Formación Académica

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Líneas de investigación

Reconocimientos

Trabajos dirigidos/tutorías

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, INTERACCIONES INTERMOLECULARES DE LAS PROTEINAS CONTENIDAS EN LA VINAZA DE CAÑA DE AZUCAR.  UNIVERSIDAD SANTIAGO DE CALI  Estado: Tesis en curso  Quimico  ,2013,  . Persona orientada: Juan Gabriel Tobon  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, Dinamica molecular de un pentamero de pirrol en la deteccion de L-Triptofano  UNIVERSIDAD SANTIAGO DE CALI  Estado: Tesis concluida  Quimica  ,2016,  . Persona orientada: Maribel Holguin Trujillo  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, Interacciones intermoleculares de la proteina de membrana ARF*GTP con los componentes mayoritarios de la vinaza de caña de azúcar: Potasio y Glicerol  UNIVERSIDAD SANTIAGO DE CALI  Estado: Tesis concluida  Quimica  ,2016,  . Persona orientada: Fernando Bonilla Millan   , Dirigió como: Tutor principal,  meses  

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, Interacciones intermoleculares de la proteina de membrana ARF*GTP con los componentes mayoritarios de la vinaza de caña de azúcar: Potasio y Glicerol  UNIVERSIDAD SANTIAGO DE CALI  Estado: Tesis concluida  Quimica  ,2016,  . Persona orientada: Jhon Alexander Rodriguez  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, Interacciones intermoleculares del Aliteserin en membranas vesiculares  UNIVERSIDAD SANTIAGO DE CALI  Estado: Tesis en curso  Quimica  ,2018,  . Persona orientada: Angie Dayanna Carrillo Paez  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, DETERMINACIÓN MOLECULAR Y SUPRAMOLECULAR DEL COMPUESTO 2-(((5-TERT-BUTIL)-2-(4-(METIL (Λ1-OXINIL) AMINO) CICLOHEXIL) PIRAZOLIDIN-3-IL) AMINO) METIL) CICLOHEXAN-1-OL  UNIVERSIDAD SANTIAGO DE CALI  Estado: Tesis en curso  Quimica  ,2018,  . Persona orientada: Elizabeth Castro Giraldo   , Dirigió como: Coturor/asesor,  meses  

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, ANÁLISIS ESTRUCTURAL Y SUPRAMOLECULAR DEL COMPUESTO (E)-3',6'-DIHIDROXI-1-((ISOQUINOLIN-3-YL METILENO) AMINO) SPIRO[ISOIDOLINA-1,9'-XANTENO]-3-ONA  UNIVERSIDAD SANTIAGO DE CALI  Estado: Tesis en curso  Quimica  ,2018,  . Persona orientada: Camila Cardona Restrepo   , Dirigió como: Coturor/asesor,  meses  

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, Sintesis de peptidos cationicos e Interacciones Péptido - Membrana  UNIVERSIDAD SANTIAGO DE CALI  Estado: Tesis en curso  Quimica  ,2018,  . Persona orientada: Lina Fernanda Vargas Carabali  , Dirigió como: Coturor/asesor,  meses  

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, Dinámica molecular de la interacción de L-Triptofano en un complejo de cuatro cadenas de oligomeros de polipirroles.  UNIVERSIDAD SANTIAGO DE CALI  Estado: Tesis en curso  Quimica  ,2018,  . Persona orientada: Pablo Torres Agualimpia  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, MODELADO, DINÁMICA MOLECULAR Y POLIMERIZACION DEL COMPLEJO ENTRECRUZADO DE POLY STYRENE ACRYLATE ESTER - POLYVINYL ACETATE Y STEARYLAMINE - POLY (ETHYLENE OXIDE)  UNIVERSIDAD SANTIAGO DE CALI  Estado: Tesis en curso  Quimica  ,2018,  . Persona orientada: Sergio Alejandro Jaramillo Zapata  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  

