DIAZ Integrante 20 2010/3 - Actual
2.- ERIKA JOHANNA GARCIA BONILLA Integrante 10 2012/2 - Actual
3.- JOSE RICARDO BUSTOS MOLINA Integrante 10 2011/8 - 2013/6
4.- KATERINE CARRILLO CASTRO Integrante 30 2010/10 - 2012/12
5.- MARTHA LUCIA CEPEDA HERNANDEZ Integrante 20 2010/8 - 2012/12
6.- ALVARO MAURICIO FLOREZ ESCOBAR Integrante 8 2017/1 - Actual
7.- ERIC JUAN CARLOS GALVEZ BOBADILLA Integrante 30 2011/1 - 2013/10
8.- ALVARO MONGUI CRUZ Integrante 40 2010/6 - 2014/7
9.- CESAR AUGUSTO OSORIO FORERO Integrante 10 2010/3 - 2012/9
10.- LUIS ALBERTO PENA ORTIZ Integrante 6 2012/1 - 2013/4
11.- FRANCY JOHANNA PEREZ LLANOS Integrante 20 2012/1 - 2013/8
12.- LUISA MARCELA VILLAMIL DIAZ Integrante 2 2016/1 - Actual
13.- SONIA MARCELA VILLEGAS PLAZAS Integrante 40 2012/4 - Actual

Los ítems de producción con la marca corresponden a productos avalados y validados para la última Convocatoria Nacional para el Reconocimiento y Medición de Grupos de Investigación, Desarrollo Tecnológico o de Innovación y para el Reconocimiento de Investigadores del SNCTeI
PRODUCCIÓN BIBLIOGRÁFICA

