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JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, Producción del antígeno recombinante TES30 de Toxocara canis y su utilidad en el diagnóstico de la toxocarosis   UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA  Estado: Tesis concluida  Maestría en Biología  ,2011,  . Persona orientada: Ana María Olave Velandia  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
Areas:
Ciencias Médicas y de la Salud -- Ciencias de la Salud -- Parasitología,

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, Análisis de la diversidad microbiana presente en biosólidos de la planta de tratamiento San Fernando, por pirosecuenciación masiva.  UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA  Estado: Tesis concluida  Maestría en Biología  ,2014,  . Persona orientada: Angela Arévalo Arbeláez  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, Aplicación de métodos metagenómicos en la detección y desarrollo de marcadores moleculares específicos de parásitos patógenos presentes en biosólidos generados en plantas de tratamiento de aguas residuales en Colombia.  UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA  Estado: Tesis en curso  Doctorado en Biología  ,2013,  . Persona orientada: Katherine Bedoya Urrego  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, Secuenciamiento y Anotación del genoma de un aislado colombiano del parásito protozoo Cryptosporidium parvum.  UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA  Estado: Tesis concluida  Doctorado en Biología  ,2012,  . Persona orientada: Juan Pablo Isaza Agudelo  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
Areas:
Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Bioquímica y Biología Molecular,

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, Desarrollo de una prueba serológica específica para diagnosticar toxocarosis humana, basada en la creación de una proteína quimérica diseñada con epítopes específicos del nematodo patógeno Toxocara canis.  UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA  Estado: Tesis en curso  Doctorado en Biología  ,2011,  . Persona orientada: Jairo Alonso Mesa Arango  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, Desarrollo de un ametodologia para el crinado de alto rendimeinto de compuestos leishmanicidas  UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA  Estado: Tesis concluida  Microbiología y Bioanálisis  ,2007,  . Persona orientada: Sergio Andres Pulido  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
Areas:
Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Bioquímica y Biología Molecular, Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Biología (Teórica, Matemática, Criobiología, Evolutiva),

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, Caracterizacion Molecular del gen putativo de la endonucleasa G -endoG de Leishmania (V.) panamensis  UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA  Estado: Tesis concluida  Microbiologia y Bioanalisis  ,2007,  . Persona orientada: Miguel Angel Toro  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
Areas:
Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Bioquímica y Biología Molecular,

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, Desarrollo de un sistema para el tamizaje de compuestos con actividad leishmanicida basado en la expresión transgénica del gen de la beta-lactamasa en Leishmania panamensis  UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA  Estado: Tesis concluida  Microbiologia y Bioanalisis  ,2007,  . Persona orientada: Sergio Andres Pulido  , Dirigió como: ,  meses  
Areas:
Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Bioquímica y Biología Molecular, Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Biología (Teórica, Matemática, Criobiología, Evolutiva),

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, Produccion de antigenos recombinantes de Helmintos a partir de genes sintéticos  UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA  Estado: Tesis concluida  Microbiologia y Bioanalisis  ,2009,  . Persona orientada: Jairto Alonso Mesa Arango  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, Caracterizacion Molecular y Bioquimica de la endonucleasa G de Leishmania panamensis  UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA  Estado: Tesis concluida  Maestría en Biología  ,2008,  . Persona orientada: MIguel Angel Toro Londoño  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  

Jurado en comités de evaluación

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, Titulo: INFECTIVIDAD NATURAL POR Plasmodium spp. EN POBLACIONES DE Anopheles spp. (Diptera: Culicidae) Y ESTRUCTURA POBLACIONAL DE DOS VECTORES, Anopheles albimanus y Anopheles darlingi, DE TRES PROVINCIAS BIOGEOGRAFICAS DE COLOMBIA Tipo de trabajo presentado:  en:  UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA  programa académico Ciencias Basicas Biomedicas  Nombre del orientado: Lina Andrea Gutierrez Builes  

Eventos científicos

Artículos

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, "Deep sequencing reveals the complete genome and evidence for transcriptional activity of the first virus-like sequences identified in Aristotelia chilensis (Maqui berry)" . En: Suiza 
Viruses  ISSN: 1999-4915  ed: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
v.7 fasc.4 p.1685 - 1699 ,2015,  DOI: 10.3390/v7041685

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, "Complete mitochondrial genome of the Neotropical catfish Pseudoplatystoma magdaleniatum (Siluriformes, Pimelodidae)" . En: No Aplica 
Mitochondrial Dna  ISSN: 1940-1744  ed: Informa Healthcare
v.6 fasc.N/A p.4033 - 4034 ,2015,  DOI: 10.3109/19401736.2014.1003830

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, "Comparison of Brucella canis genomes isolated from different countries shows multiple variable regions" . En: Estados Unidos 
Genomics  ISSN: 0888-7543  ed: Academic Press
v.106 fasc.1 p.43 - 51 ,2015,  DOI: 10.1016/j.ygeno.2015.03.004

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, "PIROSECUENCIACIÓN DEL GENOMA DE UNA CEPA ANDINA DE Potato virus S (PVS, Carlavirus) INFECTANDO Solanum phureja (Solanaceae) EN COLOMBIA" . En: Colombia 
Revista Facultad De Ciencias Básicas  ISSN: 1900-4699  ed: Legis
v.8 fasc.1 p.84 - 93 ,2012,  DOI: 

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, "Iterative clustering method for metagenomic sequences" . En: Irlanda 
Lecture Notes in Computer Science  ISSN: 0302-9743  ed: Springer-Verlag London Ltd.
v.8891 fasc.N/A p.145 - 154 ,2014,  DOI: 10.1007/978-3-319-13817-6