Jurado en comités de evaluación

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, LUZ DARY RODRIGUEZ, YOLANDA ARCILA, ANGEL MARIA GOMEZ, GUSTAVO PINZON, CARLOS BORRERO, Titulo: TRABAJO DE GRADO PARA OPTAR EL TITULO DE MEDIO TECNICO EN HERRAMIENTAS PRODUCTIVAS, TEMA: SOFTWARE INTERACTIVO CALIWEB. Tipo de trabajo presentado:  en:  Institución Educativa Manuel María Mallarino  programa académico Informatica  Nombre del orientado: Elizabeth Ayala, Lady C. Grajales y Diana P. Ibarguen.  
Areas:
Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Bioquímica y Biología Molecular, Ciencias Sociales -- Ciencias de la Educación -- Educación General (Incluye Capacitación, Pedagogía),
Sectores:
Educación,

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, Titulo: Analisis de celulosa y lignina en heces de Cryptotermes brevis Tipo de trabajo presentado: Trabajo de grado/tesis en:  UNIVERSIDAD SANTIAGO DE CALI  programa académico Quimica  Nombre del orientado: Hover Alberto Vivas SAlamanca y Gustavo Adolfo Melan  

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, Titulo: Efecto del peptido Alyteserin 1C sobre modelos de membrana que imitan la membrana de bacterias Gram-negativas Tipo de trabajo presentado: Proyecto de grado/Tesis en:  UNIVERSIDAD SANTIAGO DE CALI  programa académico Quimica  Nombre del orientado: Kevin Sanchez Arias  

Participación en comités de evaluación

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, Acreditacion en alta calidad del Programa de Quimica
en:  UNIVERSIDAD SANTIAGO DE CALI 

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, Electroquimica Aplicada: Materiales y Corrosión
en:  UNIVERSIDAD SANTIAGO DE CALI 

Par evaluador

Ámbito: Internacional  Par evaluador de: Material para publicación científica  Revista: Computers In Biology And Medicine,  2015,  Enero  

Ámbito: Internacional  Par evaluador de: Proyecto  Institución: UNIVERSIDAD SANTIAGO DE CALI,  2015,  Marzo  

Ámbito: Nacional  Par evaluador de: Proyecto  Institución: UNIVERSIDAD SANTIAGO DE CALI,  2014,  Noviembre  

Ámbito: Nacional  Par evaluador de: Proyecto  Institución: UNIVERSIDAD SANTIAGO DE CALI,  2018,  Octubre  

Ámbito: Internacional  Par evaluador de: Proyecto  Institución: UNIVERSIDAD SANTIAGO DE CALI,  2017,  Julio  

Ámbito: Internacional  Par evaluador de: Proyecto  Institución: UNIVERSIDAD SANTIAGO DE CALI,  2017,  Julio  

Ámbito: Internacional  Par evaluador de: Proyecto  Institución: UNIVERSIDAD SANTIAGO DE CALI,  2017,  Julio  

Eventos científicos

Redes de conocimiento especializado

Nombre de la red Asociación Colombiana de Electroquimica  Tipo de redReal,  Creada el:2018-10-10 00:00:00.0,    en CALI   con participantes 

Nombre de la red Red Colombiana de Nanociencia y Nanotecnología  Tipo de redReal,  Creada el:2016-02-10 00:00:00.0,    en BOGOTÁ, D.C.   con participantes 

Estrategias pedagógicas para el fomento a la CTI

Nombre de la estrategia Semillero de Investigacion en Modelamiento y Dinamica Molecular (MODIM)  Inicio enMarzo - 2018,  Finalizó en :Marzo - , 

Nombre de la estrategia Laboratorio de Dinamica Molecular (LADIM)  Inicio enEnero - 2017,  Finalizó en :Enero - , 

Artículos

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, CRISTHIAN VELASQUEZ BOLIVAR, "BIODEGRADACION DE LA VINAZA, UTILIZANDO BAGACILLO DE CAÑA Y BOVINAZA" . En: Colombia 
Aluna  ISSN: 1657-2386  ed: EDITORIAL USC
v.2 fasc. p.111 - 116 ,2004,  DOI: 
Sectores:
Fabricación de coque, refinado de petróleo, elaboración de combustibles nucleares y producción de alcohol - Producción de alcohol,

