Hoja de vida

Categoría Investigador Junior (IJ) (con vigencia hasta 2019-12-05 00:00:00.0) - Convocatoria 781 de 2017
Nombre Oscar Fernando Bedoya Leiva
Nombre en citaciones BEDOYA LEIVA, OSCAR FERNANDO
Nacionalidad Colombiana
Sexo Masculino

Formación Académica

  •  
  • Doctorado UNIVERSIDAD DEL VALLE
    Doctorado en Ingeniería
    Enerode2013 - Noviembrede 2016
    Remote homology detection based on predicted 3D information and physicochemical properties
  •  
  • Maestría/Magister UNIVERSIDAD DEL VALLE
    Maestría en Ingeniería
    Agostode2004 - Diciembrede 2006
    APLICANDO ALGORITMOS DE CLASIFICACIÓN EN LA PREDICCIÓN DE GENES
  •  
  • Pregrado/Universitario UNIVERSIDAD DEL VALLE
    Ingeniería de Sistemas
    Agostode1997 - Septiembrede 2003
    ANÁLISIS, DISEÑO E IMPLEMENTACIÓN DE UNA HERRAMIENTA COMPUTACIONAL PARA LA CLASIFICACIÓN DIFUSA DE USUARIOS EN EL WEB, REALIZADA EN GRUPOS IDENTIFICADOS POR MEDIO DE UNA TÉCNICA CLUSTERING

    Experiencia profesional

  •  
  • UNIVERSIDAD DEL VALLE
    Dedicación: 40 horas Semanales Agosto de 2004 de Actual

    Actividades de docencia
    -   Postgrado - Nombre del curso:  Fundamentos de Algoritmos y Computabilidad, 0 Febrero 2009 Julio 2009
    -   Pregrado - Nombre del curso:  Matemáticas Discretas, 0 Agosto 2009 Diciembre 2009
    -   Pregrado - Nombre del curso:  Sistemas Operativos, 0 Agosto 2008 Diciembre 2008
    -   Pregrado - Nombre del curso:  Inteligencia artificial, 0 Agosto 2007 Diciembre 2007
    -   Pregrado - Nombre del curso:  Programación Interactiva, 0 Febrero 2007 Julio 2007
    -   Pregrado - Nombre del curso:  Fundamentos y análisis de algoritmos, 0 Agosto 2006 Diciembre 2006
    -   Pregrado - Nombre del curso:  Estructuras de datos y algoritmos, 0 Febrero 2005 Julio 2005
    -   Pregrado - Nombre del curso:  Introducción a las tecnologías informáticas, 0 Agosto 2004 Diciembre 2004
    -   Pregrado - Nombre del curso:  Algoritmia y programación , 0 Agosto 2004 Diciembre 2004

    Áreas de actuación

  •  Ingeniería y Tecnología -- Ingenierías Eléctrica, Electrónica e Informática -- Ingeniería de Sistemas y Comunicaciones
  •  Ciencias Naturales -- Computación y Ciencias de la Información -- Ciencias de la Computación
  • Idiomas

      Habla Escribe Lee Entiende
  •  Inglés
  • Bueno Bueno Bueno Bueno
     
    Los ítems de producción con la marca corresponden a productos avalados y validados para la última Convocatoria Nacional para el Reconocimiento y Medición de Grupos de Investigación, Desarrollo Tecnológico o de Innovación y para el Reconocimiento de Investigadores del SNCTeI