Artículos publicados
1.- Publicado en revista especializada: Comparative Assessment of Mediterranean Gorgonian-Associated Microbial Communities Reveals Conserved Core and Locally Variant Bacteria
Estados Unidos, Microbial Ecology ISSN: 1432-184X, 2017 vol:73 fasc: 2 págs: 466 - 478, DOI:10.1007/s00248-016-0858-x
Autores: JEROEN AJM VAN DER WATER, COAUTHORS ID, HOWARD JUNCA DIAZ, ET AL, CHRISTINE FERRIER PAGES,
2.- Corto (Resumen): Draft Genome Sequence of Bacillus licheniformis CG-B52, a Highly Virulent Bacterium of Pacific White Shrimp (Litopenaeus vannamei), Isolated from a Colombian Caribbean Aquaculture Outbreak.
Estados Unidos, GENOME ANNOUNCEMENTS ISSN: 2169-8287, 2016 vol:4 fasc: 3 págs: 316 - 321, DOI:10.1128/genomeA.00321-16
Autores: ERIC JC GALVEZ, ET AL, COAUTHORS ID, DIETMAR H PIEPER, HOWARD JUNCA DIAZ,
3.- Revisión (Survey): Voices of biotech
Estados Unidos, Nature Biotechnology ISSN: 1087-0156, 2016 vol:34 fasc: 3 págs: 270 - 275, DOI:10.1038/nbt.3502
Autores: INVESTIGADORES SOCIOS DEL CONSORCIO, HOWARD JUNCA DIAZ,
4.- Publicado en revista especializada: Spirochaetes dominate the microbial community associated with the red coral Corallium rubrum on a broad geographic scale.
Reino Unido, Scientific Reports ISSN: 2045-2322, 2016 vol:6 fasc: 6 págs: 1 - 7, DOI:10.1038/srep27277
Autores: JEROEN AJM VAN DER WATER, INVESTIGADORES SOCIOS DEL CONSORCIO, HOWARD JUNCA DIAZ,
5.- Publicado en revista especializada: Microbial Toluene Removal in Hypoxic Model Constructed Wetlands Occurs Predominantly via the Ring Monooxygenation Pathway
Estados Unidos, Applied And Environmental Microbiology ISSN: 1098-5336, 2015 vol:81 fasc: 18 págs: 6241 - 6252, DOI:10.1128/AEM.01822-15
Autores: PAULA MARTINEZ LAVANCHY, RAMIRO VILCHEZ-VARGAS, DIETMAR H PIEPER, HOWARD JUNCA DIAZ, ET AL, INVESTIGADORES SOCIOS DEL CONSORCIO, HERMANN J HEIPIEPER,
6.- Publicado en revista especializada: Development of a genetic tool for functional screening of anti-malarial bioactive extracts in metagenomic libraries
Suiza, Malaria J ISSN: 1475-2875, 2015 vol:14 fasc: 233 págs: 1 - 6, DOI:10.1186/s12936-015-0748-6
Autores: ALVARO MONGUI CRUZ, PATRICIA DEL PORTILLO, FRANCY PEREZ, MARIA M ZAMBRANO, CARMEN FERNANDEZ, SILVIA RESTREPO RESTREPO, HERNANDO DEL PORTILLO OBANDO, HOWARD JUNCA DIAZ,
7.- Publicado en revista especializada: Distinct composition signatures of archaeal and bacterial phylotypes in the Wanda Glacier forefield, Antarctic Peninsula
Inglaterra, Fems Microbiology Ecology ISSN: 0168-6496, 2015 vol:91 fasc: 1 págs: 1 - 9, DOI:10.1093/femsec/fiu005
Autores: IGOR S PESSI, CESAR OSORIO-FORERO, ERIC JC GALVEZ, FELIPE L SIMOES, JEFFERSON C SIMOES, HOWARD JUNCA DIAZ, ALEXANDRE J MACEDO,
8.- Publicado en revista especializada: AromaDeg, a novel database for phylogenomics of aerobic bacterial degradation of aromatics
Inglaterra, Database : The Journal Of Biological Databases And Curation ISSN: 1758-0463, 2014 vol:2014 fasc: págs: 1 - 12, DOI:10.1093/database/bau118
Autores: MARCIA DUARTE, RUY JAUREGUI, RAMIRO VILCHEZ-VARGAS, HOWARD JUNCA DIAZ, DIETMAR H PIEPER,
9.- Publicado en revista especializada: Neotropical Andes hot springs harbor diverse and distinct planktonic microbial communities
Estados Unidos, Fems Microbiology Ecology ISSN: 0168-6496, 2014 vol:89 fasc: 1 págs: 56 - 66, DOI:10.1111/1574-6941.12333
Autores: LUISA DELGADO-SERRANO, GINA PILAR LOPEZ RAMIREZ, LAURA BOHORQUEZ, JOSE RICARDO BUSTOS MOLINA, CAROLINA RUBIANO LABRADOR, CESAR OSORIO-FORERO, HOWARD JUNCA DIAZ, SANDRA BAENA, MARIA M ZAMBRANO, LUISA FERNANDA DELGADO SERRANO,
10.- Publicado en revista especializada: Editorial Overview: Environmental Biotechnology
Países Bajos, Current Opinion In Biotechnology ISSN: 0958-1669, 2014 vol:27 fasc: págs: vii - ix, DOI:10.1016/j.copbio.2014.04.002
Autores: HAUKE HARMS, HOWARD JUNCA DIAZ,
11.- Publicado en revista especializada: Genome analysis and physiological comparison of Alicycliphilus denitrificans strains BC and K601(T.)
Estados Unidos, Plos One     ISSN: 1932-6203, 2013 vol:8 fasc: 6 págs: e66971 - e66971-10, DOI:10.1371/journal.pone.0066971
Autores: MARGREET J OOSTERKAMP, TEUN VEUSKENS, INVESTIGADORES SOCIOS DEL CONSORCIO, HOWARD JUNCA DIAZ, DIETMAR H PIEPER, INVESTIGADORES SOCIOS DEL PROYECTO, CAROLINE M PLUGGE, ALFONS JM STAMS,
12.- Publicado en revista especializada: Analysis of the microbial gene landscape and transcriptome for aromatic pollutants and alkane degradation using a novel internally calibrated microarray system
Reino Unido, Environmental Microbiology ISSN: 1462-2912, 2013 vol:4 fasc: 15 págs: 1016 - 1039, DOI:10.1111/j.1462-2920.2012.02752
Autores: RAMIRO VILCHEZ-VARGAS, INVESTIGADORES SOCIOS DEL CONSORCIO, HOWARD JUNCA DIAZ, DIETMAR H PIEPER,