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, "BIOTRANSFORMACION DE LA VINAZA Y EL BAGACILLO DE CAÑA DE AZUCAR, UTILIZANDO BOVINAZA COMO FUENTE DE MICROORGANISMOS" . En: Colombia 
Catalogo De Investigaciones  ISSN: 1900-432X  ed: 
v.1 fasc. p.42 - 42 ,2005,  DOI: 
Palabras:
Biotransformación, Vinaza, Bagacillo,
Sectores:
Fabricación de productos químicos,

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, "CRECIMIENTO DEL GEOTRICHUM SP EN DIFERENTES MEZCLAS CON VINAZA DE CAÑA DE AZUCAR" . En: Colombia 
Catalogo De Investigaciones  ISSN: 1900-432X  ed: 
v.1 fasc. p.41 - 41 ,2005,  DOI: 

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, "PRODUCCION DE PULPA DE PAPEL DE RESIDUOS DE PLATANO" . En: Colombia 
Catalogo De Investigaciones  ISSN: 1900-432X  ed: 
v.1 fasc. p.11 - 11 ,2005,  DOI: 

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, "ACTIVIDAD ANTIMICOTICA DE TRES ESPECIES VEGETALES DEL VALLE DEL CAUCA" . En: Colombia 
Catalogo De Investigaciones  ISSN: 1900-432X  ed: 
v.1 fasc. p.19 - 20 ,2005,  DOI: 

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, TIM CLARK, "Caracterización de la proteína transductora de señal AmtR" . En: Colombia 
Ingenium  ISSN: 0124-7492  ed: UNIVERSIDAD DE SAN BUENAVENTURA
v.7 fasc.15 p.11 - 26 ,2013,  DOI: 

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, "Molecular dynamics of the interaction of l-tryptophan with polypyrrole oligomers" . En: Colombia 
Computational and Theoretical Chemistry  ISSN: 2210-271X  ed: Elsevier
v.1147 fasc.N/A p.29 - 34 ,2019,  DOI: 10.1016/j.comptc.2018.11.012

JOSE FERNANDO ONATE GARZON, OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, "Evaluation of the Antimicrobial Activity of Cationic Peptides Loaded in Surface-Modified Nanoliposomes against Foodborne Bacteria" . En: Suiza 
International Journal of Molecular Sciences  ISSN: 1422-0067  ed: MDPI AG
v.20 fasc.3 p.3 - 3 ,2019,  DOI: 10.3390/ijms20030680

Libros

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, "La contaminación industrial de aguas: Una mirada microbiológica y molecular." En: Colombia 2018.  ed:EDITORIAL USC  ISBN: 978-958-5522-37-4   v. pags. 

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, "La contaminación industrial de aguas: Una mirada microbiológica y molecular." En: Colombia 2018.  ed:EDITORIAL USC  ISBN: 978-958-5522-38-1  v. pags. 

Capitulos de libro

Documentos de trabajo

WALTER TORRES HERNANDEZ, OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, CESAR ALBERTO ARIZABALETA IBARBO, "Dinámica molecular de un pentámero de pirrol en la detección de L-triptófano" En: . 2018. p.

Normas y Regulaciones

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, Acuerdo Consejo Superior Universitario CS 08 - POR MEDIO DEL CUAL SE MODIFICAN LOS ARTICULOS 19, 24, 43, Y SE ELIMINAN LOS ARTICULOS 44 Y 46 de los Estatutos Generales de la Universidad Santiago de Cali, Nombre comercial: , contrato/registro: , . En: Colombia,  ,2016,  .ed:   meses   p.  .regulación:   .tipo:  

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, Acuerdo Consejo Superior Universitario CS 17, del 30 de Noviembre de 2016,- POR MEDIO DEL CUAL SE REFORMA EL ESTATUTO GENERAL DE LA UNIVERSIDAD SANTIAGO DE CALI EN LOS TITULOS III, IV, V., Nombre comercial: , contrato/registro: , . En: Colombia,  ,2016,  .ed:   meses   p.  .regulación:   .tipo:  

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, Acuerdo Consejo Superior Universitario CS 006 - POR MEDIO DEL CUAL SE REFORMA EL REGLAMENTO ESTUDIANTIL DE LA UNIVERSIDAD SANTIAGO DE CALI., Nombre comercial: , contrato/registro: , . En: Colombia,  ,2017,  .ed:   meses   p.  .regulación:   .tipo:  