    Trabajos dirigidos/tutorías

  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • OSCAR FERNANDO BEDOYA LEIVA, Recuperación de información sobre ontologías basada en palabras clave  UNIVERSIDAD DEL VALLE  Estado: Tesis concluida  Ingeniería de Sistemas  ,2012,  . Persona orientada: Dayana Guevara  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • OSCAR FERNANDO BEDOYA LEIVA, Desarrollo de un metamodelo para la toma de decisiones en videojuegos  UNIVERSIDAD DEL VALLE  Estado: Tesis concluida  Ingeniería de Sistemas  ,2012,  . Persona orientada: Daniel Veintimilla  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • OSCAR FERNANDO BEDOYA LEIVA, Aplicación de técnicas de Inteligencia artificial para la toma de decisiones en videojuegos  UNIVERSIDAD DEL VALLE  Estado: Tesis concluida  Ingeniería de Sistemas  ,2012,  . Persona orientada: Juan Camilo Pérez  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • OSCAR FERNANDO BEDOYA LEIVA, Sistema para la evaluación de la calidad de las aguas superficiales utilizando Inteligencia artificial  UNIVERSIDAD DEL VALLE  Estado: Tesis concluida  Ingeniería de Sistemas  ,2009,  . Persona orientada: José Luis Vargas  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • OSCAR FERNANDO BEDOYA LEIVA, Predicción de clasificación estructural de proteínas usando un algoritmo de footprinting  UNIVERSIDAD DEL VALLE  Estado: Tesis concluida  Ingeniería de Sistemas  ,2015,  . Persona orientada: Jorge Ordoñez  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • OSCAR FERNANDO BEDOYA LEIVA, Reproducción de voz basada en la cronología de Twitter  UNIVERSIDAD DEL VALLE  Estado: Tesis concluida  Ingeniería de Sistemas  ,2012,  . Persona orientada: Juan Carlos Samboní  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • OSCAR FERNANDO BEDOYA LEIVA, Solución móvil para la automatización de la fuerza de ventas en dispositivos PDA para la empresa Manuelita S.A.  UNIVERSIDAD DEL VALLE  Estado: Tesis concluida  Ingeniería de Sistemas  ,2009,  . Persona orientada: Adriana Flórez  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • OSCAR FERNANDO BEDOYA LEIVA, Predicción de la estructura secundaria de la proteína usando redes neuronales  UNIVERSIDAD DEL VALLE  Estado: Tesis concluida  Ingeniería de Sistemas  ,2011,  . Persona orientada: Eduard Satizabal Tascón  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • OSCAR FERNANDO BEDOYA LEIVA, Aplicación de técnicas de mezcla de expertos en problemas de clasificación sobre conjuntos de datos médicos  UNIVERSIDAD DEL VALLE  Estado: Tesis concluida  Ingeniería de Sistemas  ,2017,  . Persona orientada: Jessica Brand  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • OSCAR FERNANDO BEDOYA LEIVA, Predicción estructural de proteínas usando técnicas de clasificación  UNIVERSIDAD DEL VALLE  Estado: Tesis concluida  Ingeniería