Hoja de vida

Par evaluador reconocido por Colciencias.
Categoría Investigador Junior (IJ) (con vigencia hasta 2017-12-06 00:00:00.0)
Nombre Angel Alfonso Cruz Roa
Nombre en citaciones CRUZ ROA, ANGEL ALFONSO
Nacionalidad Colombiana
Sexo Masculino
Author ID SCOPUS

Formación Académica

  •  
  • Doctorado Universidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá
    Doctorado en Ingeniería de Sistemas y Computación
    Juliode2010 - Agostode 2015
    Data-driven representation learning from histopathology image database to support digital pathology image analysis
  •  
  • Maestría/Magister Universidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá
    Maestria En Ingenieria Biomedica
    Enerode2008 - Marzode 2011
    Anotación Automática de Imágenes Médicas Usando la Representación de Bolsa de Características
  •  
  • Pregrado/Universitario Universidad de Los Llanos - Unillanos
    Ingeniería de Sistemas
    Enerode2000 - Diciembrede 2005
    Prototipo de Sistema Experto para la Clasificación Morfologica de Espermatozoides Bovinos
  •  
  • Secundario Inem Luis Lopez de Mesa

    Enerode1994 - de 1999

    Experiencia profesional

  •  
  • Universidad de Los Llanos - Unillanos
    Dedicación: 20 horas Mensuales Mayo de 2009 de

    Actividades de docencia
    -   Pregrado - Nombre del curso:  Gestión de Proyectos de Software, 10 Mayo 2009
    -   Pregrado - Nombre del curso:  Robótica Móvil (Visión por Computador), 15 Agosto 2009
    -   Pregrado - Nombre del curso:  Teoría de Lenguajes, 12 Mayo 2009
  •  
  • Universidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá
    Dedicación: 28 horas Semanales Mayo de 2009 Septiembre de 2009

  •  
  • Centro Internacional De Física - Cif
    Dedicación: 24 horas Semanales Marzo de 2008 Mayo de 2009

    Actividades de administración
    -  Miembro de consejo de centro - Cargo: Elaboración de informes técnicos y artículos científicos. Marzo de 2008 de
    Actividades de investigación
    -   Investigación y Desarrollo - Titulo:  Desarrollo del sistema de recuperación por contenido en un banco de imágenes médicas. BiMed (http://www.informed.unal.edu.co) Marzo 2008 Mayo 2009
  •  
  • Instituto Nacional De Salud
    Dedicación: 48 horas Mensuales Marzo de 2007 Marzo de 2008

    Actividades de administración
    -  Miembro de consejo de centro - Cargo: Joven Investigador Colciencias 2007 Marzo de 2007 Marzo de 2008
  •  
  • Pimisys Eu
    Dedicación: 40 horas Semanales Octubre de 2005 Enero de 2007

    Actividades de administración
    -  Servicio Técnico Especializado - Cargo: PRESTACION DEL SERVICIO DE DESARROLLO EN PROGRAMACION DE SISTEMAS PIMISYS Octubre de 2005 Enero de 2007
    -  Miembro de consejo de centro - Cargo: Otro (especifique) Octubre de 2005 Enero de 2007

    Áreas de actuación

  •  Ingeniería y Tecnología -- Ingeniería Médica -- Ingeniería Médica
  •  Ciencias Naturales -- Computación y Ciencias de la Información -- Ciencias de la Computación
  •  Ingeniería y Tecnología -- Ingenierías Eléctrica, Electrónica e Informática -- Ingeniería de Sistemas y Comunicaciones
  •  Ciencias Naturales -- Computación y Ciencias de la Información -- Ciencias de la Información y Bioinformática
  •  Ciencias Naturales -- Matemática -- Estadísticas y Probabilidades (Investigación en Metodologías)
  • Idiomas

      Habla Escribe Lee Entiende
  •  Inglés
  • Aceptable Aceptable Bueno Aceptable
  •  Español
  • Bueno Bueno Bueno Bueno

    Lineas de investigación

  •  Aprendizaje de Máquina, Activa:Si
  •  Anotación automática de Imágenes Médicas, Activa:Si
  •  Morfología celular en investigación biomédica, Activa:No
  •  Recuperacion de imagenes, Activa:Si
  •  Desarrollo de aplicacion web, Activa:Si
  • Reconocimientos

  • Profesor coinventor de patente para la detección de mitosis en láminas de histopatología de cáncer de seno en Estados Unidos, año 2015,Universidad de Los Llanos - Unillanos - Noviembrede 2016
  • Distinción Laureada a la tesis del Doctorado en Ingeniería - Sistemas y Computación,UNIVERSIDAD NACIONAL DE COLOMBIA - Diciembrede 2015
  • Becario beneficiario, crédito-beca Convocatoria 528 de 2011 de COLCIENCIAS para estudios de formación Doctoral en Colombia, Febrero 2012.,Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación, Colciencias - Febrerode 2012
  • Poster Award, Cum Laude An adaptative image representation learned from data for cervix cancer tumor detection ¿ SPIE Medical Imaging 2013, Digital Pathology - Conference 8676, - Febrerode 2012
  • Student travel award, artículo A Visual Latent Semantic Approach for Automatic Analysis and Interpretation of Anaplastic Medulloblastoma Virtual Slides. The 15th Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI 2012), - Octubrede 2012
  • Student travel award. MICCAI 2013, the 16th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention,Scientific Council of Japan - Septiembrede 2013
  • Travel Grant Awarded in Histopathology Image Analysis Workshop 2011, - Agostode 2011
  • Segundo Lugar en el Examen de Estado de Calidad de la Educación Superior ECAES 2004 del Programa Ingenieria de Sistemas en la Universidad de los Llanos,Facultad de Ciencias Basicas e Ingenieria, Universidad de los Llanos - de 2005
  • Mención de Honor al mejor trabajo de investigación en la modalidad de presentación oral en el área de Procesamiento de Señales Biológicas e Imágenes Medicas,II Congreso Colombiano de Bioingeniería e Ingeniería Biomédica. IEEE Colombia, ABIOIN y EMB Colombia - de 2005
  • Matricula de Honor,Ingenieria de Sistemas, Universidad de los Llanos - de 2004
  • Matricula de Honor,Ingenieria de Sistemas, Universidad de los Llanos - de 2003
  •  
    Los ítems de producción con la marca corresponden a productos avalados y validados para la última Convocatoria Nacional para el Reconocimiento y Medición de Grupos de Investigación, Desarrollo Tecnológico o de Innovación y para el Reconocimiento de Investigadores del SNCTeI

    Cursos de corta duración

  • Producción técnica - Cursos de corta duración dictados - Especialización
  • ANGEL ALFONSO CRUZ ROA, Big Data Analytics (Analítica de Grandes Volúmenes de Datos), Finalidad: Inducción a los métodos computacionales para el análisis de grandes volúmenes de datos . En: Colombia  ,2016,  ,.  participación: Docente , 3 semanas 