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, "Genome sequence of a virus isolate from tamarillo (Solanum betaceum) in Colombia: evidence for a new potyvirus" . En: Austria 
Archives of Virology  ISSN: 0304-8608  ed: Springer-Verlag London Ltd.
v.160 fasc.2 p.557 - 560 ,2014,  DOI: 10.1007/s00705-014-2296-8

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, PABLO ANDRES GUTIERREZ SANCHEZ, MAURICIO MARIN MONTOYA, "Complete genome sequence of an isolate of Potato virus X (PVX) infecting Cape gooseberry (Physalis peruviana) in Colombia" . En: Países Bajos 
Virus Genes  ISSN: 0920-8569  ed: Springer Netherlands
v.50 fasc.3 p.518 - 522 ,2015,  DOI: 10.1007/s11262-015-1181-1

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, ALBA GIGANTE, ANTONIO JIMENEZ RUIZ, CARLOS MARIO GENES, CRISTINA OLIVA, ELENA CASANOVA, EVA RICO, JOACHIM CLOS, KILIAN JESUS GUTIERREZ, MARIA JESUS PEREZ PEREZ, MARIA JOSE CAMARASA, DAVID MORENO, FEDERICO GAGO, "Leishmania infantum EndoG is an endo/exo-nuclease essential for parasite survival." . En: España 
PLoS ONE  ISSN: 1932-6203  ed: Public Library of Science
v.9 fasc.N/A p.1 - 9 ,2014,  DOI: 10.1371/journal.pone.0089526

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, PABLO ANDRES GUTIERREZ SANCHEZ, MAURICIO SALAZAR YEPES, MAURICIO MARIN MONTOYA, MAURICIO MARIN MONTOYA, PABLO ANDRES GUTIERREZ SANCHEZ, "Complete mitochondrial genome sequence of the common bean anthracnose pathogen Colletotrichum lindemuthianum" . En: Colombia 
Mitochondrial Dna  ISSN: 1940-1736  ed: Informa Healthcare
v.NA fasc.NA p.1 - 2 ,2014,  DOI: 10.3109/19401736.2013.878912
Palabras:
Ascomycota, Glomerellaceae, mitogenome, Phaseolus vulgaris,

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, PABLO ANDRES GUTIERREZ SANCHEZ, MAURICIO SALAZAR YEPES, MAURICIO MARIN MONTOYA, KATHERIN VANEGAS BERROUET, MAURICIO MARIN MONTOYA, "The CD1/CD2 marker for specific detection of Colletotrichum lindemuthianum is an iron transporter pseudogene" . En: Colombia 
Tropical Plant Pathology  ISSN: 1983-2052  ed: Springer Netherlands
v.39 fasc.N/A p.275 - 283 ,2014,  DOI: S1982-56762014000400002
Palabras:
Glomerella, Phaseolus vulgaris, anthracnose,

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, SERGIO ANDRES PULIDO, DIANA LORENA MUNOZ, IVAN DARIO VELEZ BERNAL, SARA MARIA ROBLEDO RESTREPO, "Improvement of the green fluorescent protein reporter system in Leishmania spa. for the in vitro and in vivo screening of antileishmanial drugs" . En: Colombia 
Acta Tropica  ISSN: 0001-706X  ed: Elsevier Science Bv
v.122 fasc.N/A p.36 - 45 ,2012,  DOI: 
Palabras:
Leishmaniasis, Transfection, Recombination, Reporter gene, GFP, Drug testing, Flow cytometry,

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, JUAN PABLO ISAZA, EDNA JUDITH MARQUEZ FERNANDEZ, JULIO CESAR HURTADO ALARCON, NESTOR CAMPOS, "Mitochondrial genome of the Caribbean king crab Damithrax spinosissimus (Lamarck, 1818) (Decapoda: Majidae)" . En: Colombia 
Mitochondrial Dna  ISSN: 1940-1736  ed: Informa Healthcare
v.22 fasc.N/A p.1 - 2 ,2014,  DOI: 25242176
Palabras:
Brachyuran, Mithracidae, Mithrax spinosissimu, mitogenome,

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, PABLO ANDRES GUTIERREZ SANCHEZ, MAURICIO MARIN MONTOYA, MAURICIO MARIN MONTOYA, "Analysis of Carbohydrate Metabolism Genes of Spongospora subterranean using 454 Pyrosequencing" . En: Colombia 
Revista Facultad Nacional de Agronomia  ISSN: 0304-2847  ed: Instituto de Estudios Políticos y Relaciones Internacionales de la Universidad Nacional de Colombia
v.67 fasc.N/A p.7247 - 7260 ,2013,  DOI: 179931328001
Palabras:
Genomics, Plasmodiphora , powdery scab, Solanum tuberosum,

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, PABLO ANDRES GUTIERREZ SANCHEZ, MAURICIO MARIN MONTOYA, SIMON BULMAN, MARY CARMEN ORTIZ, MAURICIO MARIN MONTOYA, PABLO ANDRES GUTIERREZ SANCHEZ, "Mitochondrial genome sequence of the potato powdery scab pathogen Spongospora subterranean" . En: Colombia 
Mitochondrial Dna  ISSN: 1940-1736  ed: Informa Healthcare
v.NA fasc.NA p.1 - 2 ,2014,  DOI: 24438302
Palabras:
Mitochondrial DNA, plasmodiophorids, powdery scab disease , Rhizaria, Solanum tuberosum,