13.- Publicado en revista especializada: Structural and functional insights from the metagenome of an acidic hot spring microbial planktonic community in the Colombian Andes
Estados Unidos, Plos One     ISSN: 1932-6203, 2012 vol:12 fasc: 12 págs: e52069 - , DOI:10.1371/journal.pone.0052069
Autores: DIEGO J JIMENEZ, INVESTIGADORES SOCIOS DEL CONSORCIO, HOWARD JUNCA DIAZ, MARIA M ZAMBRANO, SANDRA BAENA,
14.- Publicado en revista especializada: In-depth characterization via complementing culture-independent approaches of the microbial community in an acidic hot spring of the Colombian Andes
Estados Unidos, Microbial Ecology ISSN: 0095-3628, 2012 vol:63 fasc: 1 págs: 103 - , DOI:
Autores: LAURA BOHORQUEZ, LUISA DELGADO-SERRANO, CESAR OSORIO-FORERO, HOWARD JUNCA DIAZ, SANDRA BAENA, MARIA M ZAMBRANO,
15.- Publicado en revista especializada: Evaluating a nested-PCR assay for detecting Streptococcus agalactiae in red tilapia (Oreochromis sp.) tissue
Países Bajos, Aquaculture ISSN: 0044-8486, 2011 vol:320 fasc: 3 págs: 341 - 346, DOI:
Autores: ANGELA JIMENEZ, VICTOR TIBATA, HOWARD JUNCA DIAZ, FERNANDO ARIZA, NOEL VERJAN, VICTOR MANUEL TIBATA RODRIGUEZ, CARLOS IREGUI, MANUEL FERNANDO ARIZA BOTERO, CARLOS ARTURO IREGUI CASTRO, ANGELA PATRICIA JIMENEZ LEANO,
16.- Publicado en revista especializada: Genome sequences of Alicycliphilus denitrificans strain BC and K601T
Estados Unidos, Journal Of Bacteriology ISSN: 1098-5530, 2011 vol:193 fasc: 18 págs: 5028 - , DOI:
Autores: MARGREET J OOSTERKAMP, TEUN VEUSKENS, CAROLINE M PLUGGE, ALETTE AM LANGENHOFF, HOWARD JUNCA DIAZ, ALFONS JM STAMS,
17.- Publicado en revista especializada: Molinate hydrolase from Gulosibacter molinativorax ON4T - a novel cobalt dependent amidohydrolase
Estados Unidos, Journal Of Bacteriology ISSN: 0021-9193, 2011 vol:194 fasc: 20 págs: 6348 - 6355, DOI:
Autores: MARCIA DUARTE, FREDERICO FERREIRA-DA-SILVA, HEINRICH LÜNDSDORF, HOWARD JUNCA DIAZ, LUIS GALES, DIETMAR H PIEPER, OLGA C NUNES,
18.- Publicado en revista especializada: Metabolic networks, microbial ecology and 'omics' technologies: towards understanding in situ biodegradation processes
Inglaterra, Environmental Microbiology ISSN: 1462-2920, 2010 vol:12 fasc: 12 págs: 3089 - 3104, DOI:
Autores: RAMIRO VILCHEZ-VARGAS, HOWARD JUNCA DIAZ, DIETMAR H PIEPER,
19.- Publicado en revista especializada: Mangrove microniches determine the structural and functional diversity of enriched petroleum hydrocarbon-degrading consortia
Países Bajos, Fems Microbiology Ecology ISSN: 1574-6941, 2010 vol:74 fasc: 2 págs: 276 - 290, DOI:
Autores: NEWTON CM GOMES, CECILIA G FLOCCO, RODRIGO COSTA, HOWARD JUNCA DIAZ, RAMIRO VILCHEZ-VARGAS, DIETMAR H PIEPER, ELLEN KROGERRECKLENFORT, RODOLFO PARANHOS, LEDA CS MENDOCA-HAGLER, KORNELIA SMALLA,
20.- Publicado en revista especializada: Characterization of a gene cluster involved in 4-chlorocatechol degradation by Pseudomonas reinekei MT1.
Estados Unidos, Journal Of Bacteriology ISSN: 0021-9193, 2009 vol:N/A fasc: N/A págs: N/A - , DOI:
Autores: BEATRIZ CAMARA, PATRICIA NIKODEM, PIOTR BIELECKI, ROBERTO BOBADILLA, HOWARD JUNCA DIAZ, DIETMAR H PIEPER,
21.- Publicado en revista especializada: Enhancement of the microbial community biomass and diversity during air sparging bioremediation of a soil highly contaminated with kerosene and BTEX.
Estados Unidos, Applied Microbiology And Biotechnology ISSN: 1432-0614, 2009 vol:82 fasc: 3 págs: 565 - 577, DOI:
Autores: NADIA KABELITZ, JIRINA MACHACKOVA, GWENAEL IMFELD, MARIA BRENNEROVA, DIETMAR H PIEPER, HERMANN J HEIPIEPER, HOWARD JUNCA DIAZ,
22.- Publicado en revista especializada: Metagenomics reveals diversity and abundance of meta-cleavage pathways in microbial communities from soil highly contaminated with jet fuel under air-sparging bioremediation.
Inglaterra, Environmental Microbiology ISSN: 1462-2912, 2009 vol:N/A fasc: N/A págs: N/A - , DOI:
Autores: MARIA BRENNEROVA, JIRINA JOSEFIOVA, VLADIMIR BRENNER, DIETMAR H PIEPER, HOWARD JUNCA DIAZ,
23.- Publicado en revista especializada: Isolation and characterization of Alicycliphilus denitrificans strain BC that grows on benzene with chlorate as electron acceptor.
Estados Unidos, Applied And Environmental Microbiology ISSN: 0099-2240, 2008 vol:74 fasc: págs: 6672 - 6681, DOI:10.1128/AEM.00835-08
Autores: SANDER AB WEELINK, NICO CG TAN, HARM TEN BROEKE, CORNE VAN DEN KIEBOOM, WIM VAN DOESBURG, ALETTE AM LANGENHOFF, JAN GERRITSE, HOWARD JUNCA DIAZ, ALFONS JM STAMS,
24.- Publicado en revista especializada: trans-Dienelactone hydrolase from Pseudomonas reinekei MT1, a novel zinc-dependent hydrolase
Reino Unido, Biochemical And Biophysical Research Communications ISSN: 0006-291X, 2008 vol: fasc: págs: - , DOI:
Autores: BEATRIZ CAMARA, MACARENA MARIN, MICHAEL SCHLOMANN, HANS -J HECHT, HOWARD JUNCA DIAZ, DIETMAR H PIEPER,

