Hoja de vida

Nombre Sebastián Isaza Ramírez
Nombre en citaciones ISAZA RAMÍREZ, SEBASTIÁN
Nacionalidad Colombiana
Sexo Masculino

Formación Académica

  •  
  • Postdoctorado/Estancia postdoctoral Erasmus Medical Centre
    Computational Neuroscience
    Octubrede2011 - Noviembrede 2012
  •  
  • Doctorado DELFT UNIVERSITY OF TECHNOLOGY
    PhD. in Computer Engineering
    Octubrede2006 - Octubrede 2011
    Multicore Architectures for Bioinformatics Applications
  •  
  • Maestría/Magister University of Lugano
    Master of Science in Embedded Systems Design
    Octubrede2004 - Noviembrede 2006
    Accelerating Embedded Applications through Instruction Set Extensions on a Virtex-4 FX Platform.
  •  
  • Pregrado/Universitario UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA
    Ingeniería Electrónica
    Juniode1998 - Agostode 2004
    Adaptación de los Protocolos TCP/IP para los Teléfonos Públicos de CELSA S.A.

    Experiencia profesional

  •  
  • Erasmus Medical Centre
    Dedicación: 40 horas Semanales Noviembre de 2012 Noviembre de 2013

  •  
  • UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA
    Dedicación: 40 horas Semanales Mayo de 2010 de Actual

  •  
  • UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA
    Dedicación: 6 horas Semanales Marzo de 2004 Octubre de 2004

  •  
  • CELSA S.A.
    Dedicación: 20 horas Semanales Marzo de 2003 Septiembre de 2004

    Áreas de actuación

  •  Ingeniería y Tecnología -- Ingenierías Eléctrica, Electrónica e Informática -- Hardware y Arquitectura de Computadores
  •  Ciencias Naturales -- Computación y Ciencias de la Información -- Ciencias de la Información y Bioinformática
  •  Ciencias Naturales -- Computación y Ciencias de la Información -- Ciencias de la Computación
  • Idiomas

      Habla Escribe Lee Entiende
  •  Italiano
  • Bueno Aceptable Bueno Bueno
  •  Inglés
  • Bueno Bueno Bueno Bueno
  •  Español
  • Bueno Bueno Bueno Bueno

    Líneas de investigación

  •  Computación de alto rendimiento para neurociencias, Activa:Si
  •  Computación paralela, Activa:Si
  •  Computación de alto rendimiento para bioinformática, Activa:Si
  •  Sistemas embebidos, Activa:Si
  •  
    Los ítems de producción con la marca corresponden a productos avalados y validados para la última Convocatoria Nacional para el Reconocimiento y Medición de Grupos de Investigación, Desarrollo Tecnológico o de Innovación y para el Reconocimiento de Investigadores del SNCTeI