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, Acuerdo Consejo Superior Universitario CS 18 - POR MEDIO DEL CUAL SE REFORMA EL CAPITO VI, ARTICULO 39 DEL REGLAMENTO PROFESORAL DE LA UNIVERSIDAD SANTIAGO DE CALI., Nombre comercial: , contrato/registro: , . En: Colombia,  ,2016,  .ed:   meses   p.  .regulación:   .tipo:  

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, Acuerdo Consejo Superior Universitario CS 01 - POR MEDIO DEL CUAL SE REFORMA EL CAPITULO II, ARTICULO 4 DEL REGLAMENTO PROFESORAL DE LA UNIVERSIDAD SANTIAGO DE CALI., Nombre comercial: , contrato/registro: , . En: Colombia,  ,2017,  .ed:   meses   p.  .regulación:   .tipo:  

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, Acuerdo Consejo Superior Universitario CS 02, de 16 de Junio de 2016,- POR MEDIO DEL CUAL SE REGLAMENTA LA FUNCION SUSTANTIVA DE EXTENSION Y PROYECCION SOCIAL DE LA UNIVERSIDAD SANTIAGO DE CALI., Nombre comercial: , contrato/registro: , . En: Colombia,  ,2016,  .ed:   meses   p.  .regulación:   .tipo:  

Informes de investigación

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, Avance de Investigación del proyecto: Interacciones intermoleculares de la proteína de membrana Arf*GTP con Potasio y Glicerol, componentes mayoritarios de la Vinaza de Caña de Azúcar. . En: ,  ,2017, 

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, INFORME DE EJECUCIÓN DE PROYECTOS DE INVESTIGACIÓN: Actividad biológica de péptidos antimicrobianos e interacciones péptido membrana . En: ,  ,2018, 

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, INFORME DE EJECUCIÓN DE PROYECTOS DE INVESTIGACIÓN (AVANCE): Actividad biológica de péptidos antimicrobianos e interacciones péptido membrana . En: ,  ,2018, 

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, SÍNTESIS DE PÉPTIDOS CATIÓNICOS . En: ,  ,2018, 

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, Interacciones Péptido - Membrana 1 . En: ,  ,2018, 

OSCAR EDUARDO ROJAS ALVAREZ, Interacciones Péptido - Membrana 2 . En: ,  ,2018, 

Proyectos

Tipo de proyecto: Investigación, desarrollo e Innovación 
Uso de la Pasta de Ají, Extractos y Aceites Esenciales como Repelente de Insectos en Cultivos Orgánicos
Inicio: Junio  2008 Fin proyectado: Junio  2009 Duración 12
Resumen

Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
Crecimiento del hongo geotrichum sp en diferentes mezclas con vinaza de caña de azucar
Inicio: Enero  2004 Duración 6
Resumen

Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
Biodegradación de la vinaza y el bagacillo de caña de azucar utilizando bovinaza como fuente de microorganismos
Inicio: Enero  2002 Fin proyectado: Enero  2004 Fin: Noviembre  2004 Duración 24
Resumen

Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
Desarrollo de alternativas decapantes en cobre y laton
Inicio: Enero  2000 Duración 
Resumen

Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
MODELADO, DINÁMICA MOLECULAR Y POLIMERIZACION DEL LA MOLECULA ENTRECRUZADA DE PDMS - TEOS
Inicio: Junio  2018 Duración 
Resumen