Libros publicados

Capítulos de libro publicados
1.- Capítulo de libro : Microbial degradation of aliphatic and aromatic hydrocarbons with (per)chlorate as electron acceptor-
Estados Unidos, 2010, Handbook Of Hydrocarbon And Lipid Microbiology, ISBN: 978-3-540-77588-1, Vol. , págs:2113 - , Ed. Springer Verlag Berlin Heidelberg
Autores: HOWARD JUNCA DIAZ,
2.- Capítulo de libro : Microbial degradation of aliphatic and aromatic hydrocarbons with (per)chlorate as electron acceptor.
Estados Unidos, 2010, Handbook Of Hydrocarbon And Lipid Microbiology, ISBN: 978-3-540-77588-1, Vol. , págs:936 - , Ed. Springer Verlag Berlin Heidelberg
Autores: HOWARD JUNCA DIAZ,
3.- Capítulo de libro : Phylogenomics of aerobic bacterial degradation of aromatics.
Estados Unidos, 2010, Handbook Of Hydrocarbon And Lipid Microbiology, ISBN: 978-3-540-77588-1, Vol. , págs:1356 - , Ed. Springer Verlag Berlin Heidelberg
Autores: HOWARD JUNCA DIAZ,
4.- Capítulo de libro : Functional marker gene assays for hydrocarbon degrading microbial communities - aerobic.
Estados Unidos, 2010, Handbook Of Hydrocarbon And Lipid Microbiology, ISBN: 978-3-540-77588-1, Vol. , págs:4291 - , Ed. Springer Verlag Berlin Heidelberg
Autores: HOWARD JUNCA DIAZ, DIETMAR H PIEPER,
5.- Otro capítulo de libro publicado : Beyond Metagenomics: Integration of Complementary Approaches for the Study of Microbial Communities.
Inglaterra, 2010, Metagenomics: Theory, Methods, And Applications, ISBN: 978-1-904455-54-7, Vol. , págs:15 - , Ed.
Autores: ANDRES CUBILLOS RUIZ, HOWARD JUNCA DIAZ, MARIA M ZAMBRANO,

