Hoja de vida

Nombre Luis Fernando Rivera Serna
Nombre en citaciones RIVERA SERNA, LUIS FERNANDO
Nacionalidad Colombiana
Sexo Masculino

Formación Académica

  •  
  • Maestría/Magister Universidad De Manizales - Umanizales
    Maestría en Bioinformática y Biología Computacional
    Febrerode2016 - Marzode 2018
    Identification and characterization of biotechnological interest genes in banana weevil (Cosmopolites sordidus, Germar) transcriptome database
  •  
  • Pregrado/Universitario UNIVERSIDAD AUTONOMA DE MANIZALES
    Ingeniería de Sistemas y Telecomunicaciones
    Enerode1995 - de 2000
    Sistema de Información de apoyo al manejo de las compatencias en Taekwondo

    Formación Complementaria

  •  
  • Cursos de corta duración Arizona Genomics Institute
    Analisis de secuencias repetitivas
    Mayode2009 - Juliode 2009
  •  
  • Cursos de corta duración Universidad Nacional De La Plata
    Bioinformática
    Juliode2005 - Juliode 2005
  •  
  • Cursos de corta duración tIGER INSTITUD
    Bioinformática
    Juniode2006 - Agostode 2006

    Experiencia profesional

  •  
  • Biommit
    Dedicación: 10 horas Semanales Octubre de 2017 de

  •  
  • Kommit
    Dedicación: 10 horas Semanales Enero de 2015 Agosto de 2017

  •  
  • CENTRO DE BIOINFORMATICA Y BIOLOGIA COMPUTACIONAL DE COLOMBIA
    Dedicación: 40 horas Semanales Mayo de 2015 Enero de Actual

    Actividades de investigación
    -   Investigación y Desarrollo - Titulo:  Apoyo en la instalación de herramientas bioinformáticas para el análisis de secuencias genómicas Mayo 2015 Agosto 2019
  •  
  • Sierra Comunicaciones
    Dedicación: 3 horas Semanales Enero de 2001 Octubre de 2001

    Actividades de administración
    -  Miembro de consejo de centro - Cargo: Mantenimiento de Red Enero de 2001 Octubre de 2001
  •  
  • FEDERACIÓN NACIONAL DE CAFETEROS DE COLOMBIA - CENTRO NACIONAL DE INVESTIGACIONES DE CAFÉ (CENICAFÉ)
    Dedicación: 0 horas Semanales Octubre de 2001 Febrero de 2004

    Actividades de investigación
    -   Investigación y Desarrollo - Titulo:  Marzo 2004
    -   Investigación y Desarrollo - Titulo:  Portal Web de Cenicafé Mayo 2003 Febrero 2004
    -   Investigación y Desarrollo - Titulo:  Octubre 2001 Diciembre 2002
  •  
  • UNIVERSIDAD DE CALDAS
    Dedicación: 0 horas Semanales Enero de 2001 Octubre de 2001

    Actividades de administración
    -  Servicio Técnico Especializado - Cargo: Mantenimiento Redes Enero de 2001 Octubre de 2001
  •  
  • FEDERACIÓN NACIONAL DE CAFETEROS DE COLOMBIA - CENTRO NACIONAL DE INVESTIGACIONES DE CAFÉ (CENICAFÉ)
    Dedicación: 42 horas Mensuales Octubre de 2001 Febrero de 2004

    Actividades de administración
    -  Miembro de consejo de centro - Cargo: Desarrollo en el área Bioinformática Marzo de 2004 de
    -  Miembro de consejo de centro - Cargo: Desarrollo Portal Web de Cenicafé Mayo de 2003 Febrero de 2004
    -  Miembro de consejo de centro - Cargo: Desarrollo de Herramientas en Bioinformática Octubre de 2001 Abril de 2003
  •  
  • UNIVERSIDAD DE CALDAS
    Dedicación: 0 horas Semanales Marzo de 2001 Junio de 2001

    Actividades de administración
    -  Servicio Técnico Especializado - Cargo: Configuración Modems Banda Base Marzo de 2001 Junio de 2001
  •  
  • UNIVERSIDAD DE CALDAS
    Dedicación: 15 horas Semanales Marzo de 2001 Junio de 2001

    Actividades de administración
    -  Miembro de consejo de centro - Cargo: Configuración Modems Banda Base Marzo de 2001 Junio de 2001
  •  
  • HERRAMIENTAS AGRICOLAS S.A.
    Dedicación: 20 horas Semanales Enero de 2000 Junio de 2000