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, PABLO ANDRES GUTIERREZ SANCHEZ, MAURICIO MARIN MONTOYA, PABLO ANDRES GUTIERREZ SANCHEZ, MAURICIO MARIN MONTOYA, "Caracterización del viroma de ARN en tejido radical de Solanum phureja mediante pirosecuenciación 454 GS-FLX" . En: Colombia 
Bioagro  ISSN: 1316-3361  ed: Universidad Centro-Occidental Lisandro Alvarado
v.26 fasc.N/A p.89 - 98 ,2014,  DOI: 
Palabras:
papa criolla, PLRV, PVS, PVV, secuenciación de nueva generación (NGS),

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, ERICK R CASTRO GONZALEZ, EDNA JUDITH MARQUEZ FERNANDEZ, "Mitochondrial genome of the endangered marine gastropod Strombus gigas Linnaeus, 1758 (Mollusca: Gastropoda)." . En: Colombia 
Mitochondrial Dna  ISSN: 1940-1736  ed: Informa Healthcare
v.4 fasc.N/A p.1 - 2 ,2014,  DOI: 25186797
Palabras:
mitogenome, next generation sequencing, pink snail, queen conch,

LUIS FERNANDO ARBELAEZ, CHRISTOF ERNEST BERBERICH, MARCEL MARIN VILLA, JOSE ROBINSON RAMIREZ PINEDA, CARLOS ENRIQUE MUSKUS LOPEZ, JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, "The gene encoding the metacyclogenesis-associated transcript Mat-1 is conserved in the genus leishmania and shows a tendency to form dimers upon protein expresion" . En: Alemania 
Parasitology Research  ISSN: 0932-0113  ed: Springer Netherlands
v.86 fasc. p.431 - 435 ,2000,  DOI: 
Palabras:
Metaciclogénesis, Gene Mat-1, Dímeros de Leucina,
Sectores:
Salud humana - Cuidado a la salud de las personas,

JOSE ROBINSON RAMIREZ PINEDA, SONIA DEL PILAR AGUDELO LOPEZ, CARLOS ENRIQUE MUSKUS LOPEZ, JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, CHRISTOF ERNEST BERBERICH, DOUGLAS BARKER, IVAN DARIO VELEZ BERNAL, "The method used to sample ulcers influences the diagnosis of cutaneous leishmaniasis" . En: Inglaterra 
Transactions of the Royal Society of Tropical Medicine and Hygiene  ISSN: 0035-9203  ed: Oxford University Press (UK)
v.96 fasc. p.169 - 171 ,2002,  DOI: 
Palabras:
DIAGNOSTICO, Leishmaniosis, PCR,
Sectores:
Salud humana - Cuidado a la salud de las personas,

JOSE ROBINSON RAMIREZ PINEDA, SONIA DEL PILAR AGUDELO LOPEZ, CARLOS ENRIQUE MUSKUS LOPEZ, JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, CHRISTOF ERNEST BERBERICH, DOUGLAS BARKER, IVAN DARIO VELEZ BERNAL, "Diagnosis of cutaneous leishmaniasis in Colombia: the sampling site within lesions influences the sensitivity of parasitologic diagnosis" . En: Estados Unidos 
Journal of Clinical Microbiology  ISSN: 0095-1137  ed: American Society for Microbiology
v.38 fasc.10 p.3768 - 3773 ,2000,  DOI: 
Palabras:
DIAGNOSTICO, Leishmaniosis, PCR,
Sectores:
Salud humana - Cuidado a la salud de las personas,

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, FREDY RUIZ, MARTHA LUCIA QUINONES, DAVID CALLE, YVONNE LINTON, "Molecular differentiation of Anopheles (Nyssorhynchus) benarrochi and An. (N.) oswaldoi from southern Colombia." . En: Brasil 
Memorias do Instituto Oswaldo Cruz  ISSN: 0074-0276  ed: Instituto Oswaldo Cruz
v.100 fasc.2 p.155 - 160 ,2005,  DOI: 
Palabras:
Anopheles benarrochi, PCR RFLP, Taxonomia,

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, IVAN DARIO VELEZ BERNAL, VICTOR MANUEL GONZALEZ, EDWIN BAIRON PATINO, JOSE ROBINSON RAMIREZ PINEDA, ANTONIO JIMENEZ RUIZ, "Leishmania (Viannia) panamensis: cloning of the histone H1 genes by representational difference analysis" . En: Estados Unidos 
Experimental Parasitology  ISSN: 0014-4894  ed: Elsevier Science Inc
v.112 fasc.2 p.126 - 129 ,2006,  DOI: 
Palabras:
Clonaciòn, histona H1, Leishmania, PCR, RDA, amastigote,

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, VICTOR MANUEL GONZALEZ, ALBERETO ALVAREZ BARRIENTOS, ANTONIO JIMENEZ RUIZ, "Heat-induced programmed cell death in Leishmania infantum is reverted by Bcl-X(L) expression" . En: Estados Unidos 
Apoptosis  ISSN: 1360-8185  ed: Springer Netherlands
v.11 fasc.2 p.161 - 171 ,2006,  DOI: 
Palabras:
Apoptosis, bcl-2, choque termico, citometría de flujo, Leishmania, muerte celular programada,

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, ALBERETO ALVAREZ BARRIENTOS, ANDRES AUGUSTO ARIAS SIERRA, DAVID MORENO MATEOS, ANTONIO JIMENEZ RUIZ, "Mitochondrial superoxide mediates heat-induced apoptotic-like death in Leishmania infantum" . En: Estados Unidos 
Molecular Biochemical Parasitology  ISSN: 0  ed: 
v.152 fasc.2 p.192 - 202 ,2007,  DOI: 
Palabras:
Apoptosis, estrés oxidativo, Leishmania, muerte celular programada,