    Trabajos dirigidos/tutorías

  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajo de grado de maestría o especialidad clínica
  • SEBASTIAN ISAZA RAMIREZ, Improving genomic data compression through parallel computing  UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA  Estado: Tesis concluida  Maestría en Ingeniería  ,2015,  . Persona orientada: Jaime Lotero  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • SEBASTIAN ISAZA RAMIREZ, Plataforma Web de Apoyo para Cursos de Programación en Ingeniería  UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA  Estado: Tesis concluida  Ingeniería Electrónica  ,2014,  . Persona orientada: Jhon Alejandro Ramírez Vélez  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Tesis de doctorado
  • SEBASTIAN ISAZA RAMIREZ, JOSE EDINSON AEDO COBO, Efficient Storage of Genomic Sequences in High Performance Computing Systems  UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA  Estado: Tesis concluida  Doctorado en Ingeniería Electrónica y de Computación  ,2014,  . Persona orientada: Aníbal Guerra  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajo de grado de maestría o especialidad clínica
  • CHRISTOS STRYDIS, SEBASTIAN ISAZA RAMIREZ, Towards High-level Sythesis of Neural Models on FPGA  DELFT UNIVERSITY OF TECHNOLOGY  Estado: Tesis concluida  MSc. in Computer Engineering  ,2011,  . Persona orientada: Zaid Al-Hilli  , Dirigió como: Coturor/asesor,  meses  
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajo de grado de maestría o especialidad clínica
  • GEORGI GAYDADJIEV, SEBASTIAN ISAZA RAMIREZ, Moving Critical Operations to Hardware Accelerators in Bioinformatics Applications  Karlsruhe Intitute of Technology  Estado: Tesis concluida  MSc. in Information and Communication Engineering  ,2008,  . Persona orientada: Uzma Batool  , Dirigió como: Coturor/asesor,  meses  
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajo de grado de maestría o especialidad clínica
  • GEORGI GAYDADJIEV, SEBASTIAN ISAZA RAMIREZ, Scalability of Bioinformatics Applications for Multicore Architectures  DELFT UNIVERSITY OF TECHNOLOGY  Estado: Tesis concluida  MSc. in Computer Engineering  ,2009,  . Persona orientada: Ernst Houtgast  , Dirigió como: Coturor/asesor,  meses  
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • SEBASTIAN ISAZA RAMIREZ, Paralelización de algoritmos de compresión de secuencias genómicas utilizando unidades de procesamiento gráfico gpu  UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA  Estado: Tesis concluida  Ingeniería Electrónica  ,2016,  . Persona orientada: José Fernando Vargas Rodríguez  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • SEBASTIAN ISAZA RAMIREZ, Paralelización aplicada a la indexación de secuencias genómicas  UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA  Estado: Tesis en curso  Ingeniería Electrónica  ,2018,  . Persona orientada: Juan David Quintero Gómez  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • SEBASTIAN ISAZA RAMIREZ, Implementation of a DNA compression algorithm using dataflow computing  UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA  Estado: Tesis concluida  Ingeniería Electrónica  ,2017,  . Persona orientada: Rubén David Caro Serna  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
  • Trabajos dirigidos/Tutorías - Trabajos de grado de pregrado
  • SEBASTIAN ISAZA RAMIREZ, Paralelización de un algoritmo de codificación para la compresión de archivos FASTQ  UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA  Estado: Tesis en curso  Ingeniería Electrónica  ,2018,  . Persona orientada: Juan Camilo Peña Vahos  , Dirigió como: Tutor principal,  meses  
     

    Par evaluador

    Ámbito: Nacional  Par evaluador de: Proyecto  Institución: INSTITUTO TECNOLÓGICO METROPOLITANO DE MEDELLÍN,  2013,  Diciembre  
    Ámbito: Nacional  Par evaluador de: Proyecto  Institución: INSTITUTO TECNOLÓGICO METROPOLITANO DE MEDELLÍN,  2013,  Enero  