    Actividades de administración
    -  Miembro de consejo de centro - Cargo: Asesor en Sistemas Enero de 2000 Junio de 2000
  •  
  • Liceo Mixto Malhabar
    Dedicación: 6 horas Semanales Marzo de 1996 Mayo de 1996

    Actividades de administración
    -  Miembro de consejo de centro - Cargo: Curso Básico de Sistemas Marzo de 1996 Mayo de 1996
    Actividades de docencia
    -   Pregrado - Nombre del curso:  Curso Sistemas Básico,  Marzo 1996 Mayo 1996

    Áreas de actuación

  •  Ciencias Naturales -- Computación y Ciencias de la Información -- Ciencias de la Información y Bioinformática
  •  Ingeniería y Tecnología -- Ingenierías Eléctrica, Electrónica e Informática -- Ingeniería de Sistemas y Comunicaciones
  • Idiomas

      Habla Escribe Lee Entiende
  •  Español
  • Bueno Bueno Bueno Bueno
  •  Portugués
  • Aceptable Aceptable
  •  Inglés
  • Bueno Bueno Bueno Bueno

    Líneas de investigación

  •  Bioinformática, Activa:Si
  •  Desarrollo de Herramientas en Bioinformática, Activa:Si
  •  Desarrollo y adaptación de Software para análisis de secuencias de ADN, Activa:Si
  •  Instalacion de Servidores de Bioinformática, Activa:Si
  •  Instalación de Servidores en Cluster para alto procesamiento, Activa:Si
  •  Implementación de laboratorios de Bioinformática, Activa:Si
  •  Análisis de secuencias proteicas y rutas metabolicas, Activa:Si
  • Reconocimientos

  • Tesis Meritoria,Universidad De Manizales - Umanizales - Marzode 2018
  •  
    Los ítems de producción con la marca corresponden a productos avalados y validados para la última Convocatoria Nacional para el Reconocimiento y Medición de Grupos de Investigación, Desarrollo Tecnológico o de Innovación y para el Reconocimiento de Investigadores del SNCTeI

    Cursos de corta duración

  • Producción técnica - Cursos de corta duración dictados - Extensión extracurricular
  • LUIS FERNANDO RIVERA SERNA, Capacitación en bioinformática dirigida a los investigadores del proyecto del genoma del café., Finalidad: Capacitación en bioinformática dirigida a los investigadores del proyecto del genoma del café. . En: Colombia  ,2006,  ,FEDERACIÓN NACIONAL DE CAFETEROS DE COLOMBIA - CENTRO NACIONAL DE INVESTIGACIONES DE CAFÉ (CENICAFÉ).  participación: Docente , 0 semanas 
  • Producción técnica - Cursos de corta duración dictados - Extensión extracurricular
  • LUIS FERNANDO RIVERA SERNA, Capacitación en Linux, PERL y PostgreSQL básico dirigida a los investigadores del proyecto del genoma del café., Finalidad: Capacitación en Linux, PERL y PostgreSQL básico dirigida a los investigadores del proyecto del genoma del café. . En: Colombia  ,2003,  ,FEDERACIÓN NACIONAL DE CAFETEROS DE COLOMBIA - CENTRO NACIONAL DE INVESTIGACIONES DE CAFÉ (CENICAFÉ).  participación: Docente , 2 semanas 
  • Producción técnica - Cursos de corta duración dictados - Extensión extracurricular
  • LUIS FERNANDO RIVERA SERNA, Capacitación en Bioinformática dirigida a los investigadores del proyecto del genoma de la papa de la U. Nacional de Colombia, Finalidad: Capacitación en Bioinformática dirigida a los investigadores del proyecto del genoma de la papa de la U. Nacional de Colombia . En: Colombia  ,2007,  ,FEDERACIÓN NACIONAL DE CAFETEROS DE COLOMBIA - CENTRO NACIONAL DE INVESTIGACIONES DE CAFÉ (CENICAFÉ).  participación: Docente , 2 semanas 
     