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, PABLO ANDRES GUTIERREZ SANCHEZ, MAURICIO MARIN MONTOYA, PABLO ANDRES GUTIERREZ SANCHEZ, MAURICIO MARIN MONTOYA, "Complete genome sequence of a novel potato virus S strain infecting Solanum phureja in Colombia" . En: Canadá 
Archives of Virology  ISSN: 0304-8608  ed: Springer-Verlag London Ltd.
v.158 fasc.10 p.2205 - 2208 ,2013,  DOI: 10.1007/s00705-013-1730-7

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, "Probing the dimerization interface of Leishmania infantum trypanothione reductase with site-directed mutagenesis and short peptides" . En: Estados Unidos 
ChemBioChem  ISSN: 1439-4227  ed: Wiley-V C H Verlag Gmbh
v.14 fasc.10 p.1212 - 1217 ,2013,  DOI: 10.1002/cbic.201200744

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, "Apoptotic markers in protozoan parasites" . En: Inglaterra 
Parasites '&' Vectors  ISSN: 1756-3305  ed: BioMed Central Ltd.
v.9 fasc.3 p.1 - 15 ,2010,  DOI: 10.1186/1756-3305-3-104.

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, LUIS FERNANDO BARRERA, JUAN PABLO ISAZA, JAIME ROBLEDO, "Whole genome shotgun sequencing of one Colombian clinical isolate of Mycobacterium tuberculosis reveals DosR regulon gene deletions" . En: Reino Unido 
Fems Microbiology Letters  ISSN: 1574-6968  ed: Oxford University Press (UK)
v.330 fasc.2 p.113 - 120 ,2012,  DOI: 10.1111/j.1574-6968.2012.02540.x.
Palabras:
Genómica Comparativa, biologia molecular, tuberculosis,

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, SARA MARIA ROBLEDO RESTREPO, "Leishmania (Viannia) panamensis expresses a nuclease with molecular and biochemical features similar to the Endonuclease G of higher eukaryotes" . En: Colombia 
Colombia Medica  ISSN: 1657-9534  ed: Universidad del Valle
v.42 fasc.2 p.154 - 165 ,2011,  DOI: 

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, ANDRES AUGUSTO ARIAS SIERRA, "Leishmania infantum expresses a mitochondrial nuclease homologous to EndoG that migrates to the nucleus in response to an apoptotic stimulus" . En: Inglaterra 
Molecular and Biochemical Parasitology  ISSN: 0166-6851  ed: Elsevier Science Bv
v.163 fasc.1 p.28 - 38 ,2009,  DOI: 10.1016/j.molbiopara.2008.09.007

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, JUAN PABLO ISAZA, "Genome microsatellite diversity within the Apicomplexa phylum" . En: Inglaterra 
Molecular Genetics and Genomics  ISSN: 1617-4615  ed: Springer-Verlag London Ltd.
v.291 fasc.6 p.2117 - 2129 ,2016,  DOI: 10.1007/s00438-016-1244-6
Palabras:
Bioinformatics, Evolución, Genomics, Genómica Comparativa, cryptosporidium,

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, ANA MARIA OLAVE VELANDIA, JAIRO ALONSO MESA ARANGO, EDWIN BAIRON PATINO, JORGE HUMBERTO BOTERO GARCES, GISELA MARIA GARCIA MONTOYA, "Production and evaluation of the recombinant antigen TES-30 of Toxocara canis for the immunodiagnosis of toxocariasis" . En: Colombia 
Biomedica  ISSN: 0120-4157  ed: Instituto Nacional de Salud
v.36 fasc.1 p.39 - 51 ,2016,  DOI: 10.7705/biomedica.v36i1.2617
Palabras:
Clonaciòn, DIAGNOSTICO, biologia molecular, toxocara, toxocarosis,

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, YESENIA MADRIGAL BEDOYA, NATALIA PABON MORA, "Evolution and Expression Patterns of TCP Genes in Asparagales" . En: Colombia 
Frontiers in Plant Science  ISSN: 1664-462X  ed: Frontiers Media S.A.
v.8 fasc.9 p.1 - 17 ,2017,  DOI: 10.3389/fpls.2017.00009
Palabras:
Bioinformatics, Genómica Comparativa, transcriptomics, next generation sequencing,

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, SONIA DEL PILAR AGUDELO LOPEZ, JUAN PABLO ISAZA, FELIPE CABARCAS JARAMILLO, GISELA MARIA GARCIA MONTOYA, JAIRO ALONSO MESA ARANGO, LUIS FERNANDO BARRERA ROBLEDO, "Transcriptome profiling of the cysticercus stage of the laboratory model Taenia crassiceps, strain ORF" . En: Colombia 
Acta Tropica  ISSN: 1873-6254  ed: Elsevier Science Bv
v.154 fasc.N/A p.50 - 62 ,2016,  DOI: 10.1016/j.actatropica.2015.11.001
Palabras:
Bioinformatics, biologia molecular, next generation sequencing, transcriptomics, taenia,

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, JUAN PABLO ISAZA, ANA LUZ GALVAN DIAZ, "Revisiting the reference genomes of human pathogenic Cryptosporidium species: reannotation of C. parvum Iowa and a new C. hominis reference." . En: Inglaterra 
Scientific Reports  ISSN: 2045-2322  ed: Nature Publishing Group
v.5 fasc.16324 p.1 - 14 ,2015,  DOI: 10.1038/srep16324
Palabras:
Genomics, Genómica Comparativa, cryptosporidium,

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, NATALIA PABON MORA, FAVIO ANTONIO GONZALEZ GARAVITO, "The developmental and genetic bases of apetaly in Bocconia frutescens (Chelidonieae: Papaveraceae)" . En: Colombia 
EvoDevo  ISSN: 2041-9139  ed: BioMed Central Ltd.
v.7 fasc.N/A p.1 - 18 ,2016,  DOI: 10.1186/s13227-016-0054-6
Palabras:
Bioinformatics, Genomics, Genómica Comparativa, next generation sequencing, biologia molecular,