    Trabajos dirigidos/tutorias

  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • JORGE GONZALO TORRES RIVAS, ANGEL ALFONSO CRUZ ROA, PABLO EMILIO CRUZ CASALLAS, CARACTERIZACION MORFOLOGICA NORMAL DE ESPERMATOZOIDES DE TOROS Bos taurus y Bos indicus  Universidad de Los Llanos - Unillanos  Estado: Tesis concluida  Medicina Veterinaria y Zootecnia  ,2006,  . Persona orientada: JORGE GONZALO TORRES RIVAS  , Dirigió como: Tutor principal,  0 meses  
    Areas:
    Ciencias Agrícolas -- Ciencias Veterinarias -- Ciencias Veterinarias, Ingeniería y Tecnología -- Ingeniería Médica -- Ingeniería Médica,
    Sectores:
    Agricultura, pecuaria, silvicultura, explotación forestal - Producción animal, incluso servicios veterinarios,
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • LEANDRO ESNEIDER AGUDELO VILLALOVOS, DIANA MILENA MORENO, ANGEL ALFONSO CRUZ ROA, SEGMENTACIÓN Y CLASIFICACIÓN AUTOMÁTICA DE CROMOSOMAS MEDIANTE TÉCNICAS DE PROCESAMIENTO DE IMÁGENES  Universidad de Los Llanos - Unillanos  Estado: Tesis concluida  Ingenieria Electronica  ,2008,  . Persona orientada: Leandro Esneider Agudelo Villalovos y Diana Milena Moreno  , Dirigió como: Tutor principal,  0 meses  
    Areas:
    Ingeniería y Tecnología -- Ingeniería Médica -- Ingeniería Médica, Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Genética y Herencia,
    Sectores:
    Agricultura, pecuaria, silvicultura, explotación forestal - Producción animal, incluso servicios veterinarios, Productos y procesos biotecnológicos - Productos y procesos biotecnológicos vinculados a la salud humana o de los animales,
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Monografía de conclusión de curso de perfeccionamiento/especialización
  • ANGEL ALFONSO CRUZ ROA, PLATAFORMA WEB PARA LA GESTIÓN DE PROYECTOS DE INVESTIGACIÓN  Universidad de Los Llanos - Unillanos  Estado: Tesis concluida  Especialización en Ingeniería de Software  ,2011,  . Persona orientada: GIOVANNY RICARDO RODRIGUEZ CHITIVA  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • PABLO EMILIO CRUZ CASALLAS, ANGEL ALFONSO CRUZ ROA, ANÁLISIS AUTOMÁTICO DE MOVILIDAD ESPERMÁTICA EN PECES COMO APOYO AL DIAGNÓSTICO VETERINARIO SOPORTADO POR TECNOLOGÍAS CLOUD  Universidad de Los Llanos - Unillanos  Estado: Tesis concluida  Ingenieria de Sistemas  ,2013,  . Persona orientada: CARLOS ALFONSO MONTOYA CRUZ, MANUEL ANDRÉS CRUZ ROA  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • ANGEL ALFONSO CRUZ ROA, Sistema de Evaluación de Riesgo para Casas Comerciales por Métodos de Estimación Estadísticos y Computación Inteligente.  Universidad de Los Llanos - Unillanos  Estado: Tesis concluida  Ingenieria de Sistemas  ,2009,  . Persona orientada: Giovanny Ricardo Rodriguez Chitiva  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • ANGEL ALFONSO CRUZ ROA, Algoritmo genético para la exploración eficiente y el análisis automático de grandes laminas digitalizadas de histopatología basado en redes neuronales convolucionales  Universidad de Los Llanos - Unillanos  Estado: Tesis concluida  Ingenieria de Sistemas  ,2016,  . Persona orientada: Mateo Alfonso Puerto Rodriguez, Tania Lizeth Vargas Rozo  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
    Areas:
    Ingeniería y Tecnología -- Ingeniería Médica -- Ingeniería Médica, Ciencias Naturales -- Computación y Ciencias de la Información -- Ciencias de la Computación, Ingeniería y Tecnología -- Ingenierías Eléctrica, Electrónica e Informática -- Ingeniería de Sistemas y Comunicaciones,
     

    Jurado en comites de evaluación

  • Datos complementarios - Jurado/Comisiones evaluadoras de trabajo de grado - Maestría
  • ANGEL ALFONSO CRUZ ROA, Titulo: Automatic 3D segmentation of the prostate on magnetic resonance images for radiotherapy planning Tipo de trabajo presentado: Proyecto de grado/Tesis en:  Universidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá  programa académico Maestria En Ingenieria Biomedica  Nombre del orientado: Charlens Alvarez Jiménez  
  • Datos complementarios - Jurado/Comisiones evaluadoras de trabajo de grado - Maestría
  • ANGEL ALFONSO CRUZ ROA, Titulo: Modelo computacional para la identificación de endofenotipos en pacientes con Artritis Reumatoide utilizando información del Antígeno Leucocitario Humano HLA clase II Tipo de trabajo presentado: Trabajo de grado/tesis en:  Universidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá  programa académico Maestria En Ingenieria Biomedica  Nombre del orientado:   
  • Datos complementarios - Jurado/Comisiones evaluadoras de trabajo de grado - Maestría
  • ANGEL ALFONSO CRUZ ROA, Titulo: Complex relationships between structural changes using brain Magnetic Resonance imaging in early diagnosis of Alzheimer¿s Disease Tipo de trabajo presentado: Trabajo de grado/tesis en:  Universidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá  programa académico Maestria En Ingenieria Biomedica  Nombre del orientado: Andrea Marcela Pulido  
  • Datos complementarios - Jurado/Comisiones evaluadoras de trabajo de grado - Maestría
  • ANGEL ALFONSO CRUZ ROA, Titulo: Automatic Characterization of the Parkinson Disease by Classifying the Kinematic Gait Patterns Tipo de trabajo presentado: Trabajo de grado/tesis en:  Universidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá  programa académico Maestria En Ingenieria Biomedica  Nombre del orientado: Fernanda Carolina Sarmiento  

    Par evaluador

    Ámbito: Internacional  Par evaluador de: Material para publicación científica  Revista: Ieee Transactions On Medical Imaging,  2014,  Marzo  
    Ámbito: Internacional  Par evaluador de: Material para publicación científica  Revista: Iet Computer Vision,  2014,  Octubre  
    Ámbito: Nacional  Par evaluador de: Material para publicación científica  Revista: Biomedica,  2013,  Octubre  