    Eventos científicos

    1 Nombre del evento: II CONGRESO NACIONAL DE BIOTECNOLOGIA - 2004  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Nacional  Realizado el:2004-07-08 00:00:00.0,  2004-07-15 00:00:00.0   en BOGOTÁ, D.C.   - Camara de Comercio, Bogotá D.C.  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Implementación de un Sistema en cluster para el laboratorio de bioinformatica en Cenicafe. Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Ponencia
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:FEDERACIÓN NACIONAL DE CAFETEROS DE COLOMBIA - CENTRO NACIONAL DE INVESTIGACIONES DE CAFÉ (CENICAFÉ) Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: LUIS FERNANDO RIVERA SERNA Rol en el evento: Ponente
    2 Nombre del evento: I National Telecommunications Research Congress,   Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Nacional  Realizado el:2002-07-08 00:00:00.0,  2002-07-12 00:00:00.0   en BOGOTÁ, D.C.   -  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:n RIVERA, L.F. Coffeebank Biological Information System Tipo de producto:Demás trabajos - Demás trabajos - Póster
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:FEDERACIÓN NACIONAL DE CAFETEROS DE COLOMBIA - CENTRO NACIONAL DE INVESTIGACIONES DE CAFÉ (CENICAFÉ) Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: LUIS FERNANDO RIVERA SERNA Rol en el evento: Ponente
    3 Nombre del evento: ENCUENTRO de Investigación sobre Tecnologías de Información Aplicadas a la solución de Problemas   Tipo de evento: Encuentro  Ámbito: Nacional  Realizado el:2014-07-01 00:00:00.0,  2014-07-01 00:00:00.0   en MEDELLÍN   - Universidad Nacional de Colombia  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:ENCUENTRO de Investigación sobre Tecnologías de Información Aplicadas a la solución de Problemas Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Conferencia
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:FEDERACIÓN NACIONAL DE CAFETEROS DE COLOMBIA - CENTRO NACIONAL DE INVESTIGACIONES DE CAFÉ (CENICAFÉ) Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: LUIS FERNANDO RIVERA SERNA Rol en el evento: Ponente
    4 Nombre del evento: Cuarto Congreso Colombiano de Biología Computacional (IV CCBCOL)  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Internacional  Realizado el:2017-09-13 00:00:00.0,  2017-09-15 00:00:00.0   en CALI   - Hotel Spiwak en la Ciudad de Santiago de Cali , COLOMBIA  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:In silico identification of antimicrobial peptides from Banana Weevil (Cosmopolites Sordidus, Germar ) transcriptome Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Ponencia
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Universidad De Manizales - Umanizales Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: LUIS FERNANDO RIVERA SERNA Rol en el evento: Ponente magistral
    5 Nombre del evento: International Plant & Animal Genome Conference XXVII-PAG 2019  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Internacional  Realizado el:2019-01-12 00:00:00.0,  2019-01-16 00:00:00.0   en San Diego California   - Hotel Circle North San Diego, CA 92108  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:PE1230 In silico Identification of Antimicrobial Peptides from Cannabis sativa Var. Mango Biche and Moringa Oleifera Genome Tipo de producto:Demás trabajos - Demás trabajos - Póster
    • Nombre del producto:PO1229 Antioxidant Activity Screening from Cannabis sativa and Moringa Oleifera through in silico Cross Reference Proteins Databases Tipo de producto:Demás trabajos - Demás trabajos - Póster
    • Nombre del producto:PO1085 Genome-Scale Metabolic Reconstructions of Cannabis sativa and Moringa oleifera as Potential Resources in Cosmetic Bioprospecting Tipo de producto:Demás trabajos - Demás trabajos - Póster
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación, Colciencias Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    • Nombre de la institución:CENTRO DE BIOINFORMATICA Y BIOLOGIA COMPUTACIONAL DE COLOMBIA Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: ADRIANA MARIA GALLEGO RUA Rol en el evento: Ponente
    • Nombre: ASTRID CATALINA ALVAREZ YELA Rol en el evento: Asistente
    • Nombre: JORGE WILLIAM ARBOLEDA VALENCIA Rol en el evento: Asistente
    • Nombre: JULIANA BOTERO CARDONA Rol en el evento: Ponente
    • Nombre: KELLY JOHANA BOTERO OROZCO Rol en el evento: Ponente
    • Nombre: LUIS FERNANDO RIVERA SERNA Rol en el evento: Ponente magistral

