Hoja de vida

Nombre Ivan Fernando Calixto Botia
Nombre en citaciones CALIXTO-BOTIA, I.
Nacionalidad Colombiana
Sexo Masculino

Formación Académica

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  • Doctorado UNIVERSIDAD DE LOS ANDES
    Biologia
    Enerode2011 - Marzode 2019
    Testing Ecological Speciation in the Caribbean Octocoral Complex Antillogorgia bipinnata-kallos (Cnidaria: Octocorallia): An Integrative Approach
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  • Maestría/Magister UNIVERSIDAD DE LOS ANDES
    Ciencias Biologicas
    Enerode2011 - Octubrede 2014
    A case of modular phenotypic plasticity in the depth gradient for the gorgonian coral Antillogorgia bipinnata (Cnidaria: Octocorallia)
  •  
  • Pregrado/Universitario Universidad Pedagógica Y Tecnológica De Colombia - Uptc - Sede Tunja
    BIOLOGÍA
    Febrerode2002 - Septiembrede 2008
    Evaluación de polimorfismos mediante marcadores COSII de una población de Solanum phureja segregante para resistencia a Phytophthora infestans
  •  
  • Secundario INEM CARLOS ARTURO TORRES PENA

    Febrerode1996 - Noviembrede 2001

    Formación Complementaria

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  • Cursos de corta duración Instituto Smithsonian De Investigaciones Tropicales
    genetica de la conservación
    Enerode2012 - Febrerode 2012
  •  
  • Cursos de corta duración Justus Liebig Universität Giessen
    Marine Biology
    Abrilde2013 - Mayode 2013
  •  
  • Cursos de corta duración Centro de Excelencia en Ciencias Marinas
    CEMarin courses 2012-10
    Febrerode2012 - Juliode 2012
  •  
  • Cursos de corta duración Hawai'i Institute of Marine Biology
    Genomics
    Juniode2013 - Agostode 2013
  •  
  • Cursos de corta duración Graduate Research School in Genomic Ecology
    Genomic Ecology
    Octubrede2012 - Octubrede 2012
  •  
  • Extensión SERVICIO NACIONAL DE APRENDIZAJE SENA
    Tecnicas en Cultivos Vegetales
    Enerode2002 - de 2003

    Experiencia profesional

  •  
  • UNIVERSIDAD PEDAGÓGICA Y TECNOLÓGICA DE COLOMBIA UPTC
    Dedicación: 7 horas Semanales Abril de 2019 Julio de 2019

  •  
  • UNIVERSIDAD DE LOS ANDES
    Dedicación: 24 horas Semanales Enero de 2011 Enero de 2012

    Actividades de docencia
    -   Pregrado - Nombre del curso:  (1)Biologia celular. (2) Ecologia general, 25 Enero 2011 Diciembre 2011
  •  
  • Instituto Smithsonian De Investigaciones Tropicales
    Dedicación: 35 horas Semanales Agosto de 2010 Diciembre de 2010

    Actividades de investigación
    -   Pasantías - Titulo:  Estancia corta. Reproductive isolation in Porcelain crabs - Ortologous genes to Phylogenetic analysis in Porcelanid crabs - Ortologous genes to Phylogenetic analysis in Sea urchins Agosto 2010 Diciembre 2010
  •  
  • FEDERACIÓN NACIONAL DE CAFETEROS DE COLOMBIA - CENTRO NACIONAL DE INVESTIGACIONES DE CAFÉ (CENICAFÉ)
    Dedicación: 40 horas Semanales Agosto de 2009 Junio de 2010

    Actividades de investigación
    -   Pasantías - Titulo:  Characterization of genes involved in Coffea arabica flowering: cDNA walking/cloning, Agosto 2009 Junio 2010
  •  
  • CORPORACIÓN CENTRO DE INVESTIGACIÓN EN PALMA DE ACEITE
    Dedicación: 40 horas Semanales Marzo de 2009 Abril de 2009