    Eventos científicos

    1 Nombre del evento: 11th International Symposium on Medical Information Processing and Analysis (SIPAIM'2015)  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Internacional  Realizado el:2015-11-17 00:00:00.0,  2015-11-19 00:00:00.0   en Cuenca   - Universidad de Cuenca  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:A method for Medulloblastoma Tumor Differentiation based on Convolutional Neural Networks and Transfer Learning Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Ponencia
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Universidad de Los Llanos - Unillanos Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Ponente
    2 Nombre del evento: The 17th Iberoamerican Congress on Pattern Recognition (CIARP)  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Internacional  Realizado el:2011-09-03 00:00:00.0,  2011-09-06 00:00:00.0   en Buenos Aires   - Buenos Aires (Argentina)  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Bag of Features for Automatic Classification of Alzheimer's Disease in Magnetic Resonance Images Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Ponencia
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Argentine Society for Pattern Recognition Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Ponente
    3 Nombre del evento: 7th International Seminar on Medical Information Processing and Analysis -SIPAIM 2011  Tipo de evento: Seminario  Ámbito: Internacional  Realizado el:2011-12-05 00:00:00.0,  2011-12-07 00:00:00.0   en BUCARAMANGA   - Universidad Industrial de Santander. Bucaramanga (Colombia)  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Multi-label Annotation of Radiological Images Based On Visual Latent Semantic Analysis Tipo de producto:Demás trabajos - Demás trabajos - Póster
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Universidad Industrial de Santander - UIS Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Ponente
    4 Nombre del evento: MICCAI 2012, the 15th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Internacional  Realizado el:2012-10-01 00:00:00.0,  2012-10-05 00:00:00.0   en Nice   - Acropolis Convention and Exhibition Centre  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:A Visual Latent Semantic Approach for Automatic Analysis and Interpretation of Anaplastic Medulloblastoma Virtual Slides Tipo de producto:Demás trabajos - Demás trabajos - Póster
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:INRIA (French Institute for Research in Computer Science and Applied Mathem Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Ponente
    • Nombre: EDGAR EDUARDO ROMERO CASTRO Rol en el evento: Ponente
    5 Nombre del evento: 9th International Seminar on Medical Information Processing and Analysis - SIPAIM 2013  Tipo de evento: Seminario  Ámbito: Internacional  Realizado el:2013-11-11 00:00:00.0,  2013-11-14 00:00:00.0   en México D.F.   - Universidad Panamericana, Mexico D.F. (Mexico)  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Bag-of-Visual-Ngrams for Histopathology Image Classification Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Ponencia
    • Nombre del producto:Hybrid image representation learning model with invariant features for basal cell carcinoma detection Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Ponencia
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Universidad Panamericana Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Ponente
    6 Nombre del evento: 12th Inter-American Microscopy Congress CIASEM 2013  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Internacional  Realizado el:2013-09-24 00:00:00.0,  2013-09-28 00:00:00.0   en CARTAGENA DE INDIAS   - Cartagena de Indias, Colombia  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Cuantificación automática de la movilidad espermática en peces como apoyo al diagnóstico veterinario Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Ponencia
    • Nombre del producto:Cuantificación automática de la movilidad espermática en peces como apoyo al diagnóstico veterinario Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Asociación Colombiana de Microscopía Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Ponente
    7 Nombre del evento: 8th International Seminar on Medical Information Processing and Analysis - SIPAIM 2012  Tipo de evento: Seminario  Ámbito: Internacional  Realizado el:2012-11-12 00:00:00.0,  2012-11-15 00:00:00.0   en San Cristobal   - San Cristobal (Venezuela)  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Prediction of Morphometric Measures from Bag-of-Features Image Representation of Cervix Cancer Cells Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Ponencia
    • Nombre del producto:An evaluation of different image features for modality classification in ImageClefmed 2012 dataset Tipo de producto:Demás trabajos - Demás trabajos - Póster
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Universidad del Tachira Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Ponente
    8 Nombre del evento: MICCAI 2013, the 16th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Internacional  Realizado el:2013-09-22 00:00:00.0,  2013-09-26 00:00:00.0   en Nagoya   - Nagoya (Japan)  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:A Deep Learning Architecture for Image Representation, Visual Interpretability and Automated Basal-Cell Carcinoma Cancer Detection Tipo de producto:Demás trabajos - Demás trabajos - Póster
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Scientific Council of Japan Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Ponente
    9 Nombre del evento: 7th Colombian Computing Congress  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Nacional  Realizado el:2012-10-01 00:00:00.0,  2012-10-05 00:00:00.0   en MEDELLÍN   - Universidad EAFIT  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:A Framework for High Performance Image Analysis Pipelines Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Universidad Eafit Tipo de vinculaciónGestionadora
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Ponente
    • Nombre: FABIO GONZALEZ OSORIO Rol en el evento: Ponente
    • Nombre: RAUL RAMOS Rol en el evento: Ponente
    10 Nombre del evento: Digital Pathology Conference. SPIE Medical Imaging 2014  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Internacional  Realizado el:2014-02-15 00:00:00.0,  2014-11-20 00:00:00.0   en San Diego   - Town & Country Resort and Convention Center, San Diego, California, USA  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Automatic detection of invasive ductal carcinoma in whole slide images with Convolutional Neural Networks Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Ponencia
    • Nombre del producto:Cascaded Ensemble of Convolutional Neural Networks and Handcrafted Features for Mitosis Detection Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Ponencia
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Universidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: ANANT MADABHUSHI Rol en el evento: Compilador de memorias
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Asistente , Ponente
    • Nombre: FABIO GONZALEZ OSORIO Rol en el evento: Ponente
    11 Nombre del evento: Tenth International Symposium on Medical Information Processing and Analysis (SIPAIM 2014)  Tipo de evento: Simposio  Ámbito: Internacional  Realizado el:2014-10-14 00:00:00.0,  2014-11-16 00:00:00.0   en CARTAGENA DE INDIAS   - Universidad de Cartagena  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:A comparative evaluation of supervised and unsupervised representation learning approaches for anaplastic medulloblastoma differentiation Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Ponencia
    • Nombre del producto:Automatic detection of Wheezes by evaluation of multiple acoustic feature extraction methods and C-weighted SVM Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Ponencia
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Universidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: ANANT MADABHUSHI Rol en el evento: Ponente , Ponente magistral
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Ponente
    • Nombre: FABIO GONZALEZ OSORIO Rol en el evento: Ponente
    • Nombre: GERMAN DAVID SOSA RAMIREZ Rol en el evento: Ponente