Documentos de trabajo

Otra publicación divulgativa

Otros artículos publicados

Otros Libros publicados

Traducciones

PRODUCCIÓN TÉCNICA Y TECNOLÓGICA

Cartas, mapas o similares

Consultorías científico tecnológicas e Informes técnicos

Diseños industriales

Esquemas de trazados de circuito integrado

Innovaciones en Procesos y Procedimientos
1.- Innovación de proceso o procedimiento : Extracción de ADN metagenomico a partir de esponjas marinas compatible con construcciones de librerías metagenómicas con insertos de alto peso molecular y para secuenciación de hologenoma total
Colombia, 2011, Disponibilidad: Restringido, Institución financiadora: Investigación Y Biotecnología De Colombia - Corporación Corpogen
Autores: CESAR OSORIO-FORERO, HOWARD JUNCA DIAZ,
2.- Innovación de proceso o procedimiento : Barcode design for in-depth analyses of microbial communities in an adapted setting for Illumina sequencing
Colombia, 2011, Disponibilidad: Restringido, Institución financiadora: Investigación Y Biotecnología De Colombia - Corporación Corpogen
Autores: ERIC JC GALVEZ, KATERINE CARRILLO CASTRO, HOWARD JUNCA DIAZ,
3.- Innovación de proceso o procedimiento : Condiciones óptimas de detección con el sustrato de luciferasa (bioluminiscencia) de las cepas de Plasmodium falciparum 3D7 y Luc, para el lector de microplacas Tecan Genios
Colombia, 2010, Disponibilidad: Restringido, Institución financiadora: Investigación Y Biotecnología De Colombia - Corporación Corpogen
Autores: ALVARO MONGUI CRUZ, FRANCY PEREZ, HOWARD JUNCA DIAZ,
4.- Innovación de proceso o procedimiento : Condiciones óptimas del cultivo in vitro de la cepa 3D7 de Plasmodium falciparum en cajas de 96 pozos opacas blancas y negras, a 1% de hematocrito, 1% de parasitemia y a volumen final de 130 microlitros
Colombia, 2010, Disponibilidad: Restringido, Institución financiadora: Investigación Y Biotecnología De Colombia - Corporación Corpogen
Autores: ALVARO MONGUI CRUZ, FRANCY PEREZ, HOWARD JUNCA DIAZ,
5.- Innovación de proceso o procedimiento : Diseño de modificación genética para 3 clones metagenómicos previamente secuenciados, con el fin de poder emplearlos como controles positivos de actividad antimalárica por su expresión recombinante del péptido AdDLP
Colombia, 2010, Disponibilidad: Restringido, Institución financiadora: Investigación Y Biotecnología De Colombia - Corporación Corpogen
Autores: HOWARD JUNCA DIAZ, ALVARO MONGUI CRUZ,
6.- Innovación de proceso o procedimiento : Condiciones óptimas de detección con SYBR Green (fluorescencia) de las cepas de Plasmodium falciparum 3D7 y Luc, para el lector de microplacas Tecan Genios
Colombia, 2010, Disponibilidad: Restringido, Institución financiadora: Investigación Y Biotecnología De Colombia - Corporación Corpogen
Autores: ALVARO MONGUI CRUZ, FRANCY PEREZ, HOWARD JUNCA DIAZ,
7.- Innovación de proceso o procedimiento : Construcción del clon bacteriano E. coli pGEX_3X-AdDLP, con la capacidad de expresar de forma recombinante el péptido antimalárico AdDLP unido a un tag de GST
Colombia, 2010, Disponibilidad: Restringido, Institución financiadora: Investigación Y Biotecnología De Colombia - Corporación Corpogen
Autores: HOWARD JUNCA DIAZ, ALVARO MONGUI CRUZ,
8.- Innovación de proceso o procedimiento : Condiciones óptimas del cultivo in vitro de la cepa Luc de Plasmodium falciparum en cajas de 96 pozos opacas blancas y negras, a 1% de hematocrito, 1% de parasitemia y a volumen final de 130 microlitros
Colombia, 2010, Disponibilidad: Restringido, Institución financiadora: Investigación Y Biotecnología De Colombia - Corporación Corpogen
Autores: ALVARO MONGUI CRUZ, FRANCY PEREZ, HOWARD JUNCA DIAZ,
9.- Innovación de proceso o procedimiento : Extracción de DNA total de Esponjas Marinas mediante modificaciones al kit PowerSoil de MoBio, para aplicación en PCR de fragmentos cortos
Colombia, 2010, Disponibilidad: Restringido, Institución financiadora: Investigación Y Biotecnología De Colombia - Corporación Corpogen
Autores: MARTHA L CEPEDA, HOWARD JUNCA DIAZ,
10.- Innovación de proceso o procedimiento : Total RNA Isolation Tested with soils (Andean histosols) and marine sediments (Cartagena Bay mud)
Colombia, 2010, Disponibilidad: Restringido, Institución financiadora: Investigación Y Biotecnología De Colombia - Corporación Corpogen
Autores: KATERINE CARRILLO CASTRO, ERIC JC GALVEZ, HOWARD JUNCA DIAZ,
11.- Innovación de proceso o procedimiento : Total RNA Isolation from fish gut microflora
Colombia, 2010, Disponibilidad: Restringido, Institución financiadora: Investigación Y Biotecnología De Colombia - Corporación Corpogen
Autores: ERIC JC GALVEZ, KATERINE CARRILLO CASTRO, HOWARD JUNCA DIAZ,
12.- Innovación de proceso o procedimiento : Diseño del gen sintético codificante del péptido antimalárico AdDLP, empleando optimización del uso de codones del gen para la cepa K12 de E. coli, la adición corriente arriba de una región promotora inducible con arabinosa, un sitio de unión al ribosoma y corriente abajo la incorporación de un MCS
Colombia, 2010, Disponibilidad: Restringido, Institución financiadora: Investigación Y Biotecnología De Colombia - Corporación Corpogen
Autores: HOWARD JUNCA DIAZ, ALVARO MONGUI CRUZ,
13.- Innovación de proceso o procedimiento : Diseño de un transposon MU para facilitar la expresión funcional de clones metagenómicos, con base en la inclusión de un gen de resistencia a kanamicina y 2 promotores inducibles T7, a partir de amplificaciones por PCR del plásmido pKD4 y de oligonucleótidos largos sobrelapados
Colombia, 2010, Disponibilidad: Restringido, Institución financiadora: Investigación Y Biotecnología De Colombia - Corporación Corpogen
Autores: ALVARO MONGUI CRUZ, HOWARD JUNCA DIAZ,
14.- Innovación de proceso o procedimiento : Sistema para la generación de amplicones de amplio cubrimiento en diversidad para resolver regiones hipervariables de alta resolucion taxonomica del gen 16S ARN compatible con pirosecuenciación
Colombia, 2010, Disponibilidad: Restringido, Institución financiadora: Investigación Y Biotecnología De Colombia - Corporación Corpogen
Autores: CESAR OSORIO-FORERO, HOWARD JUNCA DIAZ,
15.- Innovación de proceso o procedimiento : Sistema para describir composición eucariótica en muestras complejas por DNA barcoding (Citocromo C Oxidasa I y Regiones hipervariables de 18S) acoplado a pirosecuenciación
Colombia, 2010, Disponibilidad: Restringido, Institución financiadora: Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación, Colciencias
Autores: CESAR OSORIO-FORERO, MARIA M ZAMBRANO, HOWARD JUNCA DIAZ,