    Eventos científicos

    1 Nombre del evento: Workshop on Circuits Systems and Signal Processing - ProRISC  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Internacional  Realizado el:2008-11-27 00:00:00.0,  2008-11-28 00:00:00.0   en Veldhoven   -  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Bioinformatics Specific Cell BE ISA Extensions Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Stichting voor de Technische Wetenschappen Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: SEBASTIAN ISAZA RAMIREZ Rol en el evento: Ponente
    2 Nombre del evento: Congreso Colombiano de Biología Computacional y Bioinformática  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Nacional  Realizado el:2015-09-16 00:00:00.0,  2015-09-18 00:00:00.0   en MEDELLÍN   - Universidad de Antioquia  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Herramientas de compresión de propósito general y específico aplicadas a secuencias genómicas Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Ponencia
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: SEBASTIAN ISAZA RAMIREZ Rol en el evento: Ponente
    3 Nombre del evento: 10th International Symposium on Reconfigurable Computing: Architectures, Tools, and Applications - ARC  Tipo de evento: Simposio  Ámbito: Nacional  Realizado el:2014-04-14 00:00:00.0,  2014-04-16 00:00:00.0   en Vilamoura   -  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:DeSyRe: On-Demand Adaptive and Reconfigurable Fault-Tolerant SoCs Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Universidade Do Porto Tipo de vinculaciónGestionadora
    Participantes
    • Nombre: SEBASTIAN ISAZA RAMIREZ Rol en el evento: Ponente
    4 Nombre del evento: ACM International Conference on Computing Frontiers  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Internacional  Realizado el:2011-05-03 00:00:00.0,  2013-12-05 00:00:00.0   en Ischia   -  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Parametrizing Multicore Architectures for Multiple Sequence Alignment Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Association For Computing Machinery Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: SEBASTIAN ISAZA RAMIREZ Rol en el evento: Ponente
    5 Nombre del evento: 8TH International Workshop on Architectures Modeling and Simulation - SAMOS  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Internacional  Realizado el:2008-07-21 00:00:00.0,  2008-07-24 00:00:00.0   en Samos   -  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Preliminary Analysis of Cell BE Processor Limitations for Sequence Alignment Applications Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Institute Of Electrical And Electronics Engineers-Ieee Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: SEBASTIAN ISAZA RAMIREZ Rol en el evento: Ponente
    6 Nombre del evento: IEEE International Workshop on Multicore Computing Systems - MuCoCoS  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Internacional  Realizado el:2011-07-04 00:00:00.0,  2011-07-06 00:00:00.0   en Seúl   -  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Scaling HMMER Performance on Multicore Architectures Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Institute Of Electrical And Electronics Engineers-Ieee Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: SEBASTIAN ISAZA RAMIREZ Rol en el evento: Ponente
    7 Nombre del evento: 14TH IEEE Euromicro Conference on Digital System Design - DSD  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Internacional  Realizado el:2011-09-05 00:00:00.0,  2011-09-07 00:00:00.0   en Oulu   -  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:HMMER Performance Model for Multicore Architectures Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Institute Of Electrical And Electronics Engineers-Ieee Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: SEBASTIAN ISAZA RAMIREZ Rol en el evento: Ponente
    8 Nombre del evento: IEEE International Workshop on Multicore Computing Systems - MuCoCoS  Tipo de evento: Otro  Ámbito: Internacional  Realizado el:2009-02-15 00:00:00.0,  2009-02-15 00:00:00.0   en Cracovia   -  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Scalability Analysis of Progressive Alignment on a Multicore Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Institute Of Electrical And Electronics Engineers-Ieee Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: SEBASTIAN ISAZA RAMIREZ Rol en el evento: Ponente
    9 Nombre del evento: 22nd ACM/SIGDA International Symposium on Field-Programmable Gate Arrays  Tipo de evento: Simposio  Ámbito: Internacional  Realizado el:2014-02-26 00:00:00.0,  2014-02-28 00:00:00.0   en Monterey   -  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:FPGA-based Biophysically-Meaningful Modeling of Olivocerebellar Neurons Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Association For Computing Machinery Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: SEBASTIAN ISAZA RAMIREZ Rol en el evento: Ponente
    10 Nombre del evento: ACACES Workshop  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Internacional  Realizado el:2008-07-13 00:00:00.0,  2008-07-26 00:00:00.0   en L'Aquila   -  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:Limitations of Current Multicore Architectures for Bioinformatic Applications - A Case Study on the Cell BE Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Resumen
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:European Comission-Dg Research Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: SEBASTIAN ISAZA RAMIREZ Rol en el evento: Ponente
    11 Nombre del evento: IEEE Colombian Conference on Communications and Computing  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Nacional  Realizado el:2018-05-16 00:00:00.0,  2018-05-18 00:00:00.0   en MEDELLÍN   -  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:UdeAlignC: Fast Alignment for the Compression of DNA Reads Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Completo
    • Nombre del producto:UdeAlignC: Fast Alignment for the Compression of DNA Reads Tipo de producto:Producción técnica - Presentación de trabajo - Ponencia
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA Tipo de vinculaciónGestionadora
    Participantes
    • Nombre: SEBASTIAN ISAZA RAMIREZ Rol en el evento: Ponente