    Actividades de investigación
    -   Investigación y Desarrollo - Titulo:  Taq polimerase extraction by transformed strains of Escherichia coli for PCR´s procedures. Marzo 2009 Abril 2009
  •  
  • Corporación Colombiana De Investigación Agropecuaria - AGROSAVIA
    Dedicación: 40 horas Semanales Octubre de 2008 Diciembre de 2008

    Actividades de investigación
    -   Investigación y Desarrollo - Titulo:  (1)Taq polimerase extraction by transformed strains of Escherichia coli. (2) InDels and SNPs polimorfims evaluation on Solanum DNA sequences Octubre 2008 Diciembre 2008
  •  
  • Corporación Colombiana De Investigación Agropecuaria - AGROSAVIA
    Dedicación: 40 horas Semanales Enero de 2007 Abril de 2008

    Actividades de investigación
    -   Pasantías - Titulo:  COSII polimorfism evaluation on Solanum phureja population for genetic mapping Enero 2007 Marzo 2008

    Áreas de actuación

  •  Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Genética y Herencia
  •  Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Biología (Teórica, Matemática, Criobiología, Evolutiva)
  •  Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Bioquímica y Biología Molecular
  •  Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Ecología
  • Idiomas

      Habla Escribe Lee Entiende
  •  Inglés
  • Bueno Bueno Bueno Bueno
  •  Español
  • Bueno Bueno Bueno Bueno

    Líneas de investigación

  •  Genetica molecular vegetal, Activa:No
  •  Genómica y Genética evolutiva, Activa:Si
  • Reconocimientos

  • Ph.D. Scholarship. Colciencias-­‐,Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación, Colciencias - Enerode 2012
  • Meritorious Thesis,Universidad Pedagógica Y Tecnológica De Colombia - Uptc - Sede Tunja - Septiembrede 2008
  • Asisitencia Graduada,UNIVERSIDAD DE LOS ANDES - Enerode 2011
  • Asistencia graduada,UNIVERSIDAD DE LOS ANDES - Agostode 2011
  •  
    Los ítems de producción con la marca corresponden a productos avalados y validados para la última Convocatoria Nacional para el Reconocimiento y Medición de Grupos de Investigación, Desarrollo Tecnológico o de Innovación y para el Reconocimiento de Investigadores del SNCTeI
     

    Eventos científicos

    1 Nombre del evento: Encuentro Nacional de Semilleros de Investigación  Tipo de evento: Encuentro  Ámbito: Nacional  Realizado el:2004-01-01 00:00:00.0,    en CARTAGENA DE INDIAS   - Universidad San Buenaventura  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:REDCOLSI NODO BOLIVAR Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: IVAN FERNANDO CALIXTO BOTIA Rol en el evento: Organizador
    2 Nombre del evento: VI CONGRESO NACIONAL Y III CONGRESO INTERNACIONAL DE GENÉTICA  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Nacional  Realizado el:2004-01-01 00:00:00.0,    en BARRANQUILLA   - Universidad del Norte  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:ASOCIACION COLOMBIANA DE GENETICA HUMANA Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: IVAN FERNANDO CALIXTO BOTIA Rol en el evento: Organizador
    3 Nombre del evento: IV International Congress and VII Colombian Congress of Genetics   Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Nacional  Realizado el:2006-01-01 00:00:00.0,    en BUCARAMANGA   - Universidad Industrial de Santander -UIS-  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:ASOCIACION COLOMBIANA DE GENETICA HUMANA Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: IVAN FERNANDO CALIXTO BOTIA Rol en el evento: Organizador
    4 Nombre del evento: XLIII National Congress of Biological Sciences  Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Nacional  Realizado el:2008-01-01 00:00:00.0,    en YOPAL   - UNIVERSIDAD DEL TRÓPICO  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Asociación Colombiana De Ciencias Biológicas - A.C.C.B. Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: IVAN FERNANDO CALIXTO BOTIA Rol en el evento: Organizador
    5 Nombre del evento: American Evolution Meeting-Oklahoma   Tipo de evento: Congreso  Ámbito: Internacional  Realizado el:2011-01-01 00:00:00.0,    en OKLAHOMA   - Oklahoma University  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Society for the Study of Evolution Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: IVAN FERNANDO CALIXTO BOTIA Rol en el evento: Organizador
    6 Nombre del evento: XLIII Congreso Nacional de Ciencias Biológicas  Tipo de evento: Congreso  Ámbito:   Realizado el:2008-10-01 00:00:00.0,    en YOPAL   -  
    Productos asociados
    • Nombre del producto:A Solanum phureja POPULATION SEGREGATING FOR RESISTANCE TO Phytophthora infestans Tipo de producto:Producción bibliográfica - Trabajos en eventos (Capítulos de memoria) - Resumen
    Participantes
    • Nombre: IVAN FERNANDO CALIXTO BOTIA Rol en el evento: Asistente
    7 Nombre del evento: I Genetic seminar   Tipo de evento: Seminario  Ámbito: Nacional  Realizado el:2003-01-01 00:00:00.0,    en TUNJA   - Universidad Pedagógica yTecnológica de Colombia  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Universidad Pedagógica Y Tecnológica De Colombia - Uptc - Sede Tunja Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: IVAN FERNANDO CALIXTO BOTIA Rol en el evento: Organizador
    8 Nombre del evento: Online guide to South Florida Shallow-water Octocorals  Tipo de evento: Taller  Ámbito: Internacional  Realizado el:2011-01-01 00:00:00.0,    en miami florida   - Nova Southeastern University Oceanographic Center  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Noaa Fisheries Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: IVAN FERNANDO CALIXTO BOTIA Rol en el evento: Organizador
    9 Nombre del evento: online guide for florida octocorals  Tipo de evento: Taller  Ámbito: Internacional  Realizado el:,    en BOGOTÁ, D.C.   -  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Noaa Fisheries Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: IVAN FERNANDO CALIXTO BOTIA Rol en el evento: Organizador
    10 Nombre del evento: Celebración 10 años de la Escuela de Biología de la UPTC  Tipo de evento: Seminario  Ámbito: Nacional  Realizado el:2005-01-01 00:00:00.0,    en TUNJA   - UPTC-Tunja  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución: Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: IVAN FERNANDO CALIXTO BOTIA Rol en el evento: Organizador
    11 Nombre del evento: Capacitación procesos de Desarrollo e investigaciones del Centro Nacional de Investigaciones en Cafe -CENICAFE-  Tipo de evento: Otro  Ámbito: Nacional  Realizado el:2004-01-01 00:00:00.0,    en CHINCHINÁ   - Instalaciones de CENICAFE  
    Participantes
    • Nombre: IVAN FERNANDO CALIXTO BOTIA Rol en el evento: Organizador
    12 Nombre del evento: Citogenetic technicals update  Tipo de evento: Otro  Ámbito: Nacional  Realizado el:2005-01-01 00:00:00.0,    en MEDELLÍN   - Universidad de Antioquia  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: IVAN FERNANDO CALIXTO BOTIA Rol en el evento: Organizador
    13 Nombre del evento: Encuentro Regional de Semilleros de Investigación  Tipo de evento: Encuentro  Ámbito: Nacional  Realizado el:2004-01-01 00:00:00.0,    en DUITAMA   - UPTC  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:UNIVERSIDAD PEDAGÓGICA Y TECNOLÓGICA DE COLOMBIA Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: IVAN FERNANDO CALIXTO BOTIA Rol en el evento: Organizador
    14 Nombre del evento: "Genética: ¿ Un paso hacia el futuro ó hacia donde?  Tipo de evento: Seminario  Ámbito: Nacional  Realizado el:2003-01-01 00:00:00.0,    en BOGOTÁ, D.C.   - Universidad Distrital Francisco José de Caldas -sede Macarena A-  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:Asociación Nacional De Estudiantes De Ciencias Biológicas Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: IVAN FERNANDO CALIXTO BOTIA Rol en el evento: Organizador
    15 Nombre del evento: Debate abierto: la Evolución en las ciencias de la vida  Tipo de evento: Otro  Ámbito: Nacional  Realizado el:2005-01-01 00:00:00.0,    en BOGOTÁ, D.C.   - Universidad Nacional de Colombia  
    Instituciones asociadas
    • Nombre de la institución:UNIVERSIDAD NACIONAL DE COLOMBIA Tipo de vinculaciónPatrocinadora
    Participantes
    • Nombre: IVAN FERNANDO CALIXTO BOTIA Rol en el evento: Organizador

    Artículos

  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • IVAN FERNANDO CALIXTO BOTIA, JUAN SANCHEZ, "A case of modular phenotypic plasticity in the depth gradient for the gorgonian coral Antillogorgia bipinnata (Cnidaria: Octocorallia)" . En:  
    BMC Evolutionary Biology  ISSN: 1471-2148  ed: BioMed Central Ltd.
    v.17 fasc.55 p.1 - 8 ,2017,  DOI: 10.1186/s12862-017-0900-8
  • Producción bibliográfica - Artículo - Publicado en revista especializada
  • IVAN FERNANDO CALIXTO BOTIA, "Universal target-enrichment baits for anthozoan (Cnidaria) phylogenomics: New approaches to long-standing problems" . En:  
    Molecular Ecology Resources  ISSN: 1755-0998  ed: Asociacion Mexicana De Microbiologia And International Society For Microbial Ecology
    v.18 fasc.NA p.281 - 295 ,2018,  DOI: 10.1111/1755-0998.12736

    Capitulos de libro

  • Tipo: Capítulo de libro
    IVAN FERNANDO CALIXTO BOTIA, "Gorgonian Corals" Mesophotic Coral Ecosystems. Coral Reefs of the World. . En: Suiza  ISBN: 978-3-319-92734-3  ed: Springer Publishing Company, Inc. , v. , p.729 - 747  12 ,2019
  • Textos en publicaciones no científicas

  • Producción bibliográfica - Otro artículo publicado - Revista de divulgación
  • CATALINA RAMIREZ, FABIO CASAS, ADRIANA SARMIENTO, MARCELA VILLEGAS, ANGELA DELGADO, NATALIA JIMENEZ, DAMIAN PARDO, IVAN FERNANDO CALIXTO BOTIA, SUSANA SIMANCAS, JUAN SANCHEZ, "En busca de los colores ocultos del arrecife" En: Colombia. 2013. Hipotesis. Apuntes Cientificos Uniandinos (Online). ISSN: 1794-354X p.60 - 65 v.14
    Palabras:
    Coral, Fotoprotección, Bioluminiscencia,
    Areas:
    Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Biología Marina y del Agua,

    Demás trabajos

  • Demás trabajos - Demás trabajos
  • IVAN FERNANDO CALIXTO BOTIA, impulsor de procesos investigativos en genetica . En: Colombia,  ,2004,  finalidad: conceptualizar y divulgar el area de la genetica en jovenes investigadores 
    Areas:
    Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Genética y Herencia,
  • Demás trabajos - Demás trabajos
  • IVAN FERNANDO CALIXTO BOTIA, D. M. ARIAS, C. E. NUSTEZ, LUZ STELLA BARRERO MENESES, Genbank-GSS Accession Numbers GS901561- GS901814. 254 DNA sequences. Conserved Orthologous Set -COSII- in two Solanum phureja individuals. . En: Estados Unidos,  ,2010,  finalidad: Acceso libre a secuencias de ADN de genes ortólogos tipo COSII en Solanaceas  
    Areas:
    Ciencias Naturales -- Ciencias Biológicas -- Genética y Herencia,

    Proyectos

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    GENÓMICA DE LA FLORACIÓN
    Inicio: Agosto  2009 Fin proyectado: Junio  2010 Fin: Junio  2010 Duración 11
    Resumen


    Tipo de proyecto: Investigación, desarrollo e Innovación 
    IDENTIFICACION DE LAS CARACTERISTICAS BIOFISICOQUIMICAS, MOLECULARES Y MORFOLOGICAS DE A. SUBULATA, O. DILLENII Y O.FICUS-INDICA (CACTACEAE), NATIVAS DE BOYACA, PARA EL DESARROLLO DE ALTERNATIVAS DE APROVECHAMIENTO TECNOLOGICO SGI 2480
    Inicio: Mayo  2019 Duración 
    Resumen


    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Pacifigorgia irene Genomics
    Inicio: Abril  2012 Duración 
    Resumen

    Massive mortalities of the octocoral Pacifigorgia sp. can rapidly lead to a loss of biodiversity in the TEP reefs. In order to understand the effect of the fungi on the octocoral and to try to find a way to reduce this effect, more knowledge of Pacifigorgia sp. immune response and growth is needed. This is where technologies such as next generation sequencing (NGS), through a whole genome sequence project, allow the discovery of candidate genes for immune/stress response and growth/branching. A genome sequencing by a HiSeq2000 Illumina was done in Pacifigorgia irene. We did a metagenomic analysis and assembly of reads and we look for an annotation and final draft as the first octocoral genome sequenced.

    Tipo de proyecto: Investigación y desarrollo 
    Genomica evolutiva en una especie coralina del Caribe
    Inicio: Enero  2011 Fin proyectado: Enero  2015 Fin: Enero  Duración 48
    Resumen

    Ecological speciation is understood as a set of plausible theoretical scenarios, in which the process of divergence and generation of new species are ultimately due to differentiated ecological pressures, where selection directly favors the evolution of reproductive isolation. The present thesis aims to identify the ecologic speciation process and propose as a research model the coral species Antillogorgia (=Pseudopterogorgia) bipinnata (Verrill) (Octocorallia: Gorgoniidae) which, together other groups of Caribbean gorgonian corals with broad environmental status and sympatric distribution ranges, has been considered a case of marked phenotypic plasticity in an incipient ecological speciation process. A. bipinnata shown a bathymetric distribution from approximately 1 to 45m in Caribbean locations of Panama, Belize, Bahamas, and Colombia. It exhibits different traits of coloration and branching, which let differentiate three basic morphotypes, the ¿depth morphotype¿, ¿typical morphotype¿ and ¿bushy morphotype¿ or ¿kallos¿. The clade A. bipinnata-kallos follows a phylogeographic pattern using mtDNA and ITS2 [9], where the morphotypes are polyphyletic. My thesis project seeks to carry out a genomic perspective of incipient ecological speciation in an integrated way to A. bipinnata (=kallos). In this scenario, I will test the phenotypic plasticity role in the morphological variation related to the environment heterogeneity. This is conducted by a reciprocal transplants experiments, which has the power to define the degree of genetic or plasticity component in the specific traits evaluated. Following, a test of selection signatures will be done. To get a high resolution of markers homogeneously around the genome, we will use a coupled-massive sequencing technique for screening. At the same time we expect to sequence with a good level of depth, assemble and annotate the A. bipinnata genome. Screening and genome sequencing are two phases articulated in an strategy to recognize the genes under positive selection. This information can let us to detect divergent regions in the genome between morphotypes and differentiate genomic island and continents. Once recognized the signals of selection and divergent regions, the final goal is to identify the functional background of adaptation. The annotation of a transcriptome sequencing plus the genomic annotation will be coupled to putatively identify the genes involved in the genomic landscape of adaptation. With all this framework, we will be able to identify and characterize the genes involved in the incipient ecological adaptations, being a powerful tool in the understanding of ecological speciation and its impact on patterns of coral diversification in general. Thus, this project will provide important evidence to the theory of speciation due it is evaluating a mechanism where the species can arise without geographic barriers and in turn it is deepening in the role of plasticity and environmental gradients as selection key players in general and reef systems in particular.