En el presente trabajo de investigación, se realizará la modelación y validación in silico de las estructuras moleculares individuales de: poly styrene acrylate ester, Polyvinyl acetate, Stearylamine y Ethylene oxide, con el fin de Demostrar afinidades, interacciones y trayectorias intermoleculares del complejo entrecruzado de poly styrene acrylate ester - polyvinyl acetate y stearylamine - ethylene oxide, mezcla que se utiliza en las construcciones de carreras en donde mejora la resistencia del esfuerzo a la deformación y la permeabilidad de un suelo activado con la mezcla de polímeros entrecruzados. Ya que una carretera en mal estado dificulta el acceso al territorio, por lo tanto a servicios básicos y la movilidad vehicular. También acrecienta el consumo de combustible de los vehículos hasta un 34% y disminuye la vida útil de los vehículos hasta un 25%. Una vía en mal estado supone además un aumento de hasta un 34% de las emisiones de gases de efecto invernadero, con sus consecuentes problemas medioambientales y riesgos para la salud. 1 Es por eso, que entrecruzamiento de esta mezcla de polímeros una tecnología con propiedades características de un material estructural para la construcción de todo tipo de viabilidades (calles, carreteras, caminos mineros, vías férreas, aeropuertos). Esta tecnología cumple los lineamientos de sustentabilidad, economía, resistencia a cambios de temperaturas, una vida útil no menor de 30 años y amigable con el medio ambiente 2; para cumplir el objetivo se debe estudiar su posible estructura química, tipo de enlace, modelar la sustancia. Esta investigación se desarrollará en la universidad Santiago de Cali, en las instalaciones del laboratorio de dinámica molecular (LADIM).

Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
Evaluación Molecular de los Usos Industriales y Agrícolas de la Vinaza de la Caña de Azúcar.
Inicio: Enero  2015 Duración 
Resumen

La súper producción de alcohol carburante en Colombia, ligada a la Ley 693 de 2001 y la resolución 41072 del 30 de Septiembre de 2015 del Ministerio de Minas y Energía, actualmente está permitiendo vertir al medio ambiente aproximadamente 13.365 millones de litros por día de vinaza de caña de azúcar como subproducto de la industria alcoquimica y azucarera, gran parte de esta cifra está siendo usada controladamente en la producción de 800 Toneladas diarias de compost por la industria agrícola como agente fertilizante y remediador del pH en suelos de cultivo (Revista Tecnicaña No. 28, Julio 2012), todo lo anterior como respuesta pronta de la Industria a la producción elevada de vinaza. Sin embargo se estima un crecimiento en los próximos años de más del 20% en la producción de vinaza de caña de azúcar debido entre otros factores al incremento del 5% en alcohol carburante (Proyecto de Ley 1715 de 2014 por medio del cual se regula la interacción de energías renovables no convencionales al sistema energético nacional), crecimiento demográfico y el crecimiento del parque automotor (Informe del sector automotor a Octubre de 2015), este posible crecimiento significativo ha despertado la necesidad de buscar nuevos usos de este subproducto dentro de los que tenemos: Aditivo para asfaltos y concretos, combustible generador de calor o electricidad y suplemento alimenticio para animales. Este proyecto aborda únicamente el uso de la vinaza como suplemento alimenticio para animales, resaltando el contenido de proteína del 8% (Scull, I., Savón, L., Gutiérrez, O., Valiño, E., Orta, I., Mora, P. O., Noda, A. (2012).) proveniente de la levadura como resultado del proceso de fermentación, lo convierte en un muy buen prospecto, pero la obtención en el proceso de también otros compuestos mayoritarios como el Potasio y el Glicerol pueden traer problemas estomacales dependiendo de las concentraciones suministradas. Se pretende entonces modelar molecularmente en fase gaseosa y con solvente explícito en una computadora, una proteína contenida en la membrana celular de la saccharomyces cerevisiae conocida como Arf*GTP capaz de sobrevivir al proceso de apoptosis, usando técnicas de modelado comparativo en la mecánica molecular clásica y newtoniana, de esta misma forma se analizarán las interacciones moleculares entre la biomolécula en un complejo con sales de potasio y glicerol donde mediante la técnica de simulación en computadora llamada dinámica molecular clásica que utiliza ecuaciones de Newton podremos predecir las propiedades y el comportamiento del sistema químico en forma numérica, observar las interacciones más fuertes en el complejo y discutir sobre el efecto (positivo o negativo) que estas conllevan a la hora de ser usado en la industria, también se pretende ampliar y aclarar aún más el conocimiento molecular del comportamiento de estos nutrientes y la naturaleza de estas interacciones.