    Artículos

  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • IOANNIS SOURDIS, CHRISTOS STRYDIS, ANTONINO ARMATO, CHRISTOS BOUGANIS, BABAK FALSAFI, GEORGI GAYDADJIEV, SEBASTIAN ISAZA RAMIREZ, ALIRAD MALEK, RICARDO MARIANI, DIONISIOS PNEVMATIKATOS, DHIRAJ PRADHAN, GERARD RAUWERDA, ROBERT SEEPERS, RISHAD SHAFIK, KIM SUNESEN, DIMITRIS THEODOROPOULOS, STAVROS TZILIS, MICHAIL VAVOURAS, "DeSyRe: On-demand system reliability" . En: Países Bajos 
    Microprocessors and Microsystems  ISSN: 0141-9331  ed: Elsevier Science Bv
    v.37 fasc.8 p.981 - 1001 ,2013,  DOI: http://dx.doi.org/10.1016/j.micpro.2013.08.008
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • ALEX RAMIREZ, FELIPE CABARCAS, BEN JUURLINK, MAURICIO ALVAREZ, FRIMAN SANCHEZ, ARNALDO AZEVEDO, COR MEENDERINCK, CATALIN CIOBANU, SEBASTIAN ISAZA RAMIREZ, GEORGI GAYDADJIEV, "The SARC Architecture" . En: Estados Unidos 
    IEEE Micro  ISSN: 0272-1732  ed: IEEE Computer Society Press
    v.30 fasc.5 p.16 - 29 ,2010,  DOI: http://dx.doi.org/10.1109/MM.2010.79
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • ANIBAL JOSE GUERRA SOLER, JAIME ANDRES LOTERO GARCIA, SEBASTIAN ISAZA RAMIREZ, "Performance comparison of sequential and parallel compression applications for DNA raw data" . En: Estados Unidos 
    Journal of Supercomputing  ISSN: 0920-8542  ed: Springer Netherlands
    v.72 fasc.12 p.4696 - 4717 ,2016,  DOI: 10.1007/s11227-016-1753-4
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • ANIBAL JOSE GUERRA SOLER, JAIME ANDRES LOTERO GARCIA, JOSE EDINSON AEDO COBO, SEBASTIAN ISAZA RAMIREZ, "Tackling the challenges of FASTQ referential compression" . En:  
    Bioinformatics and Biology Insights  ISSN: 1177-9322  ed: Libertas Academica
    v.13 fasc.N/A p.1 - 19 ,2019,  DOI: 10.1177/117793221882137

    Proyectos

    Tipo de proyecto: Extensión y responsabilidad social CTI 
    FORTALECIMIENTO DEL CONTROL DERIVADO DE LA DELEGACIÓN MINERA EN CABEZA DE LA GOBERNACIÓN DE ANTIOQUIA...
    Inicio: Noviembre  2017 Fin: Septiembre  2018 Duración 
    Resumen


    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Ecosistema de datos para Medellín: plataforma tecnológica
    Inicio: Noviembre  2017 Fin: Diciembre  2017 Duración 
    Resumen

    En este proyecto se desarrolló un piloto metodológico y tecnológico de una plataforma de datos para la ciudad de Medellín. Se hicieron talleres con diferentes actores de la ciudad para recoger insumos que permitan construir una plataforma de datos y aplicaciones que contribuyan a la solución de problemas de la ciudad. Finalmente, se implementó una plataforma de prueba como demostración de algunas aplicaciones de ciudad.

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Evaluación de técnicas de compresión y almacenamiento eficiente de información genética
    Inicio: Septiembre  2015 Fin: Septiembre  2017 Duración 
    Resumen


    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    SARC: Scalable Computer Architectures
    Inicio: Octubre  2006 Fin: Marzo  2011 Duración 
    Resumen


    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    DeSyRe: on-Demand System Reliability
    Inicio: Octubre  2011 Fin: Octubre  2014 Duración 
    Resumen