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, ANDRES AUGUSTO ARIAS SIERRA, "Edelfosine induces an apoptotic process in Leishmania infantum that is regulated by the ectopic expression of Bcl-XL and Hrk." . En: Estados Unidos 
Antimicrobial Agents and Chemotherapy  ISSN: 0066-4804  ed: American Society for Microbiology
v.52 fasc.10 p.3779 - 3782 ,2008,  DOI: 

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, FELIPE CABARCAS JARAMILLO, JUAN PABLO ISAZA, "CLAME: a new alignment-based binning algorithm allows the genomic description of a novel Xanthomonadaceae from the Colombian Andes" . En: Inglaterra 
BMC Genomics  ISSN: 1471-2164  ed: BioMed Central Ltd.
v.19 fasc.Suppl 8 p.9 - 30 ,2018,  DOI: 10.1186/s12864-018-5191-y

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, "Metagenomic assessment of the microbial community and methanogenic pathways in biosolids from a municipal wastewater treatment plant in Medellín, Colombia" . En: Países Bajos 
Science of the Total Environment  ISSN: 0048-9697  ed: Elsevier Science Bv
v.648 fasc.N/A p.572 - 581 ,2019,  DOI: 10.1016/j.scitotenv.2018.08.119

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, "Inherited p40phox deficiency differs from classic chronic granulomatous disease" . En: Estados Unidos 
Journal of Clinical Investigation  ISSN: 0021-9738  ed: American Society for Clinical Investigation
v.128 fasc.9 p.3957 - 3975 ,2018,  DOI: 10.1172/JCI97116

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, ANA CECILIA MESA ARANGO, SINDY VIVIANA FLOREZ MUNOZ, "Molecular Identification and Antifungal Susceptibility of Clinical Isolates of Sporothrix schenckii Complex in Medellin, Colombia" . En: Inglaterra 
Mycopathologia  ISSN: 1573-0832  ed: Springer Netherlands
v.N/A fasc.N/A p.1 - 11 ,2018,  DOI: 10.1007/s11046-018-0310-5

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, ANDRES AUGUSTO ARIAS SIERRA, JOSE LUIS FRANCO RESTREPO, "Early-Onset Invasive Infection Due to Corynespora cassiicola Associated with Compound Heterozygous CARD9 Mutations in a Colombian Patient" . En: Estados Unidos 
Journal of Clinical Immunology  ISSN: 0271-9142  ed: Kluwer Academic/Plenum Publishers
v.38 fasc.7 p.794 - 803 ,2018,  DOI: 10.1007/s10875-018-0549-0

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, "The Orphan Response Regulator Aor1 Is a New Relevant Piece in the Complex Puzzle of Streptomyces coelicolor Antibiotic Regulatory Network" . En: Suiza 
Frontiers in Microbiology  ISSN: 1664-302X  ed: Frontiers Media S.A.
v.8 fasc.N/A p.1 - 12 ,2017,  DOI: 10.3389/fmicb.2017.02444

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, KATHERINE BEDOYA URREGO, FELIPE CABARCAS JARAMILLO, "Descripción de la microbiota bacteriana residente en el biosólido generado en la planta de tratamiento de aguas residuales San Fernando. Itagüí, Colombia" . En: Colombia 
Revista de Salud Pública  ISSN: 0124-0064  ed: Instituto de Estudios Políticos y Relaciones Internacionales de la Universidad Nacional de Colombia
v.19 fasc.6 p.806 - 813 ,2017,  DOI: 10.15446/rsap.V19n6.67950

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, SARA MARIA ROBLEDO RESTREPO, SERGIO ANDRES PULIDO MUNOZ, LUZ AMALIA RIOS VASQUEZ, "Insights into the phosphatidylcholine and phosphatidylethanolamine biosynthetic pathways in Leishmania parasites and characterization of a choline kinase from Leishmania infantum" . En: Países Bajos 
Comparative Biochemistry And Physiology B-Biochemistry '&' Molecular Biology  ISSN: 1096-4959  ed: Elsevier Bv
v.213 fasc.N/A p.45 - 54 ,2017,  DOI: 10.1016/j.cbpb.2017.07.008
Palabras:
Leishmania,

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, OMAR TRIANA CHAVEZ, CLAUDIA XIMENA MORENO HERRERA, LUISA MARIA MONTOYA PORRAS, "16S rRNA gene amplicon sequencing reveals dominance of Actinobacteria in Rhodnius pallescens compared to Triatoma maculata midgut microbiota in natural populations of vector insects from Colombia" . En: Países Bajos 
Acta Tropica  ISSN: 1873-6254  ed: Elsevier Science Bv
v.178 fasc.N/A p.327 - 332 ,2018,  DOI: 10.1016/j.actatropica.2017.11.004

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, JOSE ROBINSON RAMIREZ PINEDA, OMAR TRIANA CHAVEZ, "Genomic Analysis of Colombian Leishmania panamensis strains with different level of virulence" . En: Inglaterra 
Scientific Reports  ISSN: 2045-2322  ed: Nature Publishing Group
v.8 fasc.1 p.1 - 16 ,2018,  DOI: 10.1038/s41598-018-35778-6

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, "Intestinal parasitic infection alters bacterial gut microbiota in children" . En: Estados Unidos 
PeerJ  ISSN: 2167-8359  ed: PeerJ Inc.
v.7 fasc.N/A p.1 - 24 ,2019,  DOI: 10.7717/peerj.6200

JAISON HERNAN CUARTAS GALLEGO, JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, EDNA JUDITH MARQUEZ FERNANDEZ, CLAUDIA XIMENA MORENO HERRERA, "Metagenomic analysis of orange colored protrusions from the muscle of Queen Conch Lobatus gigas (Linnaeus, 1758)" . En: Estados Unidos 
PeerJ  ISSN: 2167-8359  ed: PeerJ Inc.
v.6 fasc.N/A p.1 - 20 ,2018,  DOI: 10.7717/peerj.4307

Otra producción blibliográfica

SONIA DEL PILAR AGUDELO LOPEZ, EDWIN BAIRON PATINO, JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, "Producción del antígeno recombinante rTES-30 de Toxocara Canis y su implementación en el diagnostico de la toxocarosis" En: . 2013. p.