    • Nombre: JOHN AREVALO Rol en el evento: Ponente
    12 Nombre del evento: 3er Encuentro Regional de Electrónica y Sistemas, 1ra Jornada Técnica Zona Norte IEEE  Tipo de evento: Encuentro  Ámbito:   Realizado el:2005-01-01 00:00:00.0,    en SANTA MARTA   -  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Software Prototipo de Clasificación Morfológica de Espermatozoides Bovinos a través de Redes Neuronales Artificiales Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Asistente
    13 Nombre del evento:  Digital Pathology Conference. SPIE Medical Imaging 2013  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Internacional  Realizado el:2013-02-09 00:00:00.0,  2013-02-14 00:00:00.0   en Orlando, FL   - Disney's Coronado Springs Resort, Lake Buena Vista (Orlando Area)  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:An adaptive image representation learned from data for cervix cancer tumor detection Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Ponente
    • Nombre: EDGAR EDUARDO ROMERO CASTRO Rol en el evento: Ponente
    • Nombre: FABIO GONZALEZ OSORIO Rol en el evento: Ponente
    14 Nombre del evento: III Congreso Colombiano de Bioingeniería e Ingeniería Biomédica  Tipo de evento: Congreso  Ámbito:   Realizado el:2008-06-01 00:00:00.0,    en IBAGUÉ   -  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Segmentación Automática Multicanal de Quistes de Giardia Duodenalis por Clustering K-Medias y un Árbol de Decisión Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Asistente
    15 Nombre del evento: XIII Congreso Colombiano de Parasitologia y Medicina Tropical. Asociación Colombiana de Parasitologia y Medicina Tropical  Tipo de evento: Congreso  Ámbito:   Realizado el:2007-11-01 00:00:00.0,    en IBAGUÉ   -  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Identificación automática de quistes de Giardia duodenalis basada en características de forma y color a través de técnicas de procesamiento digital de imágenes Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Resumen
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Asistente
    16 Nombre del evento: XLII Congreso Nacional de Ciencias Biológicas. Asociación Colombiana de Ciencias Biológicas  Tipo de evento: Congreso  Ámbito:   Realizado el:2007-10-01 00:00:00.0,    en IBAGUÉ   -  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Cuantificación de melanocitos en la piel normal. Estudio en los bordes de resección de melanoma in situ de la cara y del carcinoma basocelular de la cara Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Resumen
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Asistente
    17 Nombre del evento: IV Congreso Colombiano de Computación  Tipo de evento: Congreso  Ámbito:   Realizado el:2009-04-01 00:00:00.0,    en BUCARAMANGA   -  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Aprendizaje Transductivo para la Clasificación de Imágenes Médicas de Radiología Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    • Nombre del producto:Sistema de Evaluación de Riesgo para Casas Comerciales por Métodos de Estimación Estadísticos y Computación Inteligente Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Asistente
    18 Nombre del evento: Artificial Intelligence in Medicine Conference, AIME¿09  Tipo de evento: Otro  Ámbito:   Realizado el:2009-07-01 00:00:00.0,    en CALI   -  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Histopathology image classification using bag of features and kernel functions Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Asistente
    19 Nombre del evento: Encuentro Internacional de e-ciencia y educación: "Nuevas Posibilidades para el Desarrollo Académico y Científico del País"  Tipo de evento: Encuentro  Ámbito:   Realizado el:2008-09-01 00:00:00.0,    en CALI   -  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Sistema para la recuperación por contenido en un banco de imágenes médicas Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Resumen
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Asistente
    20 Nombre del evento: Encuentro Nacional de Investigación en Posgrados ¿ ENIP 2009  Tipo de evento: Encuentro  Ámbito:   Realizado el:2009-12-01 00:00:00.0,    en BOGOTÁ, D.C.   -  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Automatic Medical Images Annotation from a Representation of Bag of Visual Features Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Asistente
    21 Nombre del evento:  14th Iberoamerican Congress on Pattern Recognition. CIARP 2009  Tipo de evento: Congreso  Ámbito:   Realizado el:2009-11-01 00:00:00.0,    en   -  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Visual Pattern Analysis in Histopathology Images Using Bag of Features Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Asistente
    22 Nombre del evento: Microsoft eScience Workshop 2009  Tipo de evento: Taller  Ámbito:   Realizado el:2009-10-01 00:00:00.0,    en   -  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:A Web-Based System for Biomedical Image Storage, Annotation, Content-Based Retrieval and Exploration Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Resumen
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Asistente
    23 Nombre del evento: Quinto eminario Internacional de Ingeniería Biomédica (SIB) y V Seminario Internacional de Procesamiento y Análisis de Imágenes Médicas (SIPAIM)  Tipo de evento: Seminario  Ámbito:   Realizado el:2009-11-01 00:00:00.0,    en BOGOTÁ, D.C.   -  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Anonimización Automática de Imágenes y Datos Personales En Historias Clínicas de Dermatología Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Resumen
    • Nombre del producto:Sistema para Acceder una Colección de Imágenes Biomédicas Mediante Estrategias Basadas En el Contenido Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Resumen
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Asistente
    24 Nombre del evento: Latin-American Conference on Networked and Electronic Media - LACNEM2009  Tipo de evento: Otro  Ámbito:   Realizado el:2009-08-01 00:00:00.0,    en BOGOTÁ, D.C.   -  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Obtención Automática del Cariotipo Bovino Mediante Procesamiento Digital de Imágenes y Reconocimiento de Patrones Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Asistente
    25 Nombre del evento: 6th International Seminar on Medical Image Processing and Analysis -SIPAIM 2010  Tipo de evento: Seminario  Ámbito:   Realizado el:2010-12-01 00:00:00.0,    en BOGOTÁ, D.C.   -  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Visual Mining in Histology Images Using Bag of Features Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Asistente
    26 Nombre del evento: 6th Colombian Computing Congress (CCC)   Tipo de evento: Congreso  Ámbito:   Realizado el:2011-01-01 00:00:00.0,    en MANIZALES   -  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:A Framework for Semantic Analysis of Histopathological Images Using Nonnegative Matrix Factorization Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Asistente
    27 Nombre del evento: Histopathology Image Analysis Workshop - MICCAI 2011  Tipo de evento: Taller  Ámbito:   Realizado el:2011-09-01 00:00:00.0,    en BOGOTÁ, D.C.   -  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Automatic Annotation of Histopathological Images Using a Latent Topic Model Based On Non-negative Matrix Factorization Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Asistente
    28 Nombre del evento: The Latin American Conference on High Performance Computing (CLCAR)  Tipo de evento: Otro  Ámbito:   Realizado el:2012-10-01 00:00:00.0,    en   -  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:A Framework for High Performance Image Analysis Pipelines over Cloud Resources Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Asistente
    29 Nombre del evento: E-Science (e-Science), 2012 IEEE 8th International Conference on   Tipo de evento: Otro  Ámbito:   Realizado el:2012-10-01 00:00:00.0,    en   -  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:BIGS: A Framework for Large-Scale Image Processing and Analysis Over Distributed and Heterogeneous Computing Resources Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Asistente