Innovaciones generadas en la Gestión Empresarial

Nuevas variedades animal

Nuevas variedades vegetal

Plantas piloto

Otros productos tecnológicos
1.- Otro : Librería de fósmidos con insertos de 35 kb promedio provenientes de metagenomas microbianos asociados a esponja marina H. fulva.
Colombia, 2011, Disponibilidad: Restringido, Nombre comercial: Restringido. No disponible para la venta
Institución financiadora: Investigación Y Biotecnología De Colombia - Corporación Corpogen
Autores: CESAR OSORIO-FORERO, KATERINE CARRILLO CASTRO, ERIC JC GALVEZ, HOWARD JUNCA DIAZ,
2.- Otro : Construcción del clon bacteriano E. coli pET28-AdDLP, con la capacidad de expresar de forma recombinante el péptido antimalárico AdDLP unido a un tag de 6 histidinas
Colombia, 2010, Disponibilidad: Restringido, Nombre comercial: No a la venta
Institución financiadora: Investigación Y Biotecnología De Colombia - Corporación Corpogen
Autores: HOWARD JUNCA DIAZ, ALVARO MONGUI CRUZ,
3.- Otro : Base de datos de secuencias curadas correspondientes a 14 familias catabólicas relacionadas con la biodegradación de compuestos xenobióticos
Colombia, 2010, Disponibilidad: Restringido, Nombre comercial: No destinado a venta
Institución financiadora: Investigación Y Biotecnología De Colombia - Corporación Corpogen
Autores: HOWARD JUNCA DIAZ,

Prototipos

Regulaciones y Normas

Reglamentos técnicos

Guias de práctica clínica

Proyectos de ley

Signos distintivos


Softwares

Empresas de base tecnológica

APROPIACIÓN SOCIAL Y CIRCULACIÓN DEL CONOCIMIENTO

Ediciones
1.- Revista : Environmental Biotechnology
Reino Unido, 2014, Editorial: Elsevier Academic Press, Idiomas: Inglés, Páginas: 191
Autores: HOWARD JUNCA DIAZ,

Eventos Científicos
1.- Otro : XX ALAM 2014 Congreso Latinoamericano de Microbiología
CARTAGENA DE INDIAS, desde 2014-11-04 00:00:00.0 - hasta 2015-03-08 00:00:00.0
Ámbito: Internacional, Tipos de participación: Compilador de memorias , Organizador , Ponente

Instituciones asociadas
  • Nombre de la institución: Asociación Latinoamericana de Microbiología Tipo de vinculación Gestionadora
2.- Congreso : XX Congreso Latinoamericano de Microbiología ALAM2010 (XX Congress of the Latin-American Association for Microbiology ALAM)
Montevideo, desde 2010-01-01 00:00:00.0 - hasta
Ámbito: Internacional, Tipos de participación: Organizador

Instituciones asociadas
  • Nombre de la institución: Asociación Latinoamericana de Microbiología Tipo de vinculación Patrocinadora

Informes de investigación

Redes de Conocimiento Especializado

Generación de Contenido Impreso

Generación de Contenido Multimedia

Generación de Contenido Virtual

Estrategias de Comunicación del Conocimiento

Estrategias Pedagógicas para el fomento a la CTI

Espacios de Participación Ciudadana

Participación Ciudadana en Proyectos de CTI

Producción en arte, arquitectura y diseño
Obras o productos
Industrias creativas y culturales
Eventos Artísticos
Talleres de Creación