Nueva secuencia genética

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, EDNA JUDITH MARQUEZ FERNANDEZ, JOSE DAVID RANGEL MEDRANO, Pseudoplatystoma magdaleniatum voucher Pmag-UNAL-001 mitochondrion, complete genome NC_026526.1, En: Marzo - 2015 . En: MEDELLÍN.  Base de datos donde está incluido el registro: GenBank  disponible en https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_026526.1   Institución: National Center for Biotechnology Information (NCBI) 
Areas:
Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Genética y Herencia, Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Bioquímica y Biología Molecular, Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Biología Marina y del Agua,

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, NATALIA RESTREPO ESCOBAR, EDNA JUDITH MARQUEZ FERNANDEZ, Ageneiosus pardalis voucher Apar-UNAL-001 mitochondrion, complete genome NCBI Reference Sequence: NC_026717.1, En: Octubre - 2014 . En: MEDELLÍN.  Base de datos donde está incluido el registro: GenBank  disponible en https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_026717.1   Institución: National Center for Biotechnology Information (NCBI) 
Areas:
Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Genética y Herencia, Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Bioquímica y Biología Molecular, Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Biología Marina y del Agua,
Sectores:
Pesca acuicultura y maricultura, Productos y procesos biotecnológicos - Productos y procesos biotecnológicos vinculados a la salud humana o de los animales, Agricultura, pecuaria, silvicultura, explotación forestal - Producción animal, incluso servicios veterinarios, Productos y servicios para la defensa y protección del medio ambiente, incluyendo el desarrollo sostenible.,

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, EDNA JUDITH MARQUEZ FERNANDEZ, NATALIA RESTREPO ESCOBAR, Pterois volitans voucher Pvol-UNAL-001 mitochondrion, complete genome, En: Noviembre - 2014 . En: MEDELLÍN.  Base de datos donde está incluido el registro: GenBank  disponible en https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_026717.1   Institución: National Center for Biotechnology Information (NCBI) 
Areas:
Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Genética y Herencia, Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Bioquímica y Biología Molecular, Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Biología Marina y del Agua,
Sectores:
Pesca acuicultura y maricultura, Productos y procesos biotecnológicos - Productos y procesos biotecnológicos vinculados a la salud humana o de los animales, Productos y servicios para la defensa y protección del medio ambiente, incluyendo el desarrollo sostenible.,

RICARDO MARCEL LANDINEZ GARCIA, JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, EDNA JUDITH MARQUEZ FERNANDEZ, Curimata mivartii voucher Cmiv-UNAL-001 mitochondrion, complete genome NC_025951.1, En: Diciembre - 2014 . En: MEDELLÍN.  Base de datos donde está incluido el registro: GenBank  disponible en https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_025951.1   Institución: National Center for Biotechnology Information (NCBI) 
Areas:
Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Genética y Herencia, Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Bioquímica y Biología Molecular, Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Biología Marina y del Agua,
Sectores:
Pesca acuicultura y maricultura, Agricultura, pecuaria, silvicultura, explotación forestal - Producción animal, incluso servicios veterinarios, Productos y servicios para la defensa y protección del medio ambiente, incluyendo el desarrollo sostenible., Productos y procesos biotecnológicos - Productos y procesos biotecnológicos vinculados a la salud humana o de los animales,

RICARDO MARCEL LANDINEZ GARCIA, JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, EDNA JUDITH MARQUEZ FERNANDEZ, Brycon henni voucher Bhen-UNAL-001 mitochondrion, complete genome NC_026873.1, En: Junio - 2015 . En: MEDELLÍN.  Base de datos donde está incluido el registro: GenBank  disponible en https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_026873.1   Institución: National Center for Biotechnology Information (NCBI) 
Areas:
Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Genética y Herencia, Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Bioquímica y Biología Molecular, Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Biología Marina y del Agua,
Sectores:
Pesca acuicultura y maricultura, Agricultura, pecuaria, silvicultura, explotación forestal - Producción animal, incluso servicios veterinarios, Productos y servicios para la defensa y protección del medio ambiente, incluyendo el desarrollo sostenible., Productos y procesos biotecnológicos - Productos y procesos biotecnológicos vinculados a la salud humana o de los animales,

NATALIA RESTREPO ESCOBAR, JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, EDNA JUDITH MARQUEZ FERNANDEZ, Sorubim cuspicaudus voucher Scus-UNAL-001 mitochondrion, complete genome NCBI Reference Sequence: NC_026211.1, En: Enero - 2015 . En: MEDELLÍN.  Base de datos donde está incluido el registro: GenBank  disponible en https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/749111999   Institución: National Center for Biotechnology Information (NCBI) 
Areas:
Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Genética y Herencia, Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Bioquímica y Biología Molecular, Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Biología Marina y del Agua,
Sectores:
Pesca acuicultura y maricultura, Agricultura, pecuaria, silvicultura, explotación forestal - Producción animal, incluso servicios veterinarios, Productos y servicios para la defensa y protección del medio ambiente, incluyendo el desarrollo sostenible., Productos y procesos biotecnológicos - Productos y procesos biotecnológicos vinculados a la salud humana o de los animales,