    30 Nombre del evento: I Seminario Taller de Microscopia Confocal  Tipo de evento: Simposio  Ámbito: Nacional  Realizado el:2007-01-01 00:00:00.0,    en BOGOTÁ, D.C.   - Pontificia Universidad Javeriana  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Pontificia Universidad Javeriana y Micros Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Organizador
    31 Nombre del evento: Seminario de Facultad de Ciencias Básicas e Ingeniería  Tipo de evento: Simposio  Ámbito: Nacional  Realizado el:2006-01-01 00:00:00.0,    en ACACÍAS   - Auditorio Unad  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:UNAD -Cead-Acacias (Meta) Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Organizador
    32 Nombre del evento: II Congreso Colombiano de Computación  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Nacional  Realizado el:2007-04-01 00:00:00.0,    en BOGOTÁ, D.C.   - Pontificia Universidad Javeriana  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Prototipo de Sistema Experto para la Clasificación Morfológica de Células Espermáticas en Bovinos Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Pontificia Universidad Javeriana Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Organizador
    33 Nombre del evento: Jornadas Académicas. Celebración 25 Años de la Carrera de Ingeniería de Sistemas 1978 - 2003  Tipo de evento: Otro  Ámbito: Nacional  Realizado el:2003-01-01 00:00:00.0,    en BOGOTÁ, D.C.   - Universidad Nacional de Colombia  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Universidad Nacional De Colombia - Oficial Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Organizador
    34 Nombre del evento: Ciclo de Conferencias Semanales Instituto Nacional de Salud  Tipo de evento: Otro  Ámbito: Nacional  Realizado el:2006-01-01 00:00:00.0,    en BOGOTÁ, D.C.   - Auditorio Instituto Nacional de Salud  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Instituto Nacional De Salud Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Organizador
    35 Nombre del evento: II Congreso Colombiano de Bioingeniería e Ingeniería Biomédica  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Nacional  Realizado el:2005-01-01 00:00:00.0,    en BOGOTÁ, D.C.   - Capitolio Nacional  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Software Prototipo de Clasificación Morfológica de Espermatozoides Bovinos a través de Redes Neuronales Artificiales Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:IEEE Colombia, ABIOIN y EMB Colombia Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    • Nombre de la institución:IEEE Colombia, Universidad Tecnologica de Pereira Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Organizador
    36 Nombre del evento: ". 8o Encuentro Nacional de Investigadores de las Ciencias Pecuarias y 1er Internacional. (8O ENICIP)  Tipo de evento: Encuentro  Ámbito: Nacional  Realizado el:2005-11-01 00:00:00.0,    en MEDELLÍN   - Universidad de Antioquia  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Software Prototipo para la Evaluación Morfológica de Espermatozoides Bovinos a partir de Procesamiento Digital de Imágenes y Redes Neuronales Artificiales Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Resumen
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Universidad De Antioquia - Udea Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Organizador
    37 Nombre del evento: XIII Congreso Colombiano de Parasitologia y Medicina Tropical  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Nacional  Realizado el:2007-01-01 00:00:00.0,    en IBAGUÉ   - Auditorio Alfonso López Pumarejo-Gobernacion del Tolima  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Asociacion Colombiana De Parasitologia Y Medicina Tropical Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Organizador
    38 Nombre del evento: III Congreso Internacional de Inteligencia Computacional - CIIC 2005  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Nacional  Realizado el:2005-01-01 00:00:00.0,    en MONTERÍA   - Universidad del Sinú  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Universidad del Sinú, Grupo de Investigación TESEEO y la Red Colombiana de Inteligencia Computacional Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Organizador
    39 Nombre del evento: Encuentro Universitario de Computación Inteligente v.1.0.  Tipo de evento: Encuentro  Ámbito: Nacional  Realizado el:2005-01-01 00:00:00.0,    en VILLAVICENCIO   - Universidad de los Llanos  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Grupo CIULL & Rama Estudiantil IEEE Universidad de los Llanos Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Organizador
    40 Nombre del evento: I Jornada Académica de Estudiantes de Ingeniería  Tipo de evento: Otro  Ámbito: Nacional  Realizado el:2002-01-01 00:00:00.0,    en VILLAVICENCIO   - Universidad de los Llanos  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Universidad de los Llanos, Rama Estudiantil IEEE Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Organizador
    41 Nombre del evento: Jornada de Electrotecnología y Software  Tipo de evento: Otro  Ámbito: Nacional  Realizado el:2003-01-01 00:00:00.0,    en VILLAVICENCIO   - Casa de la Cultura German Arciniegas  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Universidad de los Llanos, Rama Estudiantil IEEE Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Organizador
    42 Nombre del evento: Jornada de divulgación tecnológica "Linux revolución tecnológica en el ámbito corporativo y educativo"  Tipo de evento: Otro  Ámbito: Nacional  Realizado el:2003-01-01 00:00:00.0,    en VILLAVICENCIO   - SENA Villavicencio  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:SENA Villavicencio Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Organizador
    43 Nombre del evento: 2016 IEEE LA-CCI Latin American Conference on Computational Intelligence  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Internacional  Realizado el:2016-11-02 00:00:00.0,  2016-11-04 00:00:00.0   en las vegas   - Hotel Corales de Indias  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:A Digital Pathology Application for Whole-Slide Histopathology Image Analysis based on Genetic Algorithm and Convolutional Networks Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Institute Of Electrical And Electronics Engineers-Ieee Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Ponente
    44 Nombre del evento: Congreso Internacional de Ciencias Básicas e Ingeniería - CICI 2016  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Nacional  Realizado el:2016-10-19 00:00:00.0,  2016-10-21 00:00:00.0   en VILLAVICENCIO   - GHL Hotel Villavicencio  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Aplicación de Métodos Numéricos en un Juego: Tiro Al Panda Con Cañon Tipo de producto:Demás trabajos - Demás trabajos - Póster
    • Nombre del producto:Clasificación automática de cobertura y uso de suelo en imágenes de teledetección de parques nacionales naturales a partir de redes neuronales convolucionales Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    • Nombre del producto:Algoritmo genético para la exploración y el análisis automático de grandes láminas digitalizadas de histopatología basado en redes neuronales convolucionales Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    • Nombre del producto:Algoritmo genético para la exploración y el análisis automático de grandes láminas digitalizadas de histopatología basado en redes neuronales convolucionales Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Ponencia
    • Nombre del producto:Clasificación automática de cobertura y uso de suelo en imágenes de teledetección de parques nacionales naturales a partir de redes neuronales convolucionales Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Ponencia
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Universidad de Los Llanos - Unillanos Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    • Nombre de la institución:Facultad de Ciencias Basicas e Ingenieria, Universidad de los Llanos Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    • Nombre de la institución:CORPORACIÓN DE ALTA TECNOLOGÍA PARA LA DEFENSA Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: ANGEL ALFONSO CRUZ ROA Rol en el evento: Compilador de memorias , Organizador , Ponente