de Sistemas  ,2016,  . Persona orientada: Christian Charry  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • OSCAR FERNANDO BEDOYA LEIVA, Asistente virtual chatbot para la web de la Universidad del Valle  UNIVERSIDAD DEL VALLE  Estado: Tesis concluida  Ingeniería de Sistemas  ,2016,  . Persona orientada: Diego Giraldo  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • OSCAR FERNANDO BEDOYA LEIVA, Predicción de promotores en secuencias de ADN basado en árboles de decisión  UNIVERSIDAD DEL VALLE  Estado: Tesis concluida  Ingeniería de Sistemas  ,2011,  . Persona orientada: Alexander Mejía  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • OSCAR FERNANDO BEDOYA LEIVA, Modelo de predicción de promotores basado en redes neuronales  UNIVERSIDAD DEL VALLE  Estado: Tesis concluida  Ingeniería de Sistemas  ,2011,  . Persona orientada: Santiago Bustamante  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • OSCAR FERNANDO BEDOYA LEIVA, Predicción de la estructura secundaria de las proteinas utilizando árboles de decisión  UNIVERSIDAD DEL VALLE  Estado: Tesis concluida  Ingeniería de Sistemas  ,2009,  . Persona orientada: Claudia Ximena Mazo Vargas  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • OSCAR FERNANDO BEDOYA LEIVA, Desarrollo de un producto de software para la selección de conjuntos de estructuras proteícas PDS (Protein Data Selector)  UNIVERSIDAD DEL VALLE  Estado: Tesis concluida  Ingeniería de Sistemas  ,2009,  . Persona orientada: Ana Karina Velez  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • OSCAR FERNANDO BEDOYA LEIVA, Desarrollo de un agente para el videojuego Tetris basado en técnicas de Inteligencia artificial  UNIVERSIDAD DEL VALLE  Estado: Tesis concluida  Ingeniería de Sistemas  ,2014,  . Persona orientada: Joshua David Triana  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • OSCAR FERNANDO BEDOYA LEIVA, Desarrollo de una aplicación móvil para dispositivos Android para el canal de autogestión de Telefónica Móviles Colombia S.A.  UNIVERSIDAD DEL VALLE  Estado: Tesis concluida  Ingeniería de Sistemas  ,2013,  . Persona orientada: Diego Recalde  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajo de grado de maestría o especialidad clínica
  • OSCAR FERNANDO BEDOYA LEIVA, Integración multiescala entre los modelos climáticos globales y regionales mediante técnicas de inteligencia artificial  UNIVERSIDAD DEL VALLE  Estado: Tesis concluida  Maestría en Ingeniería  ,2018,  . Persona orientada: Wilmer Muñoz Herrera  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • OSCAR FERNANDO BEDOYA LEIVA, Método de clasificación estructural de proteínas usando una estrategia jerárquica  UNIVERSIDAD DEL VALLE  Estado: Tesis concluida  Ingeniería de Sistemas  ,2017,  . Persona orientada: Jessica Grajales  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
     