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, JAISON HERNAN CUARTAS GALLEGO, ERICK R CASTRO GONZALEZ, CLAUDIA XIMENA MORENO HERRERA, EDNA JUDITH MARQUEZ FERNANDEZ, Trematoda sp. JFAR-2015 isolate Sg300-UNAL-SAA cytochrome oxidase subunit I gene, partial cds; mitochondrial 740 bp linear DNA KR092371.1, En: Septiembre - 2015 . En: MEDELLÍN.  Base de datos donde está incluido el registro: GenBank  disponible en https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KR092371.1   Institución: National Center for Biotechnology Information (NCBI) 
Areas:
Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Genética y Herencia, Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Bioquímica y Biología Molecular, Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Biología Marina y del Agua,
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Pesca acuicultura y maricultura, Agricultura, pecuaria, silvicultura, explotación forestal - Producción animal, incluso servicios veterinarios, Productos y servicios para la defensa y protección del medio ambiente, incluyendo el desarrollo sostenible., Productos y procesos biotecnológicos - Productos y procesos biotecnológicos vinculados a la salud humana o de los animales,

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, EDNA JUDITH MARQUEZ FERNANDEZ, JULIO CESAR HURTADO ALARCON, JUAN PABLO ISAZA, NESTOR CAMPOS, Damithrax spinosissimus voucher Mspi-UNAL-001 mitochondrion, complete genome NC_025518.1, En: Diciembre - 2014 . En: MEDELLÍN.  Base de datos donde está incluido el registro: GenBank  disponible en https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_025518.1   Institución: National Center for Biotechnology Information (NCBI) 
Areas:
Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Genética y Herencia, Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Bioquímica y Biología Molecular, Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Biología Marina y del Agua,
Sectores:
Pesca acuicultura y maricultura, Productos y servicios para la defensa y protección del medio ambiente, incluyendo el desarrollo sostenible., Agricultura, pecuaria, silvicultura, explotación forestal - Producción animal, incluso servicios veterinarios,

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, ERICK R CASTRO GONZALEZ, EDNA JUDITH MARQUEZ FERNANDEZ, Strombus gigas isolate Sg300-UNAL-SAA mitochondrion, complete genome NC_024932.1, En: Septiembre - 2014 . En: MEDELLÍN.  Base de datos donde está incluido el registro: Genbank  disponible en https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_024932.1   Institución: National Center for Biotechnology Information (NCBI) 
Areas:
Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Genética y Herencia, Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Bioquímica y Biología Molecular, Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Biología Marina y del Agua,
Sectores:
Pesca acuicultura y maricultura, Productos y servicios para la defensa y protección del medio ambiente, incluyendo el desarrollo sostenible., Productos y procesos biotecnológicos - Productos y procesos biotecnológicos vinculados a la salud humana o de los animales,

JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, RICARDO MARCEL LANDINEZ GARCIA, EDNA JUDITH MARQUEZ FERNANDEZ, Ichthyoelephas longirostris voucher Ilong-UNAL-001 mitochondrion, complete genome NC_025950.1, En: Diciembre - 2014 . En: MEDELLÍN.  Base de datos donde está incluido el registro: GenBank  disponible en https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_025950.1   Institución: National Center for Biotechnology Information (NCBI) 
Areas:
Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Genética y Herencia, Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Bioquímica y Biología Molecular, Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Biología Marina y del Agua,
Sectores:
Pesca acuicultura y maricultura, Agricultura, pecuaria, silvicultura, explotación forestal - Producción animal, incluso servicios veterinarios, Productos y servicios para la defensa y protección del medio ambiente, incluyendo el desarrollo sostenible., Productos y procesos biotecnológicos - Productos y procesos biotecnológicos vinculados a la salud humana o de los animales,

EDNA JUDITH MARQUEZ FERNANDEZ, JUAN FERNANDO ALZATE RESTREPO, JUAN PABLO ISAZA, Thunnus atlanticus voucher Talt-UNAL-001 mitochondrion, complete genome NC_025519.1, En: Diciembre - 2014 . En: MEDELLÍN.  Base de datos donde está incluido el registro: GenBank  disponible en https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_025519.1   Institución: National Center for Biotechnology Information (NCBI) 
Areas:
Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Genética y Herencia, Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Bioquímica y Biología Molecular, Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Biología Marina y del Agua,
Sectores:
Pesca acuicultura y maricultura, Agricultura, pecuaria, silvicultura, explotación forestal - Producción animal, incluso servicios veterinarios, Productos y servicios para la defensa y protección del medio ambiente, incluyendo el desarrollo sostenible., Productos y procesos biotecnológicos - Productos y procesos biotecnológicos vinculados a la salud humana o de los animales,

Proyectos

Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
Clonación, expresión y caracterización inmunologógica de la proteina metacíclica GBP en especies de Lesihmania del Nuevo Mundo
Inicio: Enero  2001 Duración 0
Resumen

Objetivo General: Caracterizar molecular e inmunologicamente la proteína homologa del gen GBP, en cepas de Leishmania del Nuevo Mundo

Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
Aplicación de métodos metagenómicos para la detección y desarrollo de marcadores moleculares específicos de parásitos patógenos presentes en biosólidos generados en plantas de tratamiento de aguas residuales en Colombia
Inicio: Diciembre  2013 Fin: Diciembre  2016 Duración 
Resumen

Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
Análisis de la diversidad microbiana presente en biosólidos de la planta de tratamiento San Fernando por pirosecuenciación masiva
Inicio: Octubre  2014 Fin: Octubre  2016 Duración 
Resumen