    Redes de conocimiento especializado

    Nombre de la red Aplicaciones de Deep Learning en imagen biomédica  Tipo de redReal,  Creada el:2013-01-31 00:00:00.0,    en BOGOTÁ, D.C.   con 3 participantes 

    Artículos

  • Producción bibliográfica - Artículo - Corto (Resumen)
  • ANGEL ALFONSO CRUZ ROA, DIANA MARCELA CARDONA ROMAN, PABLO EMILIO CRUZ CASALLAS, RUBEN DARIO ANGEL CORREA, "Software Prototipo para la Evaluación Morfológica de Espermatozoides Bovinos a partir de Procesamiento Digital de Imágenes y Redes Neuronales Artificiales" . En: Colombia 
    Revista Colombiana De Ciencias Pecuarias  ISSN: 0120-0690  ed: Editorial Universidad de Antioquia
    v.18 fasc.4 p.340 - 340 ,2005,  DOI: 
    Palabras:
    CASA, evaluación de semen, morfología espermática, procesamiento digital de imágenes, Reconocimiento de Patrones,
    Sectores:
    Agricultura, pecuaria, silvicultura, explotación forestal - Producción animal, incluso servicios veterinarios, Desarrollo de programas (software) y prestación de servicios en informática - Desarrollo de programas (software), Productos y procesos biotecnológicos - Productos y procesos biotecnológicos vinculados a la agricultura,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • ANGEL ALFONSO CRUZ ROA, JOHN AREVALO, ALEXANDER JUDKINS, ANANT MADABHUSHI, FABIO GONZALEZ OSORIO, "A method for Medulloblastoma Tumor Differentiation based on Convolutional Neural Networks and Transfer Learning" . En: Estados Unidos 
    Proceedings Of Spie, The International Society For Optical Engineering  ISSN: 0277-786X  ed: Proceedings Of Spie The International Society For Optical Engineering
    v.9681 fasc.968103 p.1 - 12 ,2015,  DOI: doi:10.1117/12.2208825
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • JOHN AREVALO, ANGEL ALFONSO CRUZ ROA, VIVIANA LETICIA ARIAS PEDROZA, EDGAR EDUARDO ROMERO CASTRO, FABIO GONZALEZ OSORIO, "An unsupervised feature learning framework for basal cell carcinoma image analysis" . En: Estados Unidos 
    Artificial Intelligence In Medicine  ISSN: 0933-3657  ed: Elsevier Science Publishers
    v.64 fasc.2 p.131 - 145 ,2015,  DOI: doi:10.1016/j.artmed.2015.04.004
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • ADRIAN PASTOR LOPEZ MONROY, MANUEL MONTES Y GOMEZ, HUGO JAIR ESCALANTE, ANGEL ALFONSO CRUZ ROA, FABIO GONZALEZ OSORIO, "Improving the BoVW via Discriminative Visual N-Grams and MKL Strategies" . En: Estados Unidos 
    Neurocomputing  ISSN: 0925-2312  ed: 
    v.175 fasc.A p.768 - 781 ,2016,  DOI: doi:10.1016/j.neucom.2015.10.053
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • JOHN AREVALO, ANGEL ALFONSO CRUZ ROA, FABIO GONZALEZ OSORIO, "Histopathology image representation for automatic analysis: A state-of-the-art review" . En: Colombia 
    Revista Med  ISSN: 0121-5256  ed: Universidad Militar Nueva Granada
    v.22 fasc.2 p.79 - 91 ,2014,  DOI: 
    Palabras:
    Analisis de Imagenes, Histopatología, Informática médica, Estado del arte,
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • ANGEL ALFONSO CRUZ ROA, FABIO GONZALEZ OSORIO, ANANT MADABHUSHI, "Assessment of algorithms for mitosis detection in breast cancer histopathology images" . En: Países Bajos 
    Medical Image Analysis  ISSN: 1361-8415  ed: 
    v.20 fasc.1 p.237 - 248 ,2015,  DOI: 10.1016/j.media.2014.11.010
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • ANGEL ALFONSO CRUZ ROA, JOHN AREVALO, ANANT MADABHUSHI, FABIO GONZALEZ OSORIO, "A Deep Learning Architecture for Image Representation, Visual Interpretability and Automated Basal-Cell Carcinoma Cancer Detection" . En: Alemania 
    Lecture Notes In Computer Science  ISSN: 0302-9743  ed: Springer
    v.8150 fasc.N/A p.403 - 410 ,2013,  DOI: 10.1007/978-3-642-40763-5_50
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • ADRIAN PASTOR LOPEZ MONROY, MANUEL MONTES Y GOMEZ, HUGO JAIR ESCALANTE, ANGEL ALFONSO CRUZ ROA, FABIO GONZALEZ OSORIO, "Bag-of-Visual-Ngrams for Histopathology Image Classification" . En: Estados Unidos 
    Spie Proceedings Series  ISSN: 1017-2653  ed: 
    v.8922 fasc.N/A p.1 - ,2013,  DOI: 10.1117/12.2034113
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • JOHN AREVALO, ANGEL ALFONSO CRUZ ROA, FABIO GONZALEZ OSORIO, "Hybrid image representation learning model with invariant features for basal cell carcinoma detection" . En: Estados Unidos 
    Spie Proceedings Series  ISSN: 1017-2653  ed: 
    v.8922 fasc.N/A p.1 - ,2013,  DOI: 10.1117/12.2035530
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • ANGEL ALFONSO CRUZ ROA, FABIO GONZALEZ OSORIO, JOSEPH GALARO, ALEXANDER JUDKINS, DAVID ELLISON, JENNIFER BACCON, ANANT MADABHUSHI, EDGAR EDUARDO ROMERO CASTRO, "A Visual Latent Semantic Approach for Automatic Analysis and Interpretation of Anaplastic Medulloblastoma Virtual Slides" . En: Francia 
    Lecture Notes In Computer Science  ISSN: 0302-9743  ed: Springer
    v.7510 fasc.1 p.157 - 164 ,2012,  DOI: 
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • ANGEL ALFONSO CRUZ ROA, GLORIA MERCEDEZ DIAZ, EDGAR EDUARDO ROMERO CASTRO, FABIO GONZALEZ OSORIO, "Automatic Annotation of Histopathological Images Using a Latent Topic Model Based On Non-negative Matrix Factorization" . En: Estados Unidos 
    Journal Of Pathology Informatics  ISSN: 2153-3539  ed: 
    v.2 fasc.4 p.1 - ,2011,  DOI: 
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • ANDREA RUEDA, JOHN AREVALO, ANGEL ALFONSO CRUZ ROA, EDGAR EDUARDO ROMERO CASTRO, FABIO GONZALEZ OSORIO, "Bag of Features for Automatic Classification of Alzheimer's Disease in Magnetic Resonance Images" . En: Argentina 
    Lecture Notes In Computer Science  ISSN: 0302-9743  ed: Springer
    v.7441 fasc.N/A p.559 - 566 ,2012,  DOI: 
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • FABIO GONZALEZ OSORIO, JUAN CARLOS CAICEDO, ANGEL ALFONSO CRUZ ROA, JORGE ELIECER CAMARGO MENDOZA, CLARA MATILDE SPINEL GOMEZ, "A System for Accessing a Collection of Biomedical Images Using Content-Based Strategies" . En: Colombia 
    Acta Biologica Colombiana (Online)  ISSN: 1900-1649  ed: Facultad De Ciencias Universidad Nacional
    v.15 fasc.3 p.221 - 234 ,2010,  DOI: 
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • ANGEL ALFONSO CRUZ ROA, LADYS SARMIENTO, MARÌA LEONOR CALDAS MARTINEZ, GERZAIN RODRIGUEZ, "Cuantificación de los melanocitos en la piel facial: otra ayuda para evaluar los bordes de resección del melanoma" . En: Colombia 
    Revista De La Asociación Colombiana De Dermatología Y Cirugía Dermatológica  ISSN: 1657-0448  ed: Impresora Feriva Sa
    v.17 fasc.3 p.149 - 153 ,2009,  DOI: 
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • ANGEL ALFONSO CRUZ ROA, JUAN CARLOS CAICEDO, FABIO GONZALEZ OSORIO, "Visual Pattern Mining in Histology Image Collections Using Bag of Features" . En: Austria 
    Artificial Intelligence In Medicine  ISSN: 0933-3657  ed: Elsevier Science Publishers
    v.52 fasc.2 p.91 - 106 ,2011,  DOI: 
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • ANGEL ALFONSO CRUZ ROA, ANANT MADABHUSHI, FABIO GONZALEZ OSORIO, "Accurate and reproducible invasive breast cancer detection in whole-slide images: A Deep Learning approach for quantifying tumor extent" . En: Estados Unidos 
    Scientific Reports  ISSN: 2045-2322  ed: 
    v.1 fasc.46450 p.1 - 21 ,2017,  DOI: doi:10.1038/srep46450
  • Producción bibliográfica - Artículo - Corto (Resumen)
  • ANGEL ALFONSO CRUZ ROA, MANUEL GUILLERMO FORERO VARGAS, ADRIANA AREVALO, MARÌA LEONOR CALDAS MARTINEZ, RUBEN SANTIAGO NICHOLLS, "Identificación automática de quistes de Giardia duodenalis basada en características de forma y color a través de técnicas de procesamiento digital de imágenes" . En: Colombia 
    Biomedica : Revista Del Instituto Nacional De Salud  ISSN: 0120-4157  ed: Instituto Nacional de Salud
    v.27 fasc.2 p.183 - 183 ,2007,  DOI: 
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • ANGEL ALFONSO CRUZ ROA, FABIO GONZALEZ OSORIO, JUAN CARLOS CAICEDO, JUAN CARLOS CAICEDO RUEDA, "Histopathology Image Classification Using Bag of Features and Kernel Functions" . En: Italia 
    Lecture Notes In Computer Science  ISSN: 0302-9743  ed: Springer
    v.5651/2009 fasc.1 p.126 - 135 ,2009,  DOI: 
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • ANGEL ALFONSO CRUZ ROA, JUAN CARLOS CAICEDO, JUAN CARLOS CAICEDO RUEDA, FABIO GONZALEZ OSORIO, "Visual Pattern Analysis in Histopathology Images Using Bag of Features" . En: México 
    Lecture Notes In Computer Science  ISSN: 0302-9743  ed: Springer
    v.5856 fasc.1 p.521 - 528 ,2009,  DOI: 
  • Producción bibliográfica - Artículo - Corto (Resumen)
  • ANGEL ALFONSO CRUZ ROA, MARÌA LEONOR CALDAS MARTINEZ, LADYS SARMIENTO, GERZAIN RODRIGUEZ, "Cuantificación de melanocitos en la piel normal. Estudio en los bordes de resección de melanoma in situ de la cara y del carcinoma basocelular de la cara" . En: Colombia 
    Revista De La Asociación Colombiana De Ciencias Biológicas  ISSN: 0120-4173  ed: Asociacion Colombiana De Ciencias Biologicas
    v.19 fasc.1 p.188 - 188 ,2007,  DOI: 

    Softwares

  • Producción técnica - Softwares - Computacional
  • ANGEL ALFONSO CRUZ ROA, CARLOS ALFONSO MONTOYA CRUZ, MANUEL ANDRES CRUZ ROA, SpermLab - Software de análisis automático de calidad espermática, Nombre comercial: , contrato/registro: , . En: Colombia,  ,2013,  .plataforma: ,  .ambiente: ,