    Artículos

  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • LUIS FERNANDO RIVERA SERNA, "Fifteen million years of evolution in the Oryza genus shows extensive gene family expansion." . En: Colombia 
    Molecular Plant  ISSN: 1752-9867  ed: Elsevier Science Inc
    v.7 fasc.4 p.642 - 656 ,2014,  DOI:  http://dx.doi.org/10.1093/mp/sst149
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • LUIS FERNANDO RIVERA SERNA, "Desarrollo de un sistema de información para el manejo de datos moleculares en café." . En: Colombia 
    Revista De La Academia Colombiana De Ciencias Exactas, Físicas Y Naturales  ISSN: 0370-3908  ed: Universidad Nacional De Colombia Sede Bogota
    v.32 fasc.124 p.317 - 324 ,2008,  DOI: 
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • LUIS FERNANDO RIVERA SERNA, "Annotation of a hybrid partial genome of the coffee rust (Hemileia vastatrix) contributes to the gene repertoire catalog of the Pucciniales." . En: Estados Unidos 
    Frontiers in Plant Science  ISSN: 1664-462X  ed: Frontiers Media S.A.
    v.5 fasc. p.18 - 25 ,2014,  DOI: 10.3389/fpls.2014.00594
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • LUIS FERNANDO RIVERA SERNA, "Identificación y distribución cromosómica de secuencias relacionadas con retrotransposones del tipo copia en el genoma del café (Coffea L.)" . En: Colombia 
    Agronomia Colombiana  ISSN: 0120-9965  ed: Universidad Nacional De Colombia Facultad De Agronomia
    v.31 fasc.3 p.22 - 28 ,2013,  DOI: 
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • LUIS FERNANDO RIVERA SERNA, "Genomes of 13 domesticated and wild rice relatives highlight genetic conservation, turnover and innovation across the genus Oryza" . En: Estados Unidos 
    Nature Genetics  ISSN: 1546-1718  ed: Nature Publishing Group
    v.50 fasc.NA p.285 - 296 ,2018,  DOI: 10.1038/s41588-018-0040-0

    Informes técnicos

  • Producción técnica - Consultoría Científico Tecnológica e Informe Técnico - Informe técnico
  • LUIS FERNANDO RIVERA SERNA, DANY LEON MOLINA ORREGO, KELLY JOHANA BOTERO OROZCO, ADRIANA MARIA GALLEGO RUA, JULIANA BOTERO CARDONA, JORGE WILLIAM ARBOLEDA VALENCIA, ASTRID CATALINA ALVAREZ YELA, Informe de Avance No.4 "Bioprospección de metabolitos para la industria cosmética en la era de la biología computacional, Nombre comercial: , contrato/registro: 470-2016, . En: Colombia,  ,2019,  meses   p.0 
    Palabras:
    Bioinformática, metabolic, network, Ciencias de la Información y Bioinformática, Análisis de datos genómicos, Bioinformática y ciencias ómicas, Bioprospección,
    Areas:
    Ciencias Naturales -- Computación y Ciencias de la Información -- Ciencias de la Información y Bioinformática, Ciencias Naturales -- Computación y Ciencias de la Información -- Ciencias de la Computación,
  • Producción técnica - Consultoría Científico Tecnológica e Informe Técnico - Informe técnico
  • LUIS FERNANDO RIVERA SERNA, ADRIANA MARIA GALLEGO RUA, JORGE WILLIAM ARBOLEDA VALENCIA, INFORME FINAL ANALISIS BIOINFORMATICO PROYECTO BIOPELÍCULAS BACTERIANAS DE TUBO¬OROTRAQUEAL (SOT), Nombre comercial: , contrato/registro: 725-2015, . En: Colombia,  ,2018,  meses   p.50 
  • Producción técnica - Consultoría Científico Tecnológica e Informe Técnico - Informe técnico
  • LUIS FERNANDO RIVERA SERNA, DANY LEON MOLINA ORREGO, KELLY JOHANA BOTERO OROZCO, JULIANA BOTERO CARDONA, JORGE WILLIAM ARBOLEDA VALENCIA, ASTRID CATALINA ALVAREZ YELA, Informe de Avance No.3 "Bioprospección de metabolitos para la industria cosmética en la era de la biología computacional", Nombre comercial: , contrato/registro: 470-2016, . En: Colombia,  ,2018,  meses   p.0 
    Palabras:
    Análisis de datos genómicos, Bioinformática, Bioinformática y ciencias ómicas, Bioprospección, Ciencias de la Información y Bioinformática, metabolic, network,
    Areas:
    Ciencias Naturales -- Computación y Ciencias de la Información -- Ciencias de la Información y Bioinformática, Ciencias Naturales -- Computación y Ciencias de la Información -- Ciencias de la Computación,

    Proyectos

    Tipo de proyecto: Extensión y responsabilidad social CTI 
    Portal Web de Cenicafé
    Inicio: Enero  2003 Duración 
    Resumen


    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Biopelículas bacterianas de tuboorotraqueal y su sensibilidad antimicrobiana en la UCI médica en Bogotá, Colombia
    Inicio: Noviembre  2015 Fin: Noviembre  2018 Duración 
    Resumen