En Itagüí se encuentra ubicada la planta de tratamiento de aguas residuales (PTAR) San Fernando, la cual genera unas 70 toneladas al día de biosólidos. El incremento reciente de este subproducto, ha creado la necesidad de implementar diversas alternativas para el uso y aprovechamiento de los mismos como por ejemplo en plantaciones forestales, elaboración de abonos, biorremediación de suelos y en actividades agrícolas [2,4]. Sin embargo, éstas alternativas han generado controversia, debido a los riesgos potenciales para la salud humana, animal y del medio ambiente, derivados del contacto con microorganismos patógenos que pueden estar presentes en los biosólidos aún después de los procesos de estabilización [4,5]. Se han llevado a cabo diferentes estudios para determinar las comunidades bacterianas presentes en el biosólido y de igual manera esclarecer el potencial riesgo biológico que estás representan para la salud humana y ambiental. Técnicas convencionales de cultivo para el asilamiento de microorganismos ambientales han sido utilizadas pero han tenido poco éxito debido al pequeño porcentaje (0,1%) de bacterias cultivables, lo que implica que la gran mayoría de estas no se pueden aislar in vitro con los métodos convencionales. Esta limitante a generado que los investigadores analicen las muestras ambientales utilizando diferentes metodologías que incluyen técnicas de biología molecular.

Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
Caracterización molecular, expresiòn y evaluaciòn inmunològica del gen H1, expresado diferencialmente en promastigotes y amastigotes de Leishmania del subgénero Viannia
Inicio: Enero  2002 Duración 0
Resumen

Objetivo General: Caracterizar a nivel molecular el gen H1, su expresión proteica en parásitos de Leishmania (Viannia) panamensis y la respuesta inmune inducida contra la proteína H1 en suero de pacientes infectados con esta especie.

Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
Análisis estructural y funcional de dos proteínas metacíclicas de Leishmania y su relación con virulencia
Inicio: Enero  1998 Duración 
Resumen

Caracterizar las proteínas metacíclicas de Leishmania, Meta-1 y Mat-1, amplificar sus marcos delectura, clonarlos, secuenciarlos y expresarlos como proteínas recombinantes. Se produjo un suero policlonal contra ellas para luego utilizarlo en la inmunolocalización y detección de estas proteínas. Además se evaluó se existe o no expresión diferencial, como ocurre en especies del Viejo Mundo. Adicionlamente se hizo una evaluación antigénica de la respuesta tanto celular como humoral con ambas proteínas y una evaluación de la función empleando metodología de RNA antisentido.

Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
Mejoramiento de la sensibilidad de las pruebas para el diagnóstico de Leishmaniasis cutánea
Inicio: Enero  1997 Duración 
Resumen

Before beginning treatment for cutaneous leishmaniasis, parasitological confirmation of the disease is required. The most communly used diagnostic procedures are microscopiy and culture of samples taken fron the active edge of the lesion. In this study, we compared the sensitivity of previous diagnostic procedures with the PCR, using smears taken fron the edge of the lesion and its centre. The sensitivity was greater with smears taken fron the centre of the lesion, both for microscopical examination (85%) and for PCR (81%), compared to those obtained from the edge of the lesion (69% and 58% respectively). When PCR was carried out on biopsy material from the edge of the lesion the sensitive was 63%.

Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
Towards the identification of the stage and phenotype specific genes in New World Leishmania species using differential PCR amplification techniques.
Inicio: Enero  2000 Duración 
Resumen

Leishmania en la naturaleza se encuentra bajo dos estadios: un estadio extracelular, movil y que se encuentra en el insecto vector y conocido como promastigote y otro estadio intracelular obligado y que se encuentra en los hospederos vertebrados y conocido como amastigote. Estos parásitos durante su ciclo de vida habitan estos dos ambientes diiferentes, por lo que para sobrevivir deben tener y controlar programas de expresion geniicos que los preadapten para resistir el ataque del sistema inmune y multiplicarse en los dos hospederos. Poco se conoce sobre los genes que se expresan diferencial o exclusivamente en el estadfio de amastigote, quizas por las dificultades para obtenerlos libres de celulas. Sin embargo la implementacion y caracterización reciente de cultivos axenicos de amastigotes ha permitido obtener estas formas libres de contaminantes celulares. En este proyecto se hizo determinacion y caracterizacion de genes expresados diferencialmente en el amastigote, empleando metodologias cono RDE (representatipn of differential expression) o SSH. Mediiante estas tecnicas se detectaron varios transcriptos con expresion diferencial y uno de ellos, el que codifica para la protiena Histona H1, se encontro estar expresados dos veces mas en el amastigote que en el promastiigote. El gen que codifica para esta proteina fue amplificado, clonado, secuenciado y caracterizado molecularmente

Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
Centro Nacional de Secuenciación Genómica- CNSG
Inicio: Marzo  2010 Fin proyectado: Febrero  2015 Duración 60
Resumen

Instalación de un centro de secuenciación genómica nacional en Colombia, utlizando la tecnología pirosecuenciamiento masivo de la compañia ROCHE. 454 FLX.

Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
Producción del antígeno recombinante rTES-30 de Toxocara canis y su implementación en el diagnóstico de la toxocarosis.
Inicio: Octubre  2010 Fin proyectado: Septiembre  2012 Duración 24
Resumen

Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
Secuenciamiento y Anotación del genoma de un aislado colombiano del parásito protozoo Cryptosporidium parvum
Inicio: Diciembre  2010 Fin: Diciembre  2013 Duración 
Resumen

Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
Desarrollo de una prueba serológica específica para diagnosticar toxocarosis humana, basada en la creación de una proteína quimérica diseñada con epítopes específicos del nematodo patógeno Toxocara canis
Inicio: Diciembre  2010 Fin: Diciembre  2013 Duración 
Resumen