    Innovación de proceso o procedimiento

  • Producción técnica - Innovación de proceso o procedimiento
  • ANGEL ALFONSO CRUZ ROA, ANANT MADABHUSHI, FABIO GONZALEZ OSORIO, HAIBO WANG, Automatic detection of mitosis using handcrafted and convolutional neural network features, Nombre comercial: , contrato/registro: , . En: Estados Unidos,  ,2014, 
    Palabras:
    Histopatología, Patología Digital, Redes Neuronales Artificiales, procesamiento digital de imágenes, Identificacion Automatica,
    Areas:
    Ciencias Médicas y de la Salud -- Biotecnología en Salud -- Biotecnología Relacionada con la Salud, Ciencias Naturales -- Computación y Ciencias de la Información -- Ciencias de la Computación, Ingeniería y Tecnología -- Ingeniería Médica -- Tecnología Médica de Laboratorio (Análisis de Muestras, Tecnologías para el Diagnóstico),
    Sectores:
    Desarrollo de programas (software) y prestación de servicios en informática - Desarrollo de programas (software), Fabricación de equipos de instrumentación médico-hospitalarios, instrumentos de precisión y ópticos, equipos para automación industrial, cronómetros y relojes - Otro, Productos y procesos biotecnológicos - Productos y procesos biotecnológicos vinculados a la salud humana o de los animales,

    Proyectos

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Desarrollo Videojuego en modo hibrido Action/RPG & FPS utilizando herramientas software Opensource, aplicando técnicas avanzadas de Inteligencia Artificial
    Inicio: Octubre  2008 Fin proyectado: Abril  2009 Duración 6
    Resumen

    Elaboración de un videojuego hibrido Action/RPG & FPS con modo historia y multiplayer LAN/Online a través de las herramientas de software libre OGRE & Blender. Investigación y desarrollo de proyectos a corto plazo para el dominio de las herramientas software utilizadas en el desarrollo del videojuego. Investigación y pruebas de algoritmos de inteligencia artificial clásicos e híbridos del estado del arte de ciencias de computación aplicados a videojuegos FPS(First Personal Shooter) y RPG(Rol Player Game). Investigación sobre técnicas de texturizarían para los diferentes elementos de constituirán el videojuego, escenarios, personajes, ítems complementarios como arboles, casas, entre otros. Diseño conceptual y grafico del videojuego, incluye redacción del guion, bocetos de personajes, escenarios, secuencia de la historia, definición de la jugabilidad. diseño lógico del juego, que constituye toda la estructura de datos y jerarquía de clases de los distintos elementos del videojuego. implementación de la funcionalidad de red para ofrecer el modo multiplayer sobre redes de computadores LAN.

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Repositorio Histórico y Cultural Web de Información Multimedial de Villavicencio
    Inicio: Enero  2010 Fin proyectado: Julio  2010 Duración 6
    Resumen

    Villavicencio como capital de Departamento del Meta debe ser la ciudad que represente positivamente directa y abiertamente al Departamento en cualquier lugar del mundo. Por tal motivo se deben publicitar los eventos que permiten demostrar la gran riqueza cultural que tiene la ciudad, tales como festivales, torneos, ferias. Además se debe recordar y publicar los hechos más relevantes de la historia de la ciudad, en este caso, mediante contenido multimedial. Por tal razón, mediante el desarrollo de este proyecto se recopilará información multimedial histórica y cultural para luego permitir a la comunidad en general consultar de manera gratuita dicho material, lo cual permitirá reforzar la imagen de Villavicencio como ciudad de gran riqueza histórica y cultural.

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Anotación Automática de Imágenes Médicas a partir de una Representación Bolsa de Características
    Inicio: Noviembre  2008 Fin proyectado: Junio  2010 Duración 24
    Resumen


    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Sistema para la Recuperación por Contenido en un Banco de Imágenes Médicas
    Inicio: Enero  2008 Fin proyectado: Junio  2009 Fin: Junio  2009 Duración 18
    Resumen

    La aplicación que se ha desarrollado en el proyecto "Sistema para la Recuperación por Contenido en un Banco de Imágenes Médicas" ofrece acceso a una colección de 20,000 imágenes de histología para el estudio de los tejidos fundamentales. Debido al gran número de imágenes publicadas, el sistema ofrece diferentes herramientas de búsqueda, tanto por palabras clave como por el contenido visual de las imágenes. Cuando el usuario encuentra alguna imagen de su interés, puede solicitar al sistema que localice las imágenes más similares de acuerdo a criterios de similitud visual, como los colores, los bordes o las texturas. Esta herramienta será de gran utilidad en las facultades de medicina y biología de todas las universidades a nivel nacional, teniendo en cuenta que ofrece acceso a una gran colección de imágenes con ejemplos de diferentes tejidos Usualmente el material de referencia para el estudio de histología contiene un número reducido de imágenes para ilustrar ejemplos y estructuras particulares. Además, estas imágenes sólo se encuentran en libros y artículos científicos, y la búsqueda de imágenes en el material impreso puede tomar bastante tiempo porque se deben explorar varias páginas de diferentes fuentes manualmente. Existen algunas colecciones de imágenes histológicas publicadas en Internet que no superan las 100 o 200 ilustraciones. El acceso a una completa colección de cerca de 20.000 imágenes de histología como material de referencia es de gran importancia para la academia y la investigación en biología y medicina para el entrenamiento visual de los estudiantes de histología así como para el reconocimiento de distintas presentaciones de las estructuras de estos tejidos según el corte, el aumento y la tinción. La herramienta permite la libre exploración por parte de los usuarios buscando por conceptos textuales y apariencia visual.

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    SISTEMA DISTRIBUIDO DE ANOTACIÓN AUTOMÁTICA Y RECUPERACIÓN SEMÁNTICA DE IMÁGENES DE HISTOLOGÍA
    Inicio: Febrero  2010 Fin proyectado: Julio  2011 Duración 18
    Resumen

    En este proyecto se propone diseñar y desarrollar un sistema distribuido para la anotación automática de una gran colección de imágenes histológicas. Estas imágenes fueron capturadas en el desarrollo del proyecto ¿Sistema para la Recuperación por Contenido en un Banco de Imágenes Médicas¿ [24], cuyo propósito principal fue la adquisición y publicación de 20,000 imágenes de histología en la red RENATA. El acceso a estas imágenes se realiza mediante un sistema de búsqueda por contenido, desarrollado por el grupo de investigación Bioingenium de la Universidad Nacional (UNAL) que ya se encuentra en funcionamiento en http://informed.unal.edu.co/bimed/. Este sistema permite a los profesores, estudiantes y profesionales en el área de la salud explorar las imágenes de la colección haciendo búsquedas por características histológicas y detalles citológicos con una alta calidad de imagen; también, por similitud de colores, texturas y bordes, entre otros. Un subconjunto de 9000 imágenes fueron anotadas, de forma manual, por los expertos del Departamento de Biología (UNAL), Centro Internacional de Física (CIF) y del grupo de investigación Bioingenium (UNAL), quienes describieron los cuatro tejidos fundamentales de organismos, sistema digestivo, respiratorio y nervioso que allí se observan. Sin embargo, otra gran cantidad de ellas no cuenta con anotaciones textuales que expliquen en forma semántica el contenido de las imágenes y por lo tanto hacer búsquedas mediante palabras clave sólo es posible sobre el subconjunto para las cuales se hizo la descripción manual. El problema de investigación en este proyecto es el diseño de un modelo de anotación automática de imágenes histológicas, que permita completar las anotaciones que no se tienen en la colección y además permita generar anotaciones para otras nuevas imágenes que se continúan capturando. Los modelos encargados de hacer el procesamiento y análisis automático de las imágenes involucran algoritmos de alto costo computacional, más aún para colecciones con varios miles de imágenes. Por esta razón se propone diseñar e implementar un sistema distribuido, que permita repartir la carga computacional en varios procesadores simultáneamente, con la colaboración del laboratorio CETA - CIEMAT de España quienes cuentan con una infraestructura de computación en malla para procesamiento intensivo de datos. El intercambio de imágenes y datos procesados entre los laboratorios del CIF, UNAL, UNIVALLE y CIEMAT se llevará a cabo utilizando la red ENATA, la cual interconecta las instituciones académicas del país y cuenta con un enlace a través de RedCLARA para llegar hasta GEANT2 en Europa. Además, el propósito de este proyecto es mantener en funcionamiento y extender la funcionalidad el sistema que ya ha sido publicado en RENATA, para ofrecer acceso a las instituciones académicas en Colombia, Latinoamérica y el mundo, a la valiosa colección de imágenes de histología para el estudio de los tejidos fundamentales, que se complementará con los sistemas reproductor masculino y femenino, urinario, circulatorio y linfático.