ACTIVIDADES DE FORMACIÓN

Asesorías al Programa Ondas

Curso de Corta Duración Dictados

Trabajos dirigidos/turorías
1.- Trabajo de grado de maestría o especialidad médica : Metagenomic insights of the microbial community and the hydrocarbon catabolomic potential retrieved from marine sponge holobiont systems
Desde 1 2012 hasta Noviembre 2013, Tipo de orientación: Tutor principal
Nombre del estudiante: Sonia Marcela Villegas Plazas, Programa académico: Maestría en CIencias Biológicas
Número de páginas: 0, Valoración: Aprobada, Institución: Universidad De Los Andes - Uniandes
Autores: HOWARD JUNCA DIAZ,
2.- Trabajo de grado de maestría o especialidad médica : Desarrollo de un control con actividad antimalárica para la validación de una plataforma de tamizaje metagenómico
Desde 1 2011 hasta Noviembre 2013, Tipo de orientación: Tutor principal
Nombre del estudiante: Francy Johanna Perez Llanos, Programa académico: Maestría en CIencias Biológicas
Número de páginas: 0, Valoración: Aprobada, Institución: Universidad De Los Andes - Uniandes
Autores: HOWARD JUNCA DIAZ,
3.- Tesis de doctorado : Genetic strategies for improving functional expression of metagenomic libraries and its application in the establishment of a customized platform to screen novel antimalarial compounds
Desde 4 2010 hasta Enero 2014, Tipo de orientación: Tutor principal
Nombre del estudiante: Álvaro Monguí Cruz, Programa académico: Doctorado en Ciencias Biológicas
Número de páginas: 0, Valoración: Aprobada, Institución: Universidad De Los Andes - Uniandes
Autores: HOWARD JUNCA DIAZ,
4.- Trabajo de grado de maestría o especialidad médica : Caracterizacion de la estructura taxonómica microbiana y del metatranscriptoma asociado a la degradación de PAH en sedimentos marinos contaminados
Desde 1 2010 hasta Abril 2012, Tipo de orientación: Tutor principal
Nombre del estudiante: Eric JC Galvez, Programa académico: Maestría en CIencias Biológicas
Número de páginas: 0, Valoración: Aprobada, Institución: Universidad De Los Andes - Uniandes
Autores: HOWARD JUNCA DIAZ,

ACTIVIDADES COMO EVALUADOR

Jurado/Comisiones evaluadoras de trabajo de grado
1.- Maestría : Búsqueda de genes codificadores de enzimas lipolíticas en una biblioteca metagenómica de suelo de bosque alto andino colombiano
Colombia, 2010, Idioma: Español, Medio de divulgación: Papel
Sitio web: , Nombre del orientado: Diego Javier Jiménex Avella
Programa académico: Magister en Ciencias Biológicas, Institución: Pontificia Universidad Javeriana - Puj - Sede Bogotá.
Autores: HOWARD JUNCA DIAZ,
2.- Doctorado : Comunidades Microbianas Asociadas a Prácticas Agrícolas y Usos del Suelo de la Vereda El Bosque - Parque Nacional Natural de los Nevados
Colombia, 2010, Idioma: Español, Medio de divulgación: Papel
Sitio web: , Nombre del orientado: Lizeth Manuela Avellaneda Torres
Programa académico: Doctorado en Agroecología, Institución: Universidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá.
Autores: HOWARD JUNCA DIAZ,
3.- Maestría : ¿Recuperación y evaluación de la capacidad degradadora de consorcios bacterianos aislados de ambientes impactados con TNT y PETN¿
Colombia, 2010, Idioma: Español, Medio de divulgación: Papel
Sitio web: , Nombre del orientado: Erika Johanna García Bonilla
Programa académico: Maestría Interfacultades en Microbiología, Institución: Universidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá.
Autores: HOWARD JUNCA DIAZ,
4.- Maestría : Anotación y caracterización del genoma de Xanthomonas axonopodis pv. manihotis mediante el uso de herramientas bioinformáticas y genómica comparativa
Colombia, 2010, Idioma: Español, Medio de divulgación: Papel
Sitio web: , Nombre del orientado: Mario Luis Arrieta Ortiz
Programa académico: Microbiología, Institución: Universidad De Los Andes - Uniandes.
Autores: HOWARD JUNCA DIAZ,
5.- Doctorado : ¿Biodegradation of atrazine in Colombian agricultural soils: A case study for pesticide degradation in the tropic¿
Colombia, 2009, Idioma: Español, Medio de divulgación: Papel
Sitio web: , Nombre del orientado: Ziv Arbeli
Programa académico: Doctorado en Agronomía, Institución: Universidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá.
Autores: HOWARD JUNCA DIAZ,
6.- Doctorado : Caracterización de Actividad Microbiana Edáfica Responsable de la Dinámica del Nitrógeno y Fósforo en Cultivos Orgánicos y Convencionales de Papa Criolla (Solanum phureja)
Colombia, 2009, Idioma: Español, Medio de divulgación: Papel
Sitio web: , Nombre del orientado:
Programa académico: Doctorado en Biotecnología, Institución: Universidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá.
Autores: HOWARD JUNCA DIAZ,