    Artículos

  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • OSCAR FERNANDO BEDOYA LEIVA, IRENE TISCHER, "Reducing dimensionality in remote homology detection using predicted contact maps" . En: Reino Unido 
    Computers in Biology and Medicine  ISSN: 0010-4825  ed: Elsevier Editora Ltda
    v.59 fasc. p.64 - 72 ,2015,  DOI: 
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • OSCAR FERNANDO BEDOYA LEIVA, IRENE TISCHER, "Remote homology detection of proteins using 3D models enriched with physicochemical properties" . En: Colombia 
    Ingeniería Y Competitividad  ISSN: 0123-3033  ed: Facultad De Ingenieria Universidad Del Valle
    v.17 fasc.1 p.75 - 84 ,2015,  DOI: 
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • OSCAR FERNANDO BEDOYA LEIVA, IRENE TISCHER, "Remote homology detection incorporating the context of physicochemical properties" . En: Reino Unido 
    Computers in Biology and Medicine  ISSN: 0010-4825  ed: Elsevier Editora Ltda
    v.45 fasc.1 p.43 - 50 ,2014,  DOI: 
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • OSCAR FERNANDO BEDOYA LEIVA, "Clasificación difusa para descubrir perfiles de usuarios en la web" . En: Colombia 
    Revista Educación En Ingeniería  ISSN: 1900-8260  ed: Asociacion Colombiana De Facultades De Ingenieria Acofi
    v.8 fasc.16 p.94 - 104 ,2013,  DOI: 
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • OSCAR FERNANDO BEDOYA LEIVA, EDUARD ALBERTO SATIZABAL TASCON, "NN-PRED: A Novel Consensus Secondary Structure Prediction Program Using Neural Networks" . En: Colombia 
    Uis Ingenierías  ISSN: 1657-4583  ed: Cefac Universidad Industrial De Santander
    v.12 fasc.1 p.51 - 59 ,2013,  DOI: 
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • OSCAR FERNANDO BEDOYA LEIVA, IRENE TISCHER, "Multi-class superfamily prediction using 3D models enriched with physicochemical properties" . En: Colombia 
    Ingeniería Y Competitividad  ISSN: 0123-3033  ed: Facultad De Ingenieria Universidad Del Valle
    v.18 fasc.2 p.65 - 74 ,2016,  DOI: 
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • OSCAR FERNANDO BEDOYA LEIVA, "Predicción estructural de proteínas usando técnicas de clasificación" . En: Colombia 
    Uis Ingenierías  ISSN: 1657-4583  ed: Cefac Universidad Industrial De Santander
    v.17 fasc. p.75 - 86 ,2018,  DOI: 
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • OSCAR FERNANDO BEDOYA LEIVA, "Remote protein homology detection using physicochemical properties" . En: Venezuela 
    Revista Eia  ISSN: 1794-1237  ed: ESCUELA DE INGENIERÍA DE ANTIOQUIA
    v.14 fasc.27 p.111 - 125 ,2017,  DOI: 
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • OSCAR FERNANDO BEDOYA LEIVA, "Remote-3DD: a new remote homology detection method that uses physicochemical properties" . En: Colombia 
    Revista Ingeniería Y Competitividad  ISSN: 2027-8284  ed: Centro Editorial De La Universidad Del Valle
    v.19 fasc.2 p.25 - 35 ,2017,  DOI: 
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • OSCAR FERNANDO BEDOYA LEIVA, "Construyendo modelos de exones basados en árboles de decisión paralelos a los ejes" . En: Colombia 
    Avances En Sistemas E Informática  ISSN: 1657-7663  ed: Universidad Nacional De Colombia Sede Medellin
    v.8 fasc.3 p.173 - 182 ,2011,  DOI: 
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • OSCAR FERNANDO BEDOYA LEIVA, CLAUDIA XIMENA MAZO, CLAUDIA XIMENA MAZO VARGAS, "PESPAD: una nueva herramienta para la predicción de la estructura secundaria de la proteína basada en árboles de decisión" . En: Colombia 
    Ingeniería Y Competitividad  ISSN: 0123-3033  ed: Facultad De Ingenieria Universidad Del Valle
    v.12 fasc.2 p.9 - 22 ,2010,  DOI: 
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • OSCAR FERNANDO BEDOYA LEIVA, SANTIAGO JOSE BUSTAMANTE MUNOZ, "CNN-Promoter, new consensus promoter prediction program based on neural networks" . En: Colombia 
    Revista Eia  ISSN: 1794-1237  ed: ESCUELA DE INGENIERÍA DE ANTIOQUIA
    v.15 fasc.1 p.153 - 164 ,2011,  DOI: 

    Proyectos

    Tipo de proyecto: Investigación, desarrollo e Innovación 
    Aplicación de redes neuronales para resolver problemas de clasificación sobre secuencias biológicas.
    Inicio: Agosto  2010 Fin: Agosto  2011 Duración 12
    Resumen

    Actualmente la Bioinformática se ocupa de problemas que van desde la identificación y análisis de motivos hasta el análisis de la formación de proteínas. Gran parte de los algoritmos que se utilizan en Bioinformática han sido propuestos por expertos en la parte de biología molecular que en muchos casos desconocen acerca de las fortalezas y debilidades que tienen las técnicas computacionales utilizadas. A pesar de que se han usado técnicas de Inteligencia Artificial en el campo de la Bioinformática, se continúa aun en el proceso de mejorar los resultados obtenidos con la aplicación de nuevas técnicas o realizar modificaciones sobre las mismas. Con esta propuesta de investigación se busca aplicar la técnica de redes neuronales para obtener modelos que permitan resolver dos problemas particulares en Bioinformática: la predicción de promotores y la predicción de estructura secundaria de la proteína. Al finalizar el proyecto se espera situar los modelos propuestos, en términos de sensitividad y especificidad para el caso de promotores y de exactitud de residuos para las proteínas, dentro del estado de arte actual relacionado con la predicción de secuencias biológicas.