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Sistema de telepatología como apoyo al flujo de trabajo de médicos patólogos para el diagnóstico, gradación y/o estadificación de cáncer a partir de láminas digitalizadas de histopatología
    Inicio: Febrero  2017 Fin: Diciembre  2017 Duración 
    Resumen

    Según la Organización Mundial de la Salud cada año se presentan 11 millones de casos nuevos de cáncer en el mundo, de los cuales el 80% son de países en vías de desarrollo como Colombia con una mortalidad del 70%. De hecho, 33.450 personas murieron en Colombia entre 2000 y 2006, lo cual es el 73% de los casos de cáncer. Muertes que podrían ser evitadas con una detección temprana del cáncer. En la región de la Orinoquía, la Unidad de Cáncer del Hospital Departamental de Villavicencio durante el periodo 2006-2008 fueron analizados 1.617 casos de cáncer de los cuales 95.7% eran invasivos y 68.7% residían en Villavicencio. El flujo de trabajo convencional de los médicos patólogos en la práctica clínica inicia con las preparaciones de láminas de vidrio con la muestra de tejido que han sido coloreadas con distintas tinciones para ser observadas y diagnosticadas en el microscopio. La severidad del cáncer se determina de acuerdo con el estado y grado de proliferación del tumor (i.e. estadificación y gradación) por medio de índices directos o indirectos asociados a características morfológicas, físicas o químicas de las células o tejidos. Debido a la incidencia de casos para análisis de patología y la escasez de patólogos, se requiere sistemas de telepatología para facilitar el acceso y mejorar los tiempos de respuesta, así como herramientas de análisis automático de las láminas para mejorar la precisión y reproducibilidad como apoyo al patólogo. Sin embargo, se presentan desafíos como el tamaño de las láminas de histopatología (40,000 x 40,000 pixeles y 20 GB) en donde la mayoría de métodos existentes han sido evaluado solo sobre regiones pequeñas o imágenes escaladas. El objetivo del proyecto es diseñar e implementar un prototipo de software basado en la Web de telepatología que soporte el almacenamiento, visualización y análisis automático de láminas digitalizadas de histopatología como apoyo al flujo de trabajo de los médicos patólogos para el diagnóstico, estadificación y/o gradación de cáncer en casos de la región de Villavicencio y zona de influencia, a partir de procesamiento de imágenes y computación inteligente. Para ello, se construirá un conjunto de datos de láminas digitalizadas de histopatología de casos de la región de Villavicencio y su zona de influencia con diagnóstico y anotación de regiones de interés por patólogos expertos para construir los conjuntos de datos de entrenamiento y validación. El sistema tendrá una arquitectura que soporte el almacenamiento y visualización de las láminas digitalizadas de histopatología usando tecnologías Cloud y Big Data. La caracterización y representación de las regiones de tejidos de las láminas de histopatología se extraerán una selección de características visuales del estado del arte que se usarán para entrenar modelos de aprendizaje computacional para el análisis automático. La fase final comprende la validación y evaluación del sistema de telepatología tanto cuantitativa como cualitativamente. Como resultados se espera una implementación en software en una aplicación Web del sistema de telepatología, un artículo de investigación sometido en una revista indexada y en un registro de software.

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Método de computación eficiente y preciso de muestreo adaptativo para el análisis automático de grandes láminas digitalizadas de histopatología basado en algoritmos genéticos y aprendizaje profundo como apoyo a la investigación y diagnóstico en cáncer
    Inicio: Septiembre  2015 Fin: Agosto  2016 Duración 
    Resumen

    Según la Organización Mundial de la Salud cada año se presentan 11 millones de casos nuevos de cáncer en el mundo, de los cuales el 80% son de países en vías de desarrollo como Colombia con una mortalidad del 70%. De hecho, 33.450 personas murieron en Colombia entre 2000 y 2006, lo cual es el 73% de los casos de cáncer. Muertes que podrían ser evitadas con una detección temprana del cáncer. Recientes avances de la tecnología han permitido previamente beneficiar a la población por medio de la Telemedicina. Sin embargo, solo en años recientes la especialidad de patología se ha podido ver beneficiada gracias al desarrollo de escáneres de láminas que permiten la digitalización completa de la muestra. De hecho, sistemas de apoyo al diagnóstico por computador han probado su utilidad en radiología y así como en imágenes de histopatología en lo que se conoce como Patología Digital. Avances que han llevado a una explosión de datos para investigación en cáncer que han resultado en proyectos a nivel mundial como The Cancer Genome Atlas (TCGA) para el análisis y mejoramiento del diagnóstico al recolectar información clínica, patológica y genética de más de 30 tipos de cáncer, 11,000 casos y 1,000 Terabytes de datos. Igualmente, métodos de aprendizaje computacional sobre grandes volúmenes de datos y las cada vez mayores capacidades en recursos computacionales a bajo costo para computación distribuida y de GPU, han permitido el impresionante resurgimiento de las redes neuronales, artificiales conocidas ahora como aprendizaje profundo (deep learning), con impresionantes resultados que han sobrepasado significativamente la mayoría de métodos existentes en las tareas complejas de visión por computador, reconocimiento de voz e incluso patología digital. Sin embargo, debido a la incidencia de casos para análisis de patología y la escasez de patólogos, el tiempo necesario para diagnosticar cada lámina de patología es aún lento para el diagnóstico temprano que mejoraría las probabilidades de supervivencia del paciente, y aprovechar mejor el tiempo del patólogo en los casos de difícil diagnóstico, mientras que el tiempo de respuesta se podría mejorar por medio de métodos computacionales. Sin embargo, se presentan desafíos como el tamaño de las láminas de histopatología (40,000 x 40,000 pixels y 20 GB) en donde la mayoría de métodos existentes han sido evaluado solo sobre regiones pequeñas o imágenes escaladas. Por lo tanto, se plantea el uso de métodos de deep learning para la clasificación de tejidos (cáncer o no), así como el uso un algoritmo genético para el muestreo eficiente y adaptativo en las láminas digitalizadas de histopatología para mejorar el tiempo de respuesta incluyendo computación paralela o distribuida . El objetivo del proyecto es el desarrollo de un método de computación eficiente y preciso que permita un muestreo adaptativo de grandes láminas digitalizadas de histopatología para el análisis automático de regiones de interés diagnóstico. Como resultados se espera una implementación en software un artículo de investigación en una revista indexada y en un registro de software.