Participación en comités de evaluación
1.- Otra : Evaluador de propuesta de proyecto Programa Nacional de Ciencias Básicas - Colciencias
Colombia, 2010, Sitio web:
Medio de divulgación: Papel, Institución:
Autores: HOWARD JUNCA DIAZ,
2.- Otra : Evaluador de propuesta de proyecto al Programa Nacional de Ciencia y Tecnologías Agropecuarias - Colciencias
Colombia, 2010, Sitio web:
Medio de divulgación: Papel, Institución:
Autores: HOWARD JUNCA DIAZ,
3.- Otra : Evaluador de propuesta de proyecto de investigación - Programa Nacional de Ciencias del Medio Ambiente y Hábitat- Colciencias
Colombia, 2010, Sitio web:
Medio de divulgación: Papel, Institución:
Autores: HOWARD JUNCA DIAZ,
4.- Otra : Evaluador de propuesta de proyecto de investigación - Programa Nacional de Ciencias del Medio Ambiente y Hábitat- Colciencias
Colombia, 2010, Sitio web:
Medio de divulgación: Papel, Institución:
Autores: HOWARD JUNCA DIAZ,
5.- Otra : Evaluador de propuesta de proyecto de investigación - Programa Nacional de Ciencias del Medio Ambiente y Hábitat- Colciencias
Colombia, 2010, Sitio web:
Medio de divulgación: Papel, Institución:
Autores: HOWARD JUNCA DIAZ,
6.- Otra : Revisor científico de manuscrito enviado para ser considerado para publicación en Environmental Microbiology ISSN: 1462-2920
Inglaterra, 2010, Sitio web:
Medio de divulgación: Papel, Institución: Society for Applied Microbiology UK
Autores: HOWARD JUNCA DIAZ,
7.- Otra : Revisor científico para manuscrito sometido a revista internacional indexada FEMS MIcrobiology Ecology Online ISSN: 1574-6941
Países Bajos, 2010, Sitio web:
Medio de divulgación: Internet, Institución:
Autores: HOWARD JUNCA DIAZ,

Demás trabajos
1.- Demás trabajos : Informe Joven Investigador COLCIENCIAS: Evaluación de la Actividad Antimalárica de Extractos Bacterianos Provenientes de Librerías Metagenómicas Expresando los Péptidos Antimaláricos Dermaseptin 4 y AdDLP.
Colombia, 2013, Idioma: Español, Medio de divulgación: Papel
Autores: FRANCY JOHANNA PEREZ LLANOS,

Proyectos
1.- Investigación y desarrollo: First DNA barcoding sampling survey of processed meat and fish derived-products commercialized in Bogota, Colombia: assessing the reliability of the marketed identity in meat food products for human consumption, their potential origins and related risks
2012/8 - Actual
2.- Investigación y desarrollo: Secuenciación y análisis del genoma del patógeno emergente Bacillus sp., cepa CENIACUA-CG01, responsable de brotes de mortalidades severas en produccciones de L. vannamei (camarón blanco)
2012/6 - 2012/12
3.- Investigación y desarrollo: MAGICPAH - Molecular Approaches and MetaGenomic Investigations for optimizing Clean-up of PAH contaminated sites www.magicpah.org
2010/4 - Actual
4.- Investigación y desarrollo: Platform for exploring antimalarial compounds in metagenomes / Plataforma de exploración de antimaláricos en metagenomas
2009/12 - Actual
5.- Investigación y desarrollo: Metagenomic exploration of the microbial communities associated to marine sponges: searching for the ancient and natural origin of the potential to generate/degrade halogenated aromatics
2009/12 - 2011/12
6.- Investigación, desarrollo e innovación: Proyecto de intercambio bilateral CorpoGen-Centro de Biotecnología UFRGS, Brasil-Colombia CNPq- Colciencias
2008/9 - 2011/12
7.- Investigación y desarrollo: Centro de Excelencia en Investigación Centro Colombiano de Genómica y Bioinformática de A,mbientes Extremos - GeBiX
2008/2 - Actual