    La investigación ambiental de comunidades microbianas y microbiomas se ha revolucionado gracias al desarrollo de tecnologías de secuenciamiento de amplicones. En el secuenciamiento de amplicones un locus genético particular, en este caso el gen 16s en bacteria, es amplificado a partir del DNA extraído de una comunidad bacteriana de interés y luego secuenciado con tecnologías de nueva generación. Gracias a esta técnica se elimina la necesidad de cultivar los microorganismos para detectar su presencia; por lo anterior, la tecnología desarrollada en el presente informe plantea un proceso costo- efectivo en la identificación de comunidades microbianas. El presente informe entregado por BIOS, con participación del equipo técnico de la corporación CORPOGEN recoge el análisis de comunidades microbianas obtenidas de biopelículas de tubo orotraqueal en pacientes con diagnóstico de presencia/ausencia de neumonía. Adicionalmente, se estableció un flujo de trabajo y un directorio compartido en Google drive para el seguimiento de las actividades de análisis previamente discutidas entre los equipos de trabajo. En dicho directorio reposan todos los anexos y resultados de cada una de las fases de análisis, los cuales pueden ser visualizados directamente en la plataforma interactiva web de QIIME2.

    Tipo de proyecto: Investigación, desarrollo e Innovación 
    Bioprospección de metabolitos para la industria cosmética en la era de la biología computacional
    Inicio: Febrero  2017 Duración 
    Resumen

    Este proyecto pretende explorar el potencial de las plantas de uso tradicional en Colombia, combinando metodologías tradicionales de bioprospección (in vitro) con análisis bioinformáticos (in silico), para identificar de forma precisa la producción biológica de metabolitos de interés para la industria cosmética. En conjunto con 4 empresas del sector cosmético, buscamos encontrar soluciones nuevas a problemas tradicionales de la industria, usar el conocimiento científico para resolver necesidades de las empresas y reconocer el poder del saber tradicional cultural para generar soluciones innovadoras. Este proyecto contribuirá al fortalecimiento de la investigación, el desarrollo tecnológico, la innovación de productos cosméticos y la implementación de proyectos de bioprospección a nivel industrial. Objetivo General: Generar capacidades tecnológicas y científicas en bioprospección, estableciendo un modelo de análisis in vitro e in silico del metabolismo en plantas de uso tradicional, para establecer el potencial de producción de metabolitos de interés y su transferencia a la industria cosmética. Impacto: La incorporación de nuevos productos de origen natural en empresas del sector cosmético, abre para ellas nuevos nichos de mercado a nivel nacional e internacional, debido a la incorporación de nuevas tecnologías para el desarrollo de productos innovadores BIOS y las entidades aliadas podrán transferir la metodología propuesta y la información generada en este proyecto a otros sectores productivos (farmacéutico, industria de alimentos), generando soluciones a partir de la biodiversidad del país, de una manera sostenible Para actualizar la información de un proyecto tenga en cuenta: 1. Usted debe ser el investigador principal 2. Es necesario incluir la información de financiación, si aplica. Para esto si en la información del proyecto dice que es un proyecto solidario, por favor desvincule la institución que tenga registrada, de este modo el sistema le permitirá ingresar toda la información que Colciencias solicita para los proyectos. 3. Si la financiación es interna sólo debe ingresar una institución participante.

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Creación plataforma Bioinformática en Cenicafe
    Inicio: Enero  2005 Duración 
    Resumen

    Conformación de una plataforma computacional par el análisis y visualización de los datos transcriptómicos y genómicos del café.

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    The 9 Billion People Question
    Inicio: Febrero  2011 Fin: Mayo  2013 Duración 
    Resumen

    "The world¿s population will grow to more than 9 billion in less than 40 years. How can farmers grow enough food to feed this population in a more sustainable and environmentally friendly way? Research is now underway to create the next generation of green revolution crops - the so called ¿green super crops¿ where ¿super¿ means a doubling or tripling of yields, and ¿green¿ means a reduction in the use of water, fertilizer, and pesticides etc. The 9 billion-people question (9BPQ) is one of the world¿s most pressing issues of our time. Our society must realistically solve this question within the next 25 years if we are to be able to supply farmers with the seeds required to feed the future. This lecture will explore the many facets of how to feed the world and will propose a bold solution to help solve the 9BPQ". - University of Arizona College of Science

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Identificación de genes de interés biotecnológico en diferentes especies
    Inicio: Enero  2017 Fin: Mayo  2018 Duración 
    Resumen

    Por medio del uso de algoritmos de maquinas de aprendizaje , modelos ocultos de Markov (HMM) y herramientas de alineamiento. Se crearon una serie de pipelines que permiten identificar peptidos antimicrobianos en una gran variedad de especies . Asi mismo se consolida una nueva fuente de bases de datos con los nuevos candidatos encontrados.