Tipo de proyecto: Investigación, desarrollo e Innovación 
Actividad Biológica de Péptidos Antimicrobianos e Interacciones Péptido-Membrana
Inicio: Diciembre  2016 Fin: Diciembre  2018 Duración 
Resumen

Los antibióticos, son una de las formas más exitosas de quimioterapia en la historia de la medicina. Desde su introducción en la práctica clínica, han salvado muchas vidas poniendo bajo control la mayoría de las enfermedades infecciosas. Sin embargo, la rápida diseminación de microorganismos resistentes a antibióticos en las últimas décadas, ha representado un problema significativo de salud a nivel mundial, generando así, investigaciones que propongan alternativas para el diseño de nuevos antibióticos como por ejemplo, los péptidos antimicrobianos (PAMs). Los PAMs son moléculas efectoras de la inmunidad innata de diversos organismos y son considerados como alternativas terapéuticas promisorias, debido a su baja respuesta de resistencia. La mayoría de los PAMs tienen carga positiva debido a que esa propiedad facilita una atracción electroestática entre los péptidos y las membranas celulares aniónicas de los microorganismos. Después de la unión de los PAMs con las membranas microbianas, el empaquetamiento de los fosfolípidos de la bicapa es alterado, aumentando la permeabilidad y la liberación de contenido citoplasmático esencial para la supervivencia del microorganismo. Investigaciones enfocadas en estudiar la relación estructura-actividad de los PAMs, han demostrado que el aumento de carga catiónica en el extremo NH-terminal de la secuencia y una composición de residuos hidrofóbicos de alrededor del 50%, son características estructurales asociadas con una eficiente actividad antimicrobiana. Por lo tanto, numerosas investigaciones se basan actualmente en la modificación de secuencias naturales para obtener péptidos modificados. Este proyecto de investigación tiene como finalidad evaluar la actividad antimicrobiana de aliteserin 1c, un péptido secretado en la piel del sapo Alytes obstetricans con carga neta de +2, y de un análogo con carga aumentada a +5, a partir de la sustitución de aminoácidos. En complemento a lo anterior, se estudiará el mecanismo de acción de éstos PAMs realizando estudios moleculares con modelos de membranas y con programas bio-informáticos de simulación. Herramientas como la espectroscopia infrarroja acoplada a ATR (FTIR-ATR) permite determinar si los grupos funcionales de los fosfolípidos son afectados por la influencia de los péptidos. Con este trabajo se espera contribuir al entendimiento y diseño de nuevos y más eficaces antibióticos con potencial uso terapéutico.

Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
Interacciones intermoleculares de la proteína de membrana Arf*GTP con Potasio y Glicerol, componentes mayoritarios de la Vinaza de Caña de Azúcar.
Inicio: Septiembre  2016 Fin: Septiembre  2017 Duración 
Resumen

La súper producción de alcohol carburante en Colombia, ligada a la Ley 693 de 2001 y la resolución 41072 del 30 de Septiembre de 2015 del Ministerio de Minas y Energía, actualmente está permitiendo verter al medio ambiente aproximadamente 13.365 millones de litros por día de vinaza de caña de azúcar como subproducto de la industria alcoquímica y azucarera, gran parte de esta cifra está siendo usada controladamente en la producción de 800 Toneladas diarias de compost por la industria agrícola como agente fertilizante y remediador del pH en suelos de cultivo (Revista Tecnicaña No. 28, Julio 2012), todo lo anterior como respuesta pronta de la Industria a la producción elevada de vinaza. Sin embargo se estima un crecimiento en los próximos años de más del 20% en la producción de vinaza de caña de azúcar debido entre otros factores al incremento del 5% en alcohol carburante (Proyecto de Ley 1715 de 2014 por medio del cual se regula la interacción de energías renovables no convencionales al sistema energético nacional), crecimiento demográfico y el crecimiento del parque automotor (Informe del sector automotor a Octubre de 2015), este posible crecimiento significativo ha despertado la necesidad de buscar nuevos usos de este subproducto dentro de los que tenemos: Aditivo para asfaltos y concretos, combustible generador de calor o electricidad y suplemento alimenticio para animales. Este proyecto aborda únicamente el uso de la vinaza como suplemento alimenticio para animales, resaltando el contenido de proteína del 8% (Scull, I., Savón, L., Gutiérrez, O., Valiño, E., Orta, I., Mora, P. O., Noda, A. (2012).) proveniente de la levadura como resultado del proceso de fermentación lo convierte en un muy buen prospecto, pero la obtención en el proceso de otros compuestos mayoritarios (como el Potasio y el Glicerol) puede traer problemas estomacales dependiendo de las concentraciones suministradas. Se pretende entonces modelar molecularmente en fase gaseosa y con solvente explícito en una computadora, una proteína contenida en la membrana celular de la saccharomyces cerevisiae conocida como Arf*GTP capaz de sobrevivir al proceso de apoptosis, usando técnicas de modelado comparativo en la mecánica molecular clásica y newtoniana, de esta misma forma se analizarán las interacciones moleculares entre la biomolécula en un complejo con sales de potasio y glicerol donde mediante la técnica de simulación en computadora llamada dinámica molecular clásica que utiliza ecuaciones de Newton podremos predecir las propiedades y el comportamiento del sistema químico en forma numérica, observar las interacciones más fuertes en el complejo y discutir sobre el efecto (positivo o negativo) que estas conllevan a la hora de ser usado en la industria, también se pretende ampliar y aclarar aún más el conocimiento molecular del comportamiento de estos nutrientes y la naturaleza de estas interacciones. Los resultados de este proyecto demostrarían afinidades e interacciones moleculares entre el contenido proteico, orgánico e inorgánico de la vinaza de caña de azúcar, resultados que la Industria podría utilizar para tomar decisiones de separación química o física de componentes.

Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
Inhibición alostérica de quinasas de la ruta de señalización ¿PI3K/AKT/mTOR¿ de Trypanosoma cruzi como nueva estrategia terapéutica para la enfermedad de Chagas
Inicio: Enero  2016 Fin: Octubre  2017 Duración 
Resumen

La enfermedad de Chagas es una zoonosis con elevadas tasas de morbimortalidad en el mundo, manifiesta diferentes formas clínicas y genera importantes pérdidas económicas en aquellos países donde es endémica. Esta tripanosomiasis constituye un serio problema de salud pública en Latinoamérica; en Colombia se estima una prevalencia del 5% con 8 millones de personas en riesgo de infectarse. El control definitivo de esta enfermedad pasaría por desarrollar una vacuna, sin embargo el tratamiento disponible es sólo farmacológico y este es poco efectivo en la fase crónica. Los dos medicamentos de elección son funcionales principalmente en la fase aguda y se han reportado resistencias, severos efectos adversos, están contraindicados en el embarazo, no están disponibles fácilmente en todos los países y se desconocen con certeza sus mecanismos de acción. Por ello, proponemos como dianas molecular quinasas de la ruta (PI3K-AKT-mTOR-like) para el diseño racional de compuestos que se conviertan en tratamientos con menos efectos secundarios en el paciente pero más efectivos contra el parásito. El proyecto plantea extrapolar un estudio que actualmente estamos llevando acabo sobre la quinasa AKT-like de Leishmania spp a T. cruzi, parásito evolutivamente cercano (familia: Trypanosomatidae) y que presenta también esta quinasa con una alta similaridad en sus dominios. La quinasa humana AKT perteneciente a la ruta de señalización (PI3K-AKT-Mtor) es una proteína que cumple diferentes funciones en la homeostasis celular, pero ha sido su papel en el proceso oncogénico al coadyuvar la aparición, supervivencia y resistencia a quimioterapia del tumor lo que la ha convertido en uno de los objetivos de la investigación farmacéutica en cáncer.

Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
Characterization of the AmtR signal transduction-protein
Inicio: Octubre  2010 Fin proyectado: Junio  2013 Fin: Junio  2013 Duración 48
Resumen

The use of microorganisms in many sectors of the industry are day per day increasing, from a simple yogurt in food chemistry that integrate bacteria called probiotics to the design of the proteins ¿drugs¿ that integrated large sequences of amino acids, cause the necessity of explore and investigate the sophisticated control mechanism that use the bacteria for the uptake and assimilation of different components, a example is: The master nitrogen regulation on the transcriptional levels, that is controlled by the TetR family protein AmtR1. The physiological function of AmtR has been very well studied, but the structural characterization of the mechanistic aspects of AmtR-regulated transcription has yet to be accomplished2, therefore the principal propose of this project is characterize the AmtR protein in complex with the DNA, using in the beginning a computational model integrated for: AmtR dimer protein, modeled using homology modeling and